体细胞采集和重编程
获得来自同一供体的外周血单核细胞和颗粒细胞,并重编程为hiPSCs。
收集外周血和颗粒细胞,分别用CytoTune-iPS 2.0 Sendai Reprogramming Kit转导,在iMEF或Matrigel上培养,获得hiPSC克隆。
Generation of human primordial germ cell-like cells from cumulus and blood cell-derived isogenic human induced pluripotent stem cells†
包括体细胞重编程、多能性验证、三胚层分化、核型分析、RNA-FISH X染色体状态分析及hPGCLC分化实验,但缺乏体内功能验证。
PBMC来源的hiPSC克隆 颗粒细胞来源的hiPSC克隆 hPGCLC细胞
hiPSC克隆的核型正常 三胚层分化能力 XIST/XACT/ATRX的RNA-FISH状态 hPGCLC分化效率(CD38和碱性磷酸酶双阳性细胞比例)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得来自同一供体的外周血单核细胞和颗粒细胞,并重编程为hiPSCs。
收集外周血和颗粒细胞,分别用CytoTune-iPS 2.0 Sendai Reprogramming Kit转导,在iMEF或Matrigel上培养,获得hiPSC克隆。
验证hiPSC克隆的多能性、核型和三胚层分化能力。
通过免疫荧光检测多能性标志物,G显带核型分析,并诱导三胚层分化。
评估hiPSC克隆的X染色体失活状态。
使用RNA-FISH检测XIST、XACT和ATRX的表达,对细胞进行分类。
评估hiPSC克隆分化为hPGCLC的能力。
将hiPSCs诱导为iMeLCs,再分化6天形成hPGCLC聚集体,并通过FACS和qRT-PCR分析标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 体细胞处理 | 透明质酸酶 | Vitrolife | -- |
| G-MOPS缓冲液 | Vitrolife | -- | |
| 体细胞培养 | DMEM/F12培养基 | -- | -- |
| 细胞重编程 | CytoTune-iPS 2.0仙台病毒重编程试剂盒 | Invitrogen | A16517 |
| ReproTeSR培养基 | Stemcell Technologies | 5926 | |
| 细胞培养 | mTeSR-1培养基 | Stemcell Technologies | 85851 |
| 基质胶 | Corning | 356231 | |
| Y-27632 | Tocris Bioscience | 1254 | |
| 三胚层分化 | STEMdiff三胚层分化试剂盒 | STEMCELL Technologies | 05230 |
| 流式分析 | LSRII流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Sigma | X-100 |
| 牛血清白蛋白 | Sigma | A2058 | |
| DAPI | Sigma | -- | |
| 核型分析 | KaryoMAX秋水仙胺 | Gibco | 15212012 |
| 0.05%胰蛋白酶-EDTA | Gibco | 25300054 | |
| DMEM培养基 | Gibco | 10565-018 | |
| 胎牛血清 | Thermos | 10270-106 | |
| GSL-120扫描仪 | Leica Biosystems | -- | |
| RNA-FISH | XIST探针 | Integrated DNA Technologies | -- |
| 酵母tRNA | Life Technologies | 15401029 | |
| 人COT DNA | Merck | 11581074001 | |
| NucleoBond Xtra BAC试剂盒 | Macherey-Nagel | 740436.10 | |
| 切口平移混合物 | Roche | 11745808910 | |
| Cy3-dUTP | ChemCruz | sc-472858 | |
| Sephadex G-50柱 | GE | 28903408 | |
| 含DAPI的Fluoromount封片剂 | Life technologies | 00-4959-52 | |
| hPGCLC诱导 | 人血浆纤连蛋白 | Sigma | F0895 |
| GMEM培养基 | Wisent | 322-005-CL | |
| 敲除血清替代物 | Gibco | 10828-028 | |
| 非必需氨基酸 | Gibco | 11140050 | |
| 谷氨酰胺补充剂 | Gibco | 5050061 | |
| β-巯基乙醇 | Gibco | 31350010 | |
| 激活素A | Peprotech | 120-14 | |
| CHIR99021 | Sigma Aldrich | SML1046 | |
| PD173074 | Tocris Biosciences | 3044 | |
| EZSPHERE微孔板 | ASM | 4810-900SP | |
| 人白血病抑制因子 | Peprotech | 300-05 | |
| 骨形态发生蛋白4 | R&D Systems | 314-BP-050 | |
| 人干细胞因子 | Peprotech | 300-07 | |
| 人表皮生长因子 | R&D Systems | 236-EG | |
| 脱氧核糖核酸酶I | -- | -- | |
| RT-qPCR | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | 74106 |
| QuantiTect逆转录试剂盒 | Qiagen | 205314 | |
| Quantinova SYBR Green | Qiagen | 208056 | |
| QuantStudio Pro6实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体细胞采集 | 供体激素刺激方案、卵泡直径、采血时间 阅读提示:Materials and methods: Somatic cell collection |
| 重编程 | PBMC红细胞祖细胞扩增天数、转导MOI、接种密度;颗粒细胞转导MOI 阅读提示:Materials and methods: Somatic cell reprogramming |
| hiPSC培养 | 培养基(mTeSR-1)、传代方法(EDTA)、ROCK抑制剂浓度 阅读提示:Materials and methods: hiPSC maintenance |
| 三胚层分化 | 分化试剂盒、检测时间点(第5天/第7天)、表面标志物 阅读提示:Materials and methods: Cumulus and blood-derived hiPSCs characterization |
| X染色体状态分析 | RNA-FISH探针、杂交条件、细胞计数数量 阅读提示:Materials and methods: RNA-fish |
| hPGCLC诱导 | iMeLC诱导密度和时间、hPGCLC诱导密度和时间、细胞因子浓度 阅读提示:Materials and methods: hPGCLC induction |