TAMs诱导与共培养
验证TAMs对结肠癌细胞增殖的影响。
用PMA和IL-4将U937细胞诱导为M2型巨噬细胞(TAMs),并验证CD68和CD163表达;将TAMs与HT-29和Caco-2细胞共培养,或使用TAMs条件培养基处理。
Tumor-associated macrophages (TAMs) depend on MMP1 for their cancer-promoting role.
包含体外细胞共培养、条件培养基、细胞增殖与细胞周期检测、信号通路抑制剂实验、裸鼠异种移植瘤模型、双荧光素酶报告基因和qChIP等多层级验证。
人结肠癌细胞系HT-29 人结肠癌细胞系Caco-2 U937来源的巨噬细胞 患者来源的肿瘤相关巨噬细胞 BALB/c裸鼠皮下异种移植瘤模型
TAMs诱导方法:U937细胞经PMA和IL-4处理 细胞共培养体系:Transwell 0.4 μm孔径,TAMs与HT-29/Caco-2共培养 MMP1敲低和过表达:慢病毒载体转染TAMs或U937细胞 PAR1抑制剂MK-5348和Erk1/2抑制剂SCH772984的体内、体外处理 细胞周期分析:流式细胞术检测G0/G1、S、G2/M期比例
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证TAMs对结肠癌细胞增殖的影响。
用PMA和IL-4将U937细胞诱导为M2型巨噬细胞(TAMs),并验证CD68和CD163表达;将TAMs与HT-29和Caco-2细胞共培养,或使用TAMs条件培养基处理。
明确MMP1在TAMs中的表达及其对结肠癌细胞增殖的作用。
检测TAMs与U937中MMP1/2/9的表达水平(RT-PCR、Western blot、ELISA);构建MMP1敲低或过表达的细胞,验证其对HT-29和Caco-2增殖和细胞周期的影响;使用重组人MMP1和中和抗体验证。
分析MMP1对细胞周期分布和周期相关基因表达的影响。
通过流式细胞术检测细胞周期分布;用RT-PCR和Western blot检测周期相关基因cdc2, cdc25a, CDK2, CDK4, cyclin A2, cyclin B1, cyclin D1, p21以及转录因子c-Myc、ETV4和FOXO1的表达。
验证MMP1是否通过PAR1和MAPK/Erk通路促进细胞增殖。
使用PAR1抑制剂MK-5348、PAR1 siRNA敲低、Erk1/2抑制剂SCH772984和Akt抑制剂MK-2206处理细胞,检测对增殖、细胞周期相关蛋白、磷酸化Erk1/2和Akt的影响。
验证ETV4是否能结合MMP1启动子并激活其转录,形成正反馈。
通过双荧光素酶报告基因实验检测ETV4对MMP1启动子活性的影响;通过qChIP实验验证ETV4与MMP1启动子P4片段的结合。
在体内验证MMP1/PAR1/Erk1/2轴对结肠癌肿瘤形成的作用。
将HT-29细胞与不同TAMs(shCtrl或shMMP1)共注射入裸鼠皮下,并给予PAR1抑制剂或Erk抑制剂处理,测量肿瘤体积和重量,并检测Ki67表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | HyClone | -- |
| 胎牛血清 | HyClone | -- | |
| 细胞诱导 | 佛波酯 | -- | -- |
| 白细胞介素-4 | -- | -- | |
| 细胞共培养 | Transwell小室 | Corning Life Sciences | -- |
| TAMs分离 | ACCUMAX | Sigma-Aldrich | -- |
| 40 μm细胞筛网 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 流式分析 | 抗CD68抗体 | Abcam | -- |
| ELISA | QuantiCyto®人MMP1 ELISA试剂盒 | Neobioscience | EHC134 |
| QuantiCyto®人MMP9 ELISA试剂盒 | Neobioscience | EHC115 | |
| 慢病毒包装 | 慢病毒载体 | GeneChem Co., Ltd. | -- |
| siRNA转染 | PAR1 siRNA | Genepharma Co., Ltd. | -- |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | Dojindo | -- |
| 细胞周期分析 | 核糖核酸酶A | -- | -- |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 流式细胞术 | 流式细胞仪 | BD | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 逆转录 | PrimeScript RT试剂盒 | Takara Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| RT-PCR | SYBR Premix Ex Taq II | Takara Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 核蛋白提取 | 核蛋白提取试剂盒 | Abcam | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce | -- |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| 化学发光HRP底物 | Millipore | -- | |
| Western blot成像系统 | -- | -- | |
| 图像分析 | Image软件 | National Institutes of Health | -- |
| 双荧光素酶报告基因 | pGL3.0 Basic载体 | Promega | -- |
| pTK-RL质粒 | -- | -- | |
| qChIP | EZ-ChIP试剂盒 | Millipore | -- |
| 抗ETV4抗体 | -- | -- | |
| IgG阴性对照抗体 | -- | -- | |
| 体内实验 | MK-5348 | -- | -- |
| SCH772984 | -- | -- | |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与诱导 | U937细胞经PMA(10 ng/mL)和IL-4(10 ng/mL)处理诱导为TAMs;细胞培养条件为DMEM+10% FBS,5% CO2,37°C。 阅读提示:见Materials and methods中'Cell cultures'和'Activated macrophage induction and co-culture' |
| 共培养和条件培养基 | 共培养使用0.4 μm孔径Transwell;条件培养基浓度(0、25、50、75%)和处理时间(72、96小时)。 阅读提示:见Materials and methods中'Co-culture'和'Conditioned media collection'以及Figure 1E |
| MMP1敲低/过表达 | MMP1 shRNA和过表达慢病毒载体转染效率;验证敲低和过表达效果。 阅读提示:见Materials and methods中'Vector construction and transfection'和Figure 2D,E |
| 信号通路抑制实验 | PAR1抑制剂MK-5348、Erk抑制剂SCH772984、Akt抑制剂MK-2206的使用浓度和处理时间;PAR1 siRNA转染效率。 阅读提示:见Materials and methods中'Vector construction and transfection'和Results部分 |
| 细胞周期分析 | 细胞周期检测步骤:PI染色和流式细胞术;细胞密度(1×10^5细胞/孔)。 阅读提示:见Materials and methods中'Cell growth, cell viability, and cell cycle assays' |
| 体内异种移植瘤实验 | 裸鼠品系(BALB/c nude, 5周龄, 雌性),每组5只;细胞注射数量(5×10^6);药物给药剂量和频率(腹腔注射,每3天一次)。 阅读提示:见Materials and methods中'Nude mouse xenograft assay' |