OA对M1极化的影响
评估油酸(OA)处理是否调节M1巨噬细胞极化。
RAW264.7细胞经LPS+IFN-γ极化,同时加入或不加入OA,检测形态、M1/M2标志物表达、细胞因子分泌、ROS和溶酶体活性。
Coordinated inhibition of M1 macrophage polarization by FIT2-mediated lipid droplet biosynthesis and FABP5.
文献包含体外细胞模型(RAW264.7)、RNA-seq转录组分析、功能验证(ROS、溶酶体活性、细菌杀伤)及机制验证(FITM2/FABP5敲低),具备多个独立证据层级。
RAW264.7巨噬细胞 Edwardsiella piscicida EIB202 Salmonella enterica serovar Typhimurium SL1344 Escherichia coli DH5α
LPS浓度100 ng/mL,IFN-γ浓度20 ng/mL,处理12 h 油酸(OA)浓度10 μmol/L siRNA转染剂量40 pmol,使用RNATransMate转染试剂 细菌感染MOI为10 FITM2与FABP5单敲低及双敲低分组
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估油酸(OA)处理是否调节M1巨噬细胞极化。
RAW264.7细胞经LPS+IFN-γ极化,同时加入或不加入OA,检测形态、M1/M2标志物表达、细胞因子分泌、ROS和溶酶体活性。
验证脂滴生物合成关键蛋白FIT2是否调控M1极化。
使用siRNA敲低FITM2,确认脂滴减少,并检测M1/M2标志物表达、ROS和溶酶体活性。
鉴定脂滴调控M1极化的关键基因。
对FITM2敲低和对照细胞进行RNA-seq,鉴定差异表达基因,进行KEGG和GO富集分析,并通过RT-qPCR验证。
验证FABP5作为FIT2下游效应分子调节LD和M1极化。
单独或联合敲低FITM2和FABP5,检测LD丰度、M1/M2标志物、ROS、溶酶体活性。
研究LD积累和极化状态对巨噬细胞杀菌能力的影响。
将极化或基因敲低后的巨噬细胞感染E. piscicida等细菌,测定胞内细菌数量,并使用mCherry标记细菌验证。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养与极化诱导 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 脂多糖 | Beyotime | ST1470 | |
| 干扰素-γ | Beyotime | P5664 | |
| 油酸 | MCE | HY-N1446 | |
| siRNA转染 | RNATransMate转染试剂 | Sangon | E607402 |
| Opti-MEM培养基 | Thermo Fisher | 31985070 | |
| RNA提取与RT-qPCR | RNA提取试剂盒 | BioFlux | BSC52M1 |
| FastKing逆转录试剂盒 | TRANSGEN BIOTECH | S61204-V3 | |
| RT-qPCR | Applied Biosystems 7500实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- |
| Western blot | 裂解缓冲液 | YEASEN | 20315S05 |
| PVDF膜 | Millipore | BM4AB8360A | |
| ELISA | QuantiCyto®小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | NeoBioscience | EMC102a.96 |
| QuantiCyto®小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | NeoBioscience | EMKC006.96 | |
| 中性红染色 | 中性红染色试剂盒 | Beyotime | C0037 |
| ROS检测 | 活性氧检测试剂盒 | Beyotime | S0033S |
| LD染色 | BODIPY™ FL C16染料 | Thermo Fisher | D3821 |
| DAPI染色液 | Beyotime | C1005 | |
| 荧光成像 | 共聚焦显微镜 | Nikon | A1R |
| 细菌感染实验 | 庆大霉素 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| M1极化诱导 | RAW264.7细胞密度、LPS浓度(100 ng/mL)、IFN-γ浓度(20 ng/mL)、处理时间(12 h)、OA浓度(10 μmol/L) 阅读提示:见Materials and Methods中的“Culture of bacterial strains and macrophage cells”和“RNA extraction……”部分 |
| siRNA敲低 | siRNA剂量(40 pmol)、转染试剂(RNATransMate)、细胞数量(400,000)、FITM2和FABP5 siRNA序列 阅读提示:见Materials and Methods中的“RNA interference (siRNA) assay”和补充表S2 |
| 脂滴检测 | BODIPY FL C16稀释倍数(1:1000)、孵育时间(30 min)、固定(4%多聚甲醛15 min)、DAPI染色5 min 阅读提示:见Materials and Methods中的“Fluorescence microscopy” |
| 抗菌能力检测 | 细菌菌株(E. piscicida EIB202等)、感染MOI(10)、感染时间(2 h)、庆大霉素浓度(1000 μg/mL)处理15 min、细胞裂解液Triton X-100浓度(0.5%) 阅读提示:见Materials and Methods中的“Bacterial infection assay” |
| 统计分析 | 统计方法(单因素或双因素方差分析)、显著性阈值(P<0.05等)、重复次数(n=3) 阅读提示:见Materials and Methods中的“Statistical analysis”和图表图例 |