临床样本中OTUD7B表达与预后分析
评估OTUD7B在LUSC和LAD组织中的表达水平及其与临床病理特征和预后的关系。
使用组织芯片(225对)进行IHC染色,对OTUD7B表达进行评分,并分析其与肿瘤转移、AJCC分期及患者生存期的相关性。
Upregulation of OTUD7B (Cezanne) Promotes Tumor Progression via AKT/VEGF Pathway in Lung Squamous Carcinoma and Adenocarcinoma.
包含组织芯片IHC、细胞功能实验、信号通路检测、体内异种移植瘤模型等,涵盖体外和体内验证。
NCI-H358细胞系 A549细胞系 EA.hy926内皮细胞系 BALB/c裸鼠异种移植瘤模型
组织芯片包含225对肺癌及癌旁组织(150例LUSC,75例LAD) OTUD7B表达通过IHC评分(0-12)分级 EGF刺激浓度为500 ng/mL,处理时间15-90分钟 小鼠每组6只,皮下注射1×10^6细胞 统计分析使用SPSS,P<0.05为显著
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估OTUD7B在LUSC和LAD组织中的表达水平及其与临床病理特征和预后的关系。
使用组织芯片(225对)进行IHC染色,对OTUD7B表达进行评分,并分析其与肿瘤转移、AJCC分期及患者生存期的相关性。
验证OTUD7B是否影响NCI-H358和A549细胞的增殖、迁移和侵袭能力。
在NCI-H358和A549细胞中过表达或敲低OTUD7B,进行MTT增殖、集落形成、划痕迁移和transwell侵袭实验。
探究OTUD7B是否激活Akt、ERK1/2、p38和JNK信号通路。
在EGF刺激下,通过免疫印迹检测NCI-H358和A549细胞中p-Akt、p-ERK1/2、p-p38、p-JNK及p70S6K的磷酸化水平,同时检测EGFR蛋白水平。
探讨OTUD7B与VEGF表达的关系,并验证OTUD7B对VEGF分泌和血管生成的影响。
通过R2平台和IHC染色分析OTUD7B与VEGF的相关性;在NCI-H358细胞中过表达或敲低OTUD7B,用ELISA检测VEGF分泌,并用条件培养基处理EA.hy926细胞进行管形成实验。
验证OTUD7B在体内是否促进肿瘤生长并影响Akt信号。
将稳定过表达或敲低OTUD7B的NCI-H358细胞皮下注射至裸鼠,监测肿瘤生长,并在收获肿瘤后通过免疫印迹检测Akt磷酸化水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组化 | OTUD7B抗体 | Proteintech | 16605-1-AP |
| VEGF抗体 | Proteintech | 19003-1-AP | |
| 免疫印迹 | GAPDH抗体 | Abclonal | AC033 |
| p70S6K抗体 | Cell Signaling Technology | 2708 | |
| p-p70S6K T389抗体 | Cell Signaling Technology | 9206 | |
| p-p70S6K T421/S424抗体 | Cell Signaling Technology | 9204 | |
| ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 9102 | |
| p-ERK1/2 T202/Y204抗体 | Cell Signaling Technology | 9101 | |
| p-Akt S473抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| p-p38 T180/Y182抗体 | Cell Signaling Technology | 9215 | |
| p-JNK T183/Y185抗体 | Cell Signaling Technology | 4668 | |
| p38抗体 | SAB | 35478 | |
| Akt1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-5298 | |
| ELISA | 人VEGFA单克隆抗体 | Thermo Fisher Scientific | M808 |
| 生物素标记的VEGFA多克隆抗体 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞培养与处理 | 表皮生长因子 | Peprotech | -- |
| 质粒构建 | pLenti-CMV-EGFP-3Flag载体 | -- | -- |
| 基因沉默 | LV3慢病毒载体 | GenePharma | -- |
| 细胞增殖检测 | MTT试剂 | -- | -- |
| BioTek Epoch分光光度计 | BioTek | -- | |
| 细胞迁移与侵袭 | 基质胶 | Corning | -- |
| 管形成实验 | VEGF ELISA试剂盒 | Neobioscience Technology | -- |
| Image-Pro Plus软件6.0 | Media Cybernetics | -- | |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | Beijing HFK Bioscience | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 组织芯片分析 | 组织芯片批号、样本配对情况、OTUD7B和VEGF的IHC染色条件及评分标准 阅读提示:Materials and Methods: Tissue Array and Immunohistochemical Staining |
| 细胞培养与基因操作 | 细胞系来源、培养条件(培养基、FBS浓度)、慢病毒包装和感染条件、筛选药物(puromycin)浓度 阅读提示:Materials and Methods: Cell Culture, Gene Silencing, and Overexpression |
| 细胞功能实验 | MTT实验的细胞密度、检测时间点;集落形成实验的细胞密度、培养时间;迁移划痕宽度和观察时间;侵袭实验的细胞数、Matrigel浓度、培养时间 阅读提示:Materials and Methods: Cell Proliferation and Colony Formation Assays; Cell Migration and Invasion Assays |
| 信号通路检测 | EGF刺激浓度、处理时间、抗体稀释比例、免疫印迹条件 阅读提示:Materials and Methods: Immunoblot Assay; Results: OTUD7B Promotes p-Akt Level in NSCLC Cell Lines |
| 血管生成实验 | ELISA检测条件、条件培养基的制备方法、管形成实验的细胞密度、Matrigel用量、观察时间 阅读提示:Materials and Methods: VEGF ELISA and Tube Formation Assay for Angiogenesis |
| 体内肿瘤模型 | 小鼠品系、性别、周龄、饲养环境、细胞注射数量、注射方式、肿瘤体积测量时间点、处死时间 阅读提示:Materials and Methods: Tumor Xenograft |
| 统计分析方法 | 统计软件版本、具体统计检验方法(t检验, ANOVA, log-rank)、显著性水平 阅读提示:Materials and Methods: Statistical Analysis |