建立并表征EEGOs
验证从患者子宫内膜组织构建的类器官能否长期扩增并保留上皮表型和激素反应性。
从患者子宫内膜分离上皮腺体,在Matrigel中培养,通过免疫荧光、HE、PAS、电镜等鉴定标志物表达和超微结构。
Investigating bacteria-induced inflammatory responses using novel endometrial epithelial gland organoid models.
包含类器官构建与表征、激素反应、细菌感染模型、RNA-seq、qPCR、ELISA及电镜等多个独立证据层级,并进行功能验证。
患者来源的子宫内膜上皮腺体类器官(EEGOs) 大肠杆菌(E. coli ATCC-25922)感染的EEGOs 空气-液体界面(ALI)培养的EEGOs
EEGOs的构建方法:Matrigel 70%包埋,培养基含R-Spondin-1 250 ng/ml、EGF 250 μg/ml、Noggin 100 μg/ml等 激素处理:E2 10 nM和P4 1 μM处理时间(3天和4天) 感染条件:MOI 1,共培养1小时,恢复24小时 关键检测指标:炎症因子(TNF-α, IL-8, IFN-γ)表达,MAPK通路激活,E2处理后炎症基因变化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证从患者子宫内膜组织构建的类器官能否长期扩增并保留上皮表型和激素反应性。
从患者子宫内膜分离上皮腺体,在Matrigel中培养,通过免疫荧光、HE、PAS、电镜等鉴定标志物表达和超微结构。
评估EEGOs对雌激素和孕激素的生理反应,模拟增殖期和分泌期变化。
用E2(10 nM)和E2+P4(10 nM+1 μM)处理类器官,观察形态变化、ER/PR表达及下游基因表达。
确定EEGOs对大肠杆菌感染的炎症反应。
将EEGOs与E. coli以MOI 1共培养,通过ELISA检测炎症因子,qPCR检测炎症基因表达,并通过电镜观察形态变化。
揭示感染后涉及的信号通路和差异表达基因。
对感染和未感染类器官进行RNA-seq,分析差异表达基因和KEGG通路富集,并用qPCR验证关键基因。
检测E2处理能否减轻E. coli引起的炎症并恢复子宫内膜功能。
感染后添加E2处理,通过qPCR检测炎症因子、着床相关基因、增殖和屏障修复基因的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | HyClone | SH30272.01 |
| B27添加剂 | Gibco | 17504-044 | |
| N2添加剂 | Gibco | 17502-048 | |
| A83-01 | MCE | HY-10432 | |
| 表皮生长因子 | MCE | HY-P7109 | |
| R-Spondin-1 | MCE | HY-P7114 | |
| Noggin | MCE | HY-P7051A | |
| 基质胶 | Corning | 356255 | |
| 胶原酶II | Sigma | C2-28-100MG | |
| 胶原酶IV | Sigma | C4-28-100MG | |
| Y27632 | MCE | HY-10071/CS-0131 | |
| 雌二醇 | MCE | HY-B0141 | |
| 孕酮 | MCE | HY-N0437 | |
| TrypLE消化液 | Gibco | 12604021 | |
| 细胞回收液 | Corning | 354270 | |
| 细菌培养 | LB琼脂 | -- | -- |
| LB肉汤 | Solarbio | L8291 | |
| 药物处理 | DAPI | Beyotime | C1002 |
| 免疫组化/免疫荧光 | 雌激素受体抗体 | MCE | HY-P80663 |
| 孕激素受体抗体 | MCE | HY-P82121 | |
| Ki67抗体 | MCE | HY-P80506 | |
| MUC1抗体 | Abcam | ab4516 | |
| 广谱角蛋白抗体 | CST | 4545 | |
| 波形蛋白抗体 | CST | 5741 | |
| E-钙粘蛋白抗体 | CST | 3195 | |
| EpCAM抗体 | Abcam | ab223582 | |
| Alexa Fluor 555标记的驴抗小鼠IgG(H+L) | Beyotime | A0460 | |
| Alexa Fluor 488标记的山羊抗小鼠IgG(H+L) | Beyotime | A0428 | |
| RNA提取与qPCR | TRIzol试剂 | Accurate Biology | AG11701 |
| 逆转录试剂盒 | Accurate Biology | AG11728 | |
| SYBR Green | Accurate Biology | AG11701 | |
| ELISA | 人TNF-α ELISA试剂盒 | NeoBioscience | ECC102a |
| 人IL-8 ELISA试剂盒 | NeoBioscience | EHC008.96 | |
| 人IFN-γ ELISA试剂盒 | NeoBioscience | EHC102g.96 | |
| 电镜 | PON812环氧树脂 | SPI | -- |
| 仪器 | NanoDrop分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | ND-2000 |
| ABI7500系统 | Applied Biosystems | -- | |
| Bioanalyzer 2100系统 | Agilent Technologies | -- | |
| Illumina测序系统 | Illumina | -- | |
| 酶标仪 | TECAN | Profiblot48 | |
| 透射电子显微镜 | JEOL | JEM1230 | |
| 分光光度计 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 类器官构建 | 胶原酶浓度(1 mg/ml)、消化时间(45分钟)、Matrigel浓度(70%)、培养因子浓度(如R-Spondin-1 250 ng/ml、EGF 250 μg/ml等) 阅读提示:Materials and Methods: Establishment of EEGOs |
| 激素处理 | E2浓度(10 nM)和处理时间(3天)、P4浓度(1 μM)和处理时间(4天) 阅读提示:Materials and Methods: Hormone treatment of organoids; Figure 3 legend |
| 细菌感染 | E. coli菌株(ATCC-25922)、MOI=1、共培养时间(1小时)、恢复时间(24小时) 阅读提示:Materials and Methods: Co-culture of organoids with bacteria; Figure 4 legend |
| ELISA检测 | 检测指标(TNF-α, IL-8, IFN-γ)、试剂盒品牌及型号、样本稀释 阅读提示:Materials and Methods: ELISA assay; Figure 4G |
| RNA-seq分析 | RNA质量参数(RIN≥8.0)、差异表达阈值(fold change>2, FDR<0.05)、KEGG富集阈值(FDR<0.05) 阅读提示:Materials and Methods: RNA-seq analysis; Figure 5 |
| E2治疗 | E2处理时间(感染后24小时)及浓度(10 nM) 阅读提示:Materials and Methods: Co-culture of organoids with bacteria; Figure 6 legend |