FliGN蛋白表达与纯化
获得用于NMR和荧光实验的纯化FliGN蛋白
从FliGNM构建体生成FliGN(残基1-102),在BL21-Rosetta细胞中表达,经热处理、镍亲和层析和FPLC尺寸排阻层析纯化。
Structural insights into the interaction between the bacterial flagellar motor proteins FliF and FliG.
包含体外蛋白纯化、NMR结构表征、尺寸排阻色谱/光散射分析、荧光结合实验等分子层面验证,但缺乏体内功能验证。
Thermotoga maritima FliGN重组蛋白 Thermotoga maritima全长FliG蛋白 合成FliFC肽段
FliFC肽段序列(FliF495-532、FliF512-532等) NMR实验条件(40°C,8% D2O) 荧光实验缓冲液(50 mM磷酸钠,100 mM NaCl,0.5 mM EDTA,pH 6.5) FliGN浓度及肽段浓度
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得用于NMR和荧光实验的纯化FliGN蛋白
从FliGNM构建体生成FliGN(残基1-102),在BL21-Rosetta细胞中表达,经热处理、镍亲和层析和FPLC尺寸排阻层析纯化。
确定FliGN与FliFC肽是否结合及结合引起的构象变化
使用三共振NMR实验对游离FliGN及结合FliF495-532的FliGN进行主链归属,通过15N-1H TROSY-HSQC观察结合前后谱图变化。
确定FliGN及全长FliG在结合FliFC肽前后的寡聚状态
使用SEC-MALS系统测定游离和结合肽的FliGN和全长FliG的分子量。
定量FliFC肽与FliGN的结合亲和力及化学计量比
利用FliFC中保守色氨酸W527的内源荧光,监测加入FliGN后荧光变化,计算解离常数。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白质纯化 | AcTEV蛋白酶 | Invitrogen | -- |
| NMR波谱 | Varian Inova 600兆赫 | Varian | -- |
| Bruker Avance III Ultrashield Plus 800兆赫 | Bruker | -- | |
| 荧光光谱 | Perkin Elmer LS 55荧光分光光度计 | Perkin Elmer | -- |
| 尺寸排阻色谱/光散射 | Wyatt Technologies Minidawn TREOS | Wyatt Technologies | -- |
| Wyatt Technologies t-rEX折射率检测器 | Wyatt Technologies | -- | |
| 多肽合成 | FliF495-532肽 | EZ Biolab | -- |
| FliF495-532肽 | NEO BioScience | -- | |
| FliF512-532、FliF520-528、FliF523-528肽 | Biomatik Corporation | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 蛋白质表达与纯化 | 表达菌株(BL21-Rosetta)、诱导条件(IPTG浓度、温度、时间)、纯化缓冲液组成 阅读提示:参见Materials and Methods中的Protein Purification部分 |
| NMR实验 | 蛋白浓度、温度、缓冲液(含D2O比例)、肽段序列及浓度、NMR谱仪型号 阅读提示:参见Materials and Methods中的NMR Spectroscopy部分及图2图注 |
| 尺寸排阻色谱/光散射 | 蛋白浓度、缓冲液组成(Tris、NaCl、EDTA、pH)、色谱柱类型 阅读提示:参见Materials and Methods中的Size-Exclusion Chromatography部分及图4图注 |
| 荧光结合实验 | 缓冲液组成、肽段浓度、激发和发射波长、FliGN浓度范围 阅读提示:参见Materials and Methods中的Fluorescence Spectroscopy部分及图5图注 |