建立配对队列并评估POD
明确POD组和非POD组的临床可比性
招募317名择期体外循环心脏手术患者,术后前7天使用CAM-ICU每日两次评估谵妄,30名POD患者与30名非POD对照按年龄、性别和主要诊断进行1:1匹配。
Preoperative gut microbial network alterations and BCAA-Related metabolic disturbance in postoperative delirium after cardiac surgery: a prospective matched multi-omic study
包含前瞻性配对队列、粪便宏基因组测序和血清非靶向代谢组学,并进行了微生物网络、差异丰度、通路富集及整合分析,属于多个独立证据层级。
心脏手术患者配对队列 术前及术后粪便样本 围手术期血清样本
队列匹配条件:年龄、性别、主要诊断 粪便样本采集时间:入院后第一次排便且预防性抗生素使用前,术后第一次排便 血清采集时间:术前第二日晨空腹、术后第1天 分组样本量:每组30例 POD评估:CAM-ICU术后前7天每日两次
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确POD组和非POD组的临床可比性
招募317名择期体外循环心脏手术患者,术后前7天使用CAM-ICU每日两次评估谵妄,30名POD患者与30名非POD对照按年龄、性别和主要诊断进行1:1匹配。
分析肠道微生物组成及功能差异
收集配对粪便样本,提取DNA后进行鸟枪法宏基因组测序,进行物种分类和功能注释。
鉴定POD相关血清代谢物及其通路变化
采集术前和术后血清,进行UHPLC-HRMS非靶向代谢组学分析。
比较组间差异并探索微生物-代谢物关联
计算α和β多样性,进行LEfSe分析,构建共现网络,进行代谢物差异分析,进行Spearman相关分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| DNA提取 | OMEGA Mag-Bind土壤DNA提取试剂盒 | Omega Bio-Tek | -- |
| DNA定量 | Qubit 4荧光计 | -- | -- |
| 测序文库制备 | Illumina TruSeq Nano DNA LT文库制备试剂盒 | Illumina | -- |
| 宏基因组测序 | Illumina NovaSeq 2000测序平台 | Illumina | -- |
| 血清代谢组学 | Q Exactive HF-X质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者纳入与匹配 | 年龄、性别、主要诊断匹配;排除标准如近期抗生素或益生菌使用、谵妄史、痴呆、认知障碍等 阅读提示:Methods: Study design, patient selection, and POD assessment |
| 粪便样本采集和测序 | 术前样本在入院后第一次排便且预防性抗生素使用前,术后样本在第一次术后排便;DNA提取试剂盒、测序平台 阅读提示:Methods: Biospecimen collection; Shotgun metagenomic sequencing |
| 血清样本采集和代谢组学 | 术前第2日晨空腹,术后第1天;UHPLC-HRMS仪器参数、代谢物注释数据库 阅读提示:Methods: Untargeted serum metabolomics |
| POD评估 | CAM-ICU评估频率(每日两次)、RASS评分标准、已接受培训的评估人员 阅读提示:Methods: Study design, patient selection, and POD assessment |
| 数据分析 | LEfSe阈值(P<0.05, LDA>2.0)、网络构建参数(|r|>0.6, P<0.05, FastSpar)、代谢物筛选标准(交叉分析) 阅读提示:Methods: Statistical and integrative analyses |