构建omp18基因敲除突变株
验证Omp18在幽门螺杆菌定植和免疫逃逸中的作用。
通过同源重组将卡那霉素抗性基因插入omp18基因,构建幽门螺杆菌26695和SS1的Δomp18突变株,并经PCR验证。
Helicobacter pylori Outer Membrane Protein 18 (Hp1125) Is Involved in Persistent Colonization by Evading Interferon- γ Signaling.
包含基因敲除突变株构建、体外细胞感染、小鼠体内定植与组织病理、免疫因子检测及机制验证(STAT1磷酸化)等独立证据层级。
幽门螺杆菌26695野生型与Δomp18突变株 幽门螺杆菌SS1野生型与Δomp18突变株 小鼠巨噬细胞RAW264.7 人胃上皮细胞系AGS C57BL/6小鼠感染模型
IFN-γ浓度(50 pg/mL)及处理时间(6小时) 小鼠感染剂量(108 cfu/mL,每组40只,2、4、6、8周检测) 巨噬细胞感染复数(MOI 1:100) NO暴露浓度(SNP 8 mM)及时间点(0-12小时)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Omp18在幽门螺杆菌定植和免疫逃逸中的作用。
通过同源重组将卡那霉素抗性基因插入omp18基因,构建幽门螺杆菌26695和SS1的Δomp18突变株,并经PCR验证。
探究IFN-γ是否调控Omp18的转录表达。
用不同浓度IFN-γ处理幽门螺杆菌26695,不同时间点收集细菌,通过qRT-PCR检测omp18 mRNA水平。
确定Omp18是否介导IFN-γ对毒力因子CagA和NapA的调控。
用IFN-γ处理野生型和Δomp18菌株,通过qRT-PCR和Western blot检测CagA和NapA的mRNA和蛋白水平。
比较野生型与Δomp18菌株在小鼠胃部的定植能力和炎症反应。
通过口服灌胃感染C57BL/6小鼠,分别于2、4、6、8周处死,定量检测胃组织细菌载量,并进行组织病理评分。
评估Δomp18感染引起的炎症反应水平。
通过ELISA检测小鼠胃组织中的MIP-2、IFN-γ、IL-12p70,以及AGS细胞分泌的IL-8。
验证Omp18对IFN-γ信号通路的影响及NO产生的联系。
用IFN-γ处理感染野生型或Δomp18菌株的巨噬细胞,通过Western blot检测STAT1磷酸化水平,并用Griess法检测NO产生。
检测Omp18在NO应激和抗吞噬作用中的功能。
用SNP处理细菌模拟NO应激,检测存活率和形态变化;感染巨噬细胞后测定胞内细菌存活率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细菌培养 | Skirrow琼脂 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 基因打靶 | 卡那霉素 | Sigma-Aldrich | -- |
| T4连接酶 | Fermentas | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| F12培养基 | Gibco | -- | |
| qRT-PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| Revert Aid第一链cDNA合成试剂盒 | Fermentas | -- | |
| SYBR Premic Ex Taq | Takara | -- | |
| ROX参考染料 | Takara | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 抗STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 5375 | |
| 抗CagA抗体 | Abcam | ab90490 | |
| NO检测 | 格里斯试剂I和II | Beyotime | -- |
| NO应激 | 硝普钠 | -- | -- |
| 细胞存活测定 | 庆大霉素 | -- | -- |
| 活菌染色 | LIVE/DEAD BacLight细菌活性检测试剂盒 | Molecular Probes, Invitrogen | -- |
| ELISA | 人IL-8 ELISA试剂盒 | NeoBioscience | -- |
| 小鼠IFN-γ ELISA试剂盒 | eBioscience | -- | |
| 小鼠MIP-2 ELISA试剂盒 | Cusabio Biotech | -- | |
| 小鼠IL-12p70 ELISA试剂盒 | NeoBioscience | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细菌培养与突变株构建 | 培养条件:微需氧环境(5% O2, 10% CO2, 85% N2)、37°C;培养基:Skirrow琼脂含5%羊血或布氏肉汤含10%FBS;突变株构建使用卡那霉素(10 mg/mL)筛选。 阅读提示:参见Materials and Methods 2.1和2.2节 |
| IFN-γ处理实验 | IFN-γ浓度(50 pg/mL)和处理时间(6小时),细菌生长阶段(OD600 ≈ 0.8),qRT-PCR和Western blot的检测条件。 阅读提示:参见Materials and Methods 2.6和2.7节,以及图2图注 |
| 小鼠感染模型 | 小鼠品系(C57BL/6)、周龄(6-8周)、性别(雌性)、SPF级;感染剂量(108 cfu/mL)和途径(口服灌胃),每组40只,时间点(2、4、6、8周)各处理5只。 阅读提示:参见Materials and Methods 2.3节和图3图注 |
| 细胞培养和感染 | RAW264.7和AGS细胞的培养条件(DMEM或F12含10%FBS,37°C,5% CO2);感染复数(MOI 1:100),IFN-γ处理浓度和时间(50 pg/mL,15小时或6小时)。 阅读提示:参见Materials and Methods 2.4节 |
| 细胞因子和NO检测 | ELISA操作细节(样本处理、稀释、试剂盒品牌)、Griess试验中NaNO2标准曲线(1-100 mM),检测时间和细胞培养条件。 阅读提示:参见Materials and Methods 2.5和2.8节 |
| 细菌存活和抗吞噬实验 | SNP浓度(8 mM)和处理时间(0、2、4、6、12小时);巨噬细胞感染MOI(100),庆大霉素浓度(100 μg/mL)和孵育时间(1小时),裂解和计数时间点(2、6、24小时)。 阅读提示:参见Materials and Methods 2.9和2.11节 |
| 统计分析 | 未配对t检验和多组比较的Sidak-Bonferroni校正,显著性水平P<0.05。 阅读提示:参见Materials and Methods 2.12节 |