制备三种动物的精密切割肠切片并评估活力
建立猪、犬、鸡的离体肠道模型并确认其可培养性
从猪、犬、鸡获取新鲜肠道组织,制备PCIS,培养24小时后通过ATP/蛋白比评估活力,并用HE染色和免疫荧光确认组织结构和细胞类型。
Norovirus inter-species transmission in an ex vivo model is dependent on virus internalization capacity
包含体外VLP结合与内化实验、活组织感染实验、α1,2-岩藻糖阻断、胆汁盐处理及RT-qPCR和免疫荧光验证,证据层级多元。
猪精密切割肠切片 犬精密切割肠切片 鸡精密切割肠切片 人十二指肠腺癌细胞系HuTu80
VLP结合与内化实验中VLP种类、浓度和孵育时间 UEA1阻断浓度及对VLP附着和内化的影响 胆汁盐TLCA和GCDCA处理浓度 感染实验中病毒接种量(基因组拷贝数)和孵育时间 RT-qPCR检测用的引物探针及反应条件
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立猪、犬、鸡的离体肠道模型并确认其可培养性
从猪、犬、鸡获取新鲜肠道组织,制备PCIS,培养24小时后通过ATP/蛋白比评估活力,并用HE染色和免疫荧光确认组织结构和细胞类型。
评估不同来源诺如病毒VLP与动物肠道组织的结合能力
使用AF488标记的VLP(HuNoV GII.4 Dijon, PoNoV GII.11, CaNoV GVI.2)与FFPE PCIS孵育,通过病毒组织化学染色检测结合,并用UEA1染色确定分泌状态。
量化不同诺如病毒VLP在活PCIS中的附着和内化效率
将AF488标记的VLP与活PCIS在4°C结合后升温至37°C使内化,用抗体区分内外VLP,通过共聚焦显微镜定量。
评估动物诺如病毒是否能在人肠道细胞中有效进入
使用人十二指肠细胞系HuTu80,将不同VLP(HuNoV GII.4 Dijon, GII.4 Sydney, GII.3, PoNoV, CaNoV)进行附着和内化实验。
探究HBGA在VLP附着和内化中的作用
用UEA1(0.1-100 µM)预处理固定或活PCIS,然后检测VLP附着和内化的变化,并用生物素化UEA1确认阻断效率。
评估胆汁盐是否影响人肠道细胞和动物PCIS中的VLP附着和内化
将VLP与胆汁盐(TLCA或GCDCA)预孵育后,进行附着和内化实验,同时评估胆汁盐对细胞和PCIS的毒性。
验证人诺如病毒在猪肠道组织中是否能复制
将人诺如病毒GII.4 Sydney[P16]或TGEV接种猪PCIS,24小时后通过RT-qPCR检测基因组拷贝数变化,并通过免疫荧光检测病毒蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Sigma-Aldrich | -- |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| HEPES | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 胎牛血清 | Capricorn Scientific | -- | |
| PCIS制备 | ROTI®Cell Hanks'平衡盐溶液(含镁和钙) | Carl ROTH | -- |
| 低熔点琼脂糖 | GERBU | -- | |
| RPMI培养基 | Gibco | -- | |
| PCIS培养 | DMEM/Ham's F12培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 人胰岛素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 人氢化可的松 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 人转铁蛋白 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 大鼠纤连蛋白 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 庆大霉素 | Gibco | -- | |
| 蛋白酶抑制剂 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 固定组织 | ROTI®Histofix 4%甲醛 | Carl ROTH | -- |
| 活力检测 | ATP生物发光检测试剂盒CLS II | Roche Diagnostics | -- |
| Pierce™ BCA蛋白检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Qiagen珠子 | Qiagen | -- | |
| 细胞活力检测 | MTT | Thermo Fisher Scientific | M6494 |
| VLP标记 | Alexa Fluor 488-NHS酯 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 30 kDa Amicon超滤管 | Millipore | -- | |
| 病毒组织化学 | 兔抗AF488抗体 | Thermo Fisher Scientific | A-11094 |
| 生物素化山羊抗兔抗体 | Vector Laboratories | BA-9400 | |
| Vectastain ELITE ABC试剂盒 | Vector Laboratories | PK6100 | |
| 进入实验 | 18孔ibiTreat培养板 | ibidi | -- |
| 山羊抗兔AF568 | Invitrogen | A11011 | |
| AF647偶联小麦胚芽凝集素 | Thermo Fisher Scientific | W32466 | |
| Hoechst 33342 | Thermo Fisher Scientific | 62249 | |
| ProLong™ Diamond抗淬灭封片剂 | Thermo Fisher Scientific | P36970 | |
| 感染实验 | QIAamp病毒RNA小提试剂盒 | Qiagen | -- |
| RT-qPCR | LightCycler多重RNA病毒预混试剂 | Roche | -- |
| 免疫荧光 | 小鼠抗冠状病毒核蛋白抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA1-82189 |
| 小鼠抗蔗糖酶-异麦芽糖酶抗体 | Santa Cruz Animal Health | sc-393424 | |
| 兔抗嗜铬粒蛋白A抗体 | abcam | AB15160 | |
| 荆豆凝集素1 | Sigma-Aldrich | L5505 | |
| AF488偶联山羊抗小鼠抗体 | Invitrogen | A11001 | |
| 胆汁盐 | 甘氨鹅脱氧胆酸 | Merck | -- |
| 牛磺石胆酸钠盐 | Sigma-Aldrich | 700252P | |
| 猪胆汁提取物 | Sigma-Aldrich | B8631 | |
| 实验设备 | 振动切片机 | Leica | -- |
| Leica SP5 II激光扫描共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| LightCycler 96系统 | Roche Diagnostics | -- | |
| 实验试剂 | 链霉亲和素-AF647 | Thermo Fisher Scientific | S32357 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| VLP结合和内化实验 | VLP种类和浓度,孵育温度和时间,PCIS个体数量(猪、犬、鸡各3个) 阅读提示:Methods: Entry assay; Results: 图3, 图4 |
| α1,2-岩藻糖阻断实验 | UEA1浓度(0.1-100 µM),处理时间(2h RT),固定或活组织 阅读提示:Methods: Virus histochemistry and immunohistochemistry, Entry assay; Results: 图5, 图6 |
| 胆汁盐处理实验 | TLCA和GCDCA浓度(500 µM),预孵育时间和温度,物种 阅读提示:Methods: Bile samples and bile salts, Entry assay; Results: 图7, 补充图4, 5 |
| 感染实验 | 病毒接种量(HuNoV 1×10^8基因组拷贝,TGEV 1×10^7基因组拷贝),孵育时间(2h),随后培养时间(24h),动物个体数量(4头猪) 阅读提示:Methods: Infection of PCIS; Results: 图8 |
| RT-qPCR检测 | 引物和探针序列(QNIF2d, COG2R, QNIFS),反应条件(逆转录50°C 15min,变性95°C 5min,40循环) 阅读提示:Methods: RT-qPCR |