构建YB1 CTD过表达腺病毒载体
建立YB1 CTD过表达的工具,以便研究其功能。
将人YB1 CTD编码区(氨基酸125-324)克隆至pEGFP载体,再亚克隆至pAD/CMV/V5-DEST载体,并在293A细胞中包装为腺病毒。
Overexpression of YB1 C-terminal domain inhibits proliferation, angiogenesis and tumorigenicity in a SK-BR-3 breast cancer xenograft mouse model.
包含体外细胞实验(增殖、迁移、血管生成)和体内裸鼠异种移植瘤模型,并通过Western blot、ELISA、免疫组化等功能验证。
SK-BR-3乳腺癌细胞系 EA.hy926人脐静脉内皮细胞系 裸鼠异种移植瘤模型
SK-BR-3细胞感染Ad-GFP或Ad-GFP-YB1 CTD的剂量和时间(48小时) MTS增殖实验的细胞接种密度和检测时间 体内实验中每只裸鼠皮下注射的细胞数量(5×10^6)和观察时间(14天) EA.hy926细胞Transwell迁移实验的细胞数和时间 VEGF ELISA检测所用试剂盒品牌和检测波长
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立YB1 CTD过表达的工具,以便研究其功能。
将人YB1 CTD编码区(氨基酸125-324)克隆至pEGFP载体,再亚克隆至pAD/CMV/V5-DEST载体,并在293A细胞中包装为腺病毒。
评估YB1 CTD对SK-BR-3细胞增殖的影响。
用不同量Ad-GFP或Ad-GFP-YB1 CTD感染细胞48小时,进行Western blot和MTS增殖实验。
评估YB1 CTD对SK-BR-3细胞骨架组织和迁移的影响。
用Ad-GFP或Ad-GFP-YB1 CTD感染细胞48小时,进行鬼笔环肽染色和伤口愈合实验。
评估YB1 CTD对SK-BR-3细胞诱导的内皮细胞血管生成的影响。
收集条件培养基,检测VEGF分泌,并进行内皮细胞Transwell迁移和管形成实验。
评估YB1 CTD在裸鼠体内对肿瘤形成和血管生成的影响。
将5×10^6个SK-BR-3细胞皮下注射至裸鼠乳腺脂肪垫,监测肿瘤生长,14天后取材,进行免疫组化检测CD31和VEGF。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 载体构建 | pEGFP载体 | Clontech Laboratories | -- |
| pAD/CMV/V5-DEST载体 | Invitrogen | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| siRNA转染 | YB1小干扰RNA | Santa Cruz Biotechnology | -- |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| 抗YB1抗体 | Abcom | ab76149 | |
| 抗p21抗体 | Santa Cruz | sc-397 | |
| 抗cyclin B1抗体 | Epitomics | 1495-1 | |
| 抗cyclin D1抗体 | Epitomics | 2261-1 | |
| 抗GFP抗体 | Santa Cruz | sc-390394 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Santa Cruz | sc-47778 | |
| 山羊抗小鼠IgG-HRP | Santa Cruz | sc-2005 | |
| 山羊抗兔IgG-HRP | Santa Cruz | sc-2004 | |
| Immobilon Western化学发光HRP底物 | Millipore Corporation | -- | |
| MTS增殖实验 | CellTiter 96 AQueous One Solution细胞增殖检测试剂盒 | Promega | -- |
| Biotek Epoch分光光度计 | Bio Tek Instruments, Inc. | -- | |
| 流式细胞术 | 碘化丙啶 | -- | -- |
| BD FACSCALIBUR流式细胞仪 | Becton, Dickinson and Company | -- | |
| BD CellQuest Pro软件 | Becton, Dickinson and Company | -- | |
| 细胞骨架染色 | TRITC-鬼笔环肽 | -- | -- |
| DAPI | -- | -- | |
| BX53显微镜系统 | Olympus | -- | |
| 内皮细胞迁移实验 | Transwell通透性支持物 | Corning Incorporated | -- |
| 管形成实验 | Matrigel基质胶 | Corning | -- |
| image-pro plus 6.0软件 | Media Cybernetics, Inc. | -- | |
| ELISA | 人VEGF Neobioscience ELISA试剂盒 | Neobioscience Technology | -- |
| 动物实验 | BALB/c-nu裸鼠 | Beijing HFK Bioscience Co., Ltd | -- |
| 免疫组化 | 抗CD31抗体 | Novusbio | NPB1-71663 |
| 抗VEGF抗体 | Proteintech | 19003-1-AP | |
| HRP抗兔试剂盒 | Abgent Inc. | KT1005a |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基和培养条件 阅读提示:Methods: Cell culture and cell lines |
| 腺病毒构建和感染 | 病毒载体构建细节、感染剂量(MOI)和感染时间 阅读提示:Methods: Adenovirus expression vector construction; Results: 图1A |
| 细胞增殖实验 | 细胞接种数量、感染时间、MTS试剂孵育时间、测量波长 阅读提示:Methods: MTS cell proliferation assay |
| 细胞迁移实验 | 细胞处理、丝裂霉素C浓度、观察时间 阅读提示:Methods: Cell migration assay; Results: 图2B |
| 血管生成实验 | 条件培养基制备方法、管形成实验的时间和细胞数、Transwell迁移实验的细胞数 阅读提示:Methods: Tube formation assay; Results: 图3B, C |
| 动物实验 | 动物品系和来源、注射细胞数量、观察时间、肿瘤体积计算公式 阅读提示:Methods: Nude mice subcutaneous injection; Results: 图4 |
| 免疫组化 | 抗体浓度、染色评分标准 阅读提示:Methods: Immunohistochemistry |