亲和分离鉴定候选蛋白
鉴定与LOX-1胞质域相互作用的细胞内蛋白。
使用生物素化LOX-1胞质域肽段和对照肽段偶联至NeutrAvidin琼脂糖珠,与HUVEC裂解液孵育,洗脱后通过SDS-PAGE和银染分离,差异条带经LC/MS/MS鉴定蛋白。
Chaperonin-containing TCP-1 complex directly binds to the cytoplasmic domain of the LOX-1 receptor.
包括亲和分离、免疫共沉淀、免疫荧光共定位和直接结合实验,验证了LOX-1与CCT的直接相互作用,但缺乏体内功能验证或机制验证。
人脐静脉内皮细胞(HUVECs) 纯化的牛睾丸CCT复合物 生物素化LOX-1胞质域肽段
CCT与LOX-1胞质域直接结合的ATP依赖性(0.1 mM ATP) OxLDL(10 µg/ml)处理对LOX-1/CCT共定位的影响 CCT1和CCT4与LOX-1的共免疫沉淀 CCT1和LOX-1在HUVECs中的共定位
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定与LOX-1胞质域相互作用的细胞内蛋白。
使用生物素化LOX-1胞质域肽段和对照肽段偶联至NeutrAvidin琼脂糖珠,与HUVEC裂解液孵育,洗脱后通过SDS-PAGE和银染分离,差异条带经LC/MS/MS鉴定蛋白。
验证内源性LOX-1与CCT复合物的相互作用。
在HUVECs中用抗LOX-1抗体或同型对照抗体进行免疫沉淀,然后用Western blot检测CCT1和CCT4。
观察LOX-1和CCT1在细胞内的共定位情况。
用抗LOX-1和抗CCT1抗体对固定HUVECs进行免疫染色,通过共聚焦显微镜观察。
检测纯化CCT是否直接与LOX-1胞质域结合及ATP依赖性。
将纯化的CCT与结合在琼脂糖珠上的LOX-1肽段在存在或不存在ATP的条件下孵育,洗脱结合蛋白,通过Western blot检测CCT1。
检测OxLDL是否调节LOX-1和CCT之间的相互作用。
用DiI-OxLDL处理HUVECs,通过免疫共沉淀和免疫荧光分析LOX-1与CCT1的相互作用和共定位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | EGM-2培养基 | Lonza | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素 | Gibco | -- | |
| 链霉素 | Gibco | -- | |
| 胰蛋白酶/EDTA | Gibco | -- | |
| 细胞裂解 | Triton X-100 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | Roche | -- | |
| N-乙基马来酰亚胺 | Sigma | -- | |
| 亲和分离 | NeutrAvidin琼脂糖珠 | Thermo Scientific | -- |
| Quick Start Bradford染料试剂 | Bio-Rad | -- | |
| SDS-PAGE | Precise™蛋白凝胶 | Thermo Scientific | -- |
| 质谱分析 | Pierce银染试剂盒 | Thermo Scientific | -- |
| 药物处理 | 氧化低密度脂蛋白 | Kalen Biomedical | 770252-7 |
| 免疫沉淀 | 抗LOX-1单克隆抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc66155 |
| 同型对照抗体 | SouthernBiotech | 0102-01 | |
| Protein-G琼脂糖珠 | GE Healthcare | -- | |
| 免疫印迹 | 抗CCT1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc53454 |
| 抗CCT4抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc137094 | |
| 免疫荧光 | 抗LOX-1抗体 | Abcam | ab60178 |
| Alexa Fluor 488山羊抗兔二抗 | Invitrogen | -- | |
| Alexa Fluor 555山羊抗大鼠二抗 | Invitrogen | -- | |
| Hoechst 33258染料 | Sigma | -- | |
| 抗EEA1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-365652 | |
| 抗M6PR1抗体 | Thermo Scientific | MA1-066 | |
| 荧光封片介质 | Dako | -- | |
| 显微镜 | Leica TCS SP5 II共聚焦显微镜 | Leica | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | HUVECs培养条件:EGM-2培养基,10% FBS,青霉素/链霉素,37°C,5% CO2 阅读提示:Materials and Methods, 2.1 Cell culture |
| 亲和分离 | LOX-1胞质域肽段和乱序肽段的序列及生物素化修饰,肽段用量150 μg,HUVEC裂解液500-700 μg,孵育和洗脱条件 阅读提示:Materials and Methods, 2.2 Peptides; 2.4 Affinity isolation |
| 免疫共沉淀 | 抗LOX-1抗体(sc66155)和同型对照(0102-01)的使用浓度,OxLDL处理条件(10 µg/ml,1小时) 阅读提示:Materials and Methods, 2.6 Coimmunoprecipitation assay |
| 免疫荧光 | 细胞固定和透化条件,一抗浓度(1 µg/ml),二抗浓度(2-4 µg/ml),共聚焦显微镜设置 阅读提示:Materials and Methods, 2.7 Indirect immunofluorescence confocal microscopy |
| 直接结合实验 | 纯化CCT来源(牛睾丸)和浓度(100 µg),肽段用量(100 µg),ATP浓度(0.1 mM),孵育条件 阅读提示:Materials and Methods, 2.8 CCT complex purification; 2.9 Direct binding assay |