P12的鉴定与结合特性
通过细胞筛选和生物物理方法鉴定P12并评估其与CXCR4的特异性结合。
基于序列和结构特征设计肽库,通过细胞荧光成像筛选出P12,并使用AlphaFold3预测其与CXCR4的结合模式,FTIR分析其构象。通过共聚焦显微镜和流式细胞术评估P12与多种细胞系的结合亲和力。
Development of a CXCR4 antagonistic peptide, P12, to suppress pancreatic cancer progress via enhancing T cell responses and sensitizing cells to gemcitabine.
包含体外细胞实验(结合、迁移、粘附、信号通路、药物敏感性)、体内原位瘤模型(生存期、肿瘤重量、免疫组化、淋巴细胞毒性)及药物分布实验,证据层级丰富。
PANC-1人胰腺癌细胞 pan02小鼠胰腺癌细胞 原位胰腺癌小鼠模型 CCC-ESF-1人成纤维细胞
P12与CXCR4结合的特异性(AlphaFold3预测和细胞结合实验) CXCL12诱导的肿瘤细胞迁移和粘附是否被P12抑制 P12对Erk和P38磷酸化的影响 P12与吉西他滨联合对细胞活力和体内肿瘤生长的作用 体内CD8+ T细胞浸润和细胞因子水平变化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
通过细胞筛选和生物物理方法鉴定P12并评估其与CXCR4的特异性结合。
基于序列和结构特征设计肽库,通过细胞荧光成像筛选出P12,并使用AlphaFold3预测其与CXCR4的结合模式,FTIR分析其构象。通过共聚焦显微镜和流式细胞术评估P12与多种细胞系的结合亲和力。
验证P12是否能抑制CXCL12介导的下游信号激活。
用CXCL12刺激PANC-1和pan02细胞,并通过Western blot检测p-Erk和p-P38水平,同时观察P12预处理的影响。
评估P12对CXCL12诱导的迁移和细胞间粘附的抑制作用。
使用Transwell实验检测P12预处理后PANC-1、pan02、AsPC-1、BXPC-3细胞的迁移能力;通过细胞粘附实验检测P12对肿瘤细胞与THP-1、CCC-ESF-1、RAW264.7、NIH/3T3细胞粘附的影响。
探究P12是否能提高胰腺癌细胞和成纤维细胞对吉西他滨的敏感性。
将PANC-1、pan02、CCC-ESF-1、NIH/3T3细胞先用P12处理,再暴露于不同浓度吉西他滨,用CCK-8法检测细胞活力。
评估P12单药和联合吉西他滨对原位胰腺癌小鼠模型的治疗效果。
建立pan02原位胰腺癌模型,随机分组,给予P12和/或吉西他滨治疗,监测生存期,测量肿瘤重量,进行H&E和免疫荧光染色。
评估P12对肿瘤微环境中免疫细胞的影响。
通过免疫荧光染色检测肿瘤组织中CD8+ T细胞和α-SMA的表达;分离脾淋巴细胞进行细胞毒性实验;ELISA检测血液中IFN-γ和TNF-α水平。
评估P12在荷瘤小鼠体内的分布和药代动力学。
向原位胰腺癌小鼠注射FITC-P12,在不同时间点采集血液和器官,测量荧光强度,计算半衰期和组织积累。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 肽合成 | P12 | Anhui Guoping Pharmaceutical Co., Ltd. | -- |
| 细胞培养 | DMEM高糖培养基 | -- | -- |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| FTIR光谱分析 | PerkinElmer Spectrum One傅里叶变换红外光谱仪 | PerkinElmer | -- |
| 结合实验 | Alexa Fluor® 647抗CXCR4抗体 | Abcam | -- |
| DAPI | -- | -- | |
| FITC标记链霉亲和素 | Biolegend | -- | |
| 迁移实验 | CXCL12 | Peprotech | -- |
| 结晶紫 | -- | -- | |
| Millicell悬挂式细胞培养插入件 | Millipore | -- | |
| 粘附实验 | 钙黄绿素AM | Invitrogen | -- |
| Western blot | p-Erk抗体 | CST | -- |
| Erk抗体 | CST | -- | |
| p-P38抗体 | CST | -- | |
| P38抗体 | CST | -- | |
| β-actin抗体 | CST | -- | |
| RIPA裂解液 | -- | -- | |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | -- | -- | |
| 凝胶成像系统 | Tanon | -- | |
| 细胞活力 | CCK-8试剂盒 | Dojindo | -- |
| 伊立替康 | Aladdin | -- | |
| 吉西他滨 | Bide Pharmatech Co., Ltd. | -- | |
| 动物实验 | Matrigel™基质胶 | BD Biosciences | -- |
| 4-0缝合线 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | 抗CD8抗体 | Servicebio | -- |
| 抗SMA抗体 | Servicebio | -- | |
| 免疫学实验 | Ficoll溶液 | Sigma | -- |
| LDH试剂 | Dojindo | -- | |
| 流式细胞术 | 抗CD4抗体(FITC) | Biolegend | -- |
| 抗CD8抗体(APC) | Biolegend | -- | |
| ELISA | IFN-γ ELISA试剂盒 | Neobioscience | -- |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Neobioscience | -- | |
| 生物分布 | IVIS成像系统 | Xenogen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与P12结合实验 | 细胞系来源、FITC-P12浓度、孵育时间;确切的结合实验条件(如细胞数、抗体浓度)。 阅读提示:Methods: Cells and animals, Peptide binding assays in vitro |
| 信号通路检测 | CXCL12刺激浓度(100 ng/mL)、P12预处理浓度和时间(1 h)、Western blot检测的蛋白(p-Erk, p-P38)。 阅读提示:Methods: Western blot assay |
| 迁移和粘附实验 | P12浓度(1或10 μM)、CXCL12浓度(100或200 ng/mL)、孵育时间(迁移24h,粘附15min)、细胞数量。 阅读提示:Methods: Transwell assay, Cell adhesion assay |
| 吉西他滨敏感性实验 | P12预处理浓度(5 μM)和时间(2h)、GEM浓度范围(各细胞系不同)和处理时间(24或72h)。 阅读提示:Methods: Cell viability |
| 体内动物模型与治疗 | 原位肿瘤模型建立方法(pan02细胞与Matrigel混合)、P12剂量(100 mg/kg)和给药频率(每日一次,每周4天)、GEM剂量(10 mg/kg)和频率(每周两次)。 阅读提示:Methods: Administration regimens in the orthotopic pancreatic cancer murine model |
| 免疫效应检测 | 淋巴细胞毒性实验中淋巴细胞与肿瘤细胞比例(10:1)和孵育时间(4h)、ELISA检测的细胞因子(IFN-γ, TNF-α)、抗体(CD8, SMA)来源。 阅读提示:Methods: Immunological cytotoxic assay, ELISA assays for IFN-γ and TNF-α |