重组质粒构建与酵母表达
构建PIL22-PBD-2融合基因的酵母表达载体,并在毕赤酵母中表达和纯化重组蛋白。
将猪IL-22基因与PBD-2基因通过柔性linker连接,构建pPIC9K-PIL22-PBD-2质粒,转化毕赤酵母GS115,甲醇诱导表达,His标签纯化,SDS-PAGE和Western blot验证。
Expression of recombination antimicrobial protein PIL22-PBD-2 in Pichia pastoris and verification of its biological function in vitro.
包含酵母表达与纯化、牛津杯抑菌实验、MIC测定、TEM观察、CCK8、划痕实验、qPCR/WB/IFA检测连接蛋白、流式凋亡检测、细菌粘附及qRT-PCR炎症因子分析,涵盖体外功能与机制验证。
猪肠上皮细胞系IPEC-J2 产肠毒素大肠杆菌ETEC O8攻毒细胞模型
重组蛋白PIL22-PBD-2的表达与纯化,SDS-PAGE和Western blot验证 牛津杯抑菌实验和MIC测定确定对ETEC O8、大肠杆菌、沙门氏菌和金黄色葡萄球菌的抗菌活性 CCK8和划痕实验评估细胞增殖和伤口愈合 qPCR、Western blot和免疫荧光检测ZO-1和E-cadherin表达 流式细胞术评估凋亡,平板计数评估细菌粘附
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
构建PIL22-PBD-2融合基因的酵母表达载体,并在毕赤酵母中表达和纯化重组蛋白。
将猪IL-22基因与PBD-2基因通过柔性linker连接,构建pPIC9K-PIL22-PBD-2质粒,转化毕赤酵母GS115,甲醇诱导表达,His标签纯化,SDS-PAGE和Western blot验证。
评价PIL22-PBD-2对多种致病菌的抑菌活性和最小抑菌浓度。
采用牛津杯法检测PIL22-PBD-2对ETEC O8、大肠杆菌ATCC25922、鼠伤寒沙门氏菌ATCC19659和金黄色葡萄球菌ATCC25923的抑菌圈,用微量肉汤稀释法测定MIC,并用透射电镜观察细菌形态变化。
评估PIL22-PBD-2对IPEC-J2细胞增殖和伤口愈合的影响。
使用CCK8试剂盒检测不同浓度蛋白处理后的细胞活力,通过划痕实验观察细胞迁移和伤口愈合情况。
验证PIL22-PBD-2对IPEC-J2细胞紧密连接和粘附连接蛋白表达的影响。
通过qRT-PCR和Western blot检测ZO-1和E-cadherin的mRNA和蛋白水平,免疫荧光观察蛋白定位和分布。
评估PIL22-PBD-2对ETEC O8感染IPEC-J2细胞的保护作用。
用蛋白预处理细胞后加入ETEC O8,通过流式细胞术检测凋亡,平板计数法评估细菌粘附,qRT-PCR检测炎症因子和防御素mRNA表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 质粒构建 | EcoR I限制性内切酶 | Takara Biotechnology | -- |
| Not I限制性内切酶 | Takara Biotechnology | -- | |
| T4 DNA连接酶 | Takara Biotechnology | -- | |
| 无内毒素质粒提取试剂盒 | OMEGA | -- | |
| NanoDrop 2000微量分光光度计 | Thermo Scientific | 2000 | |
| 酵母转化 | Bio-Rad电穿孔仪 | Bio-Rad | -- |
| 遗传霉素(G418) | Solarbio | -- | |
| 酵母DNA提取试剂盒 | Solarbio | -- | |
| 蛋白表达与纯化 | His标签蛋白纯化试剂盒 | 7sea Biotech | -- |
| Bradford蛋白定量试剂 | Beyotime | -- | |
| Western blot | 小鼠抗HIS标签单克隆抗体 | Abbkine Scientific Co., Ltd. | -- |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG抗体 | Abbkine Scientific Co., Ltd. | -- | |
| 抗菌实验 | 卡那霉素 | -- | 25389-94-0 |
| TEM | 超薄切片机UC7 | Leica | UC7 |
| 醋酸铀 | Thermo Fisher Scientific | 541-09-3 | |
| JEOL 1010透射电子显微镜 | JEOL | 1010 | |
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | Hyclone | -- |
| 胎牛血清 | PAN | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 细胞增殖 | CCK8试剂盒 | Neobioscience | -- |
| 划痕实验 | Hanks平衡盐溶液 | Hyclone | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Solarbio | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 小鼠抗猪ZO-1单克隆抗体 | Proteintech | -- | |
| 兔源E-cadherin多克隆抗体 | Immunoway | -- | |
| 小鼠抗β-actin抗体 | Yeasen | -- | |
| 山羊抗兔IgG-HRP | Yeasen | -- | |
| 山羊抗小鼠IgG-HRP | Yeasen | -- | |
| 增强化学发光系统 | Bio-Rad | -- | |
| 免疫荧光 | FITC标记的山羊抗小鼠IgG | Yeasen | -- |
| TRITC标记的山羊抗兔IgG | Yeasen | -- | |
| 流式凋亡 | Annexin V-FITC | Beyotime | -- |
| 碘化丙啶 | Beyotime | 25535-16-4 | |
| FACSCantoII流式细胞仪 | BD Biosciences | FACSCantoII | |
| qRT-PCR | Trizol试剂 | Accurate Biology | -- |
| TransScript第一链cDNA合成SuperMix | TransGen Biotech | -- | |
| TransStart Top Green qPCR SuperMix | TransGen Biotech | -- | |
| Light Cycler 96实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | 96 | |
| 统计 | GraphPad Prism 8 | GraphPad Software, Inc. | 8 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 重组蛋白表达与纯化 | 酵母菌株GS115、载体pPIC9K、甲醇诱导浓度和时间(2% v/v,96小时),电转化参数,His标签纯化步骤 阅读提示:Materials and methods: Transformation and colony PCR assay; Yeast expression of PIL22-PBD-2 |
| 抗菌活性检测 | 细菌种类和菌株(ETEC O8、E. coli ATCC25922、Salmonella ATCC19659、S. aureus ATCC25923),细菌浓度(106 CFU/mL),蛋白浓度(100 μg/mL),MIC测定方法(倍比稀释,起始256 μg/mL),共孵育时间(24小时) 阅读提示:Materials and methods: Antibacterial assay; MIC assay; Figure 2 legend |
| 细胞增殖与划痕实验 | IPEC-J2细胞系来源,细胞接种密度(96孔板1×104,6孔板1×106),蛋白处理浓度(CCK8: 2-128 μg/mL;划痕: 1和4 μg/mL),处理时间(24小时或12小时) 阅读提示:Materials and methods: Cell proliferation assay and wound healing assay; Figure 3 legend |
| 连接蛋白表达检测 | 蛋白处理浓度(4和1 μg/mL),处理时间(24小时),抗体稀释度(ZO-1, E-cadherin, β-actin),内参基因(β-actin),2-ΔΔCt方法 阅读提示:Materials and methods: qPCR and Western blot analysis; Immunofluorescence assay; Figure 4 legend |
| ETEC O8攻毒保护实验 | 蛋白预处理浓度(1或4 μg/mL)和时间(12小时),ETEC O8攻毒MOI=10和4小时,凋亡检测和粘附实验的具体操作 阅读提示:Materials and methods: Assessment of apoptosis by flow cytometry; Adhesion of ETEC O8; qRT-PCR; Figure 5 and Figure 6 legends |