建立H1N1感染模型并检测HIF-1α表达
确认H1N1感染对HIF-1α表达和定位的影响,并建立后续实验基础。
用H1N1病毒(1000 pfu/小鼠)感染C57BL/6小鼠,或MOI=1感染A549细胞,检测HIF-1α mRNA和蛋白水平及亚细胞定位。
HIF-1α promotes virus replication and cytokine storm in H1N1 virus-induced severe pneumonia through cellular metabolic reprogramming.
包含体内小鼠模型(HIF-1α敲低、2-DG、奥司他韦处理)和体外A549细胞模型,并进行功能验证(病毒复制、细胞因子)和机制验证(HK2、MAVS/RIG-I)。
A549细胞(肺泡上皮细胞) C57BL/6小鼠(H1N1感染模型) Spc-Cre+HIF-1αfl/+小鼠 HEK293T细胞(共转染实验)
H1N1病毒感染剂量:1000 pfu/只(小鼠)或MOI=1(A549细胞) HIF-1α敲低方式:鼻滴AAV6-shHIF-1α(30 μL/鼻孔,1.0×10^12 vg/mL)或siRNA转染(100 pmol/孔) 2-DG处理:体内500 mg/kg腹腔注射,体外10 mmol/L处理48 h 奥司他韦剂量:30或60 mg/kg灌胃,每12小时一次 检测时间点:感染后1、3、5天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认H1N1感染对HIF-1α表达和定位的影响,并建立后续实验基础。
用H1N1病毒(1000 pfu/小鼠)感染C57BL/6小鼠,或MOI=1感染A549细胞,检测HIF-1α mRNA和蛋白水平及亚细胞定位。
验证HIF-1α对病毒复制、细胞因子风暴和存活率的影响。
通过AAV6-shHIF-1α或siRNA敲低HIF-1α,在体内(小鼠)和体外(A549细胞)感染H1N1,检测病毒RNA(M基因)、NP蛋白、炎症因子(IL-1β、IL-6、TNF-α)和IFN-α/β水平,并观察小鼠存活率。
确定HIF-1α通过HK2促进糖酵解,并影响病毒复制和炎症反应。
检测HIF-1α敲低后乳酸和ATP水平,以及HK2表达;siRNA敲低HK2后检测病毒复制和炎症因子;在HIF-1α敲低细胞中过表达HK2,检测乳酸、ATP、病毒载量和炎症因子。
验证糖酵解在H1N1所致肺炎中的作用。
使用2-DG抑制糖酵解,在体内和体外感染H1N1后,检测肺组织病理(HE染色)、病毒载量、炎症因子和IFN-α/β水平。
验证HIF-1α/HK2轴产生的乳酸通过MAVS/RIG-I信号抑制IFN产生。
通过Co-IP检测MAVS和RIG-I相互作用,免疫荧光观察共定位;在HIF-1α敲低细胞中外加乳酸,检测病毒复制、炎症因子和IFN-α/β。
探索奥司他韦治疗是否抑制HIF-1α表达。
用奥司他韦(低或高剂量)处理H1N1感染小鼠和A549细胞,检测HIF-1α蛋白表达和肺损伤。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | F-12K培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 药物处理 | L-乳酸钠 | Sigma-Aldrich | -- |
| 2-脱氧-D-葡萄糖 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 奥司他韦 | YiChang HEC ChangJiang Pharmaceutical Co., Ltd. | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RNA提取 | TRIzol | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RT-qPCR | Prime Script RT Master Mix | TAKARA | -- |
| SYBR Premix Ex Taq 试剂盒 | TAKARA | -- | |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| NE-PER核质蛋白提取试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| SDS-PAGE | Beyotime Biotechnology | -- | |
| 抗HIF-1α抗体 | Bioworld Technology, Inc. | BS3514 | |
| 抗HK2抗体 | Abcam | ab209847 | |
| 抗NP抗体 | GeneTex | GTX125989 | |
| 抗IFN-α抗体 | Novusbio | NBP2-75930 | |
| 抗IFN-β抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-20390 | |
| 抗MAVS抗体 | Abcam | ab31334 | |
| 抗RIG-I抗体 | Santa Cruz | sc-376845 | |
| 抗Lamin B1抗体 | Thermo Fisher Scientific | 33-2000 | |
| 抗β-actin抗体 | Beyotime Biotechnology | AF0003 | |
| ECL化学发光试剂 | Millipore | -- | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Sigma-Aldrich | -- |
| BSA封闭液 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| DAPI | Beyotime Biotechnology | -- | |
| ELISA | 人/小鼠IL-1β、IL-6、TNF-α ELISA试剂盒 | Anogen | -- |
| 人HIF-1α ELISA试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 小鼠IFN-α和IFN-β ELISA试剂盒 | Neobioscience | -- | |
| 乳酸测定 | 乳酸检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- |
| ATP测定 | ATP检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| Co-IP | Protein A/G琼脂糖 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 动物实验 | Zoletil 50 | -- | -- |
| AAV6-shHIF-1α | Shandong ViGene Biosciences | -- | |
| 细胞转染 | 靶向HIF-1α或HK2的siRNA | GenePharma | -- |
| HK2质粒 | Genechem | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立与处理 | 小鼠品系、周龄、性别、体重;HIF-1α敲低方法(AAV6-shHIF-1α剂量和给药方式);病毒株和感染剂量;药物剂量和给药途径(奥司他韦、2-DG) 阅读提示:Methods 2.1 (Animals and treatment) 和 Figure legends (Fig.1, Fig.4, Fig.6) |
| 细胞培养与感染 | 细胞系来源;培养基和血清;感染MOI和孵育时间;病毒感染后的维持培养基成分;细胞转染条件(siRNA/质粒浓度和转染试剂) 阅读提示:Methods 2.2 (Cell culture and treatment) 和 2.3 (Cell transfection) |
| 基因表达检测 | RNA提取方法、反转录试剂、PCR体系;Western blotting抗体稀释度、蛋白上样量;免疫荧光固定和通透条件 阅读提示:Methods 2.4 (Real-time quantitative PCR), 2.5 (Western blotting), 2.6 (Immunofluorescence analysis) |
| 细胞因子和代谢物检测 | ELISA试剂盒来源;样本制备方法;乳酸和ATP检测试剂盒及操作步骤;样品重复数 阅读提示:Methods 2.7 (ELISA), 2.9 (Lactate and ATP measurement) |
| 机制验证(Co-IP) | 细胞裂解和免疫沉淀条件;抗体使用量;洗涤次数和检测方法 阅读提示:Methods 2.10 (Coimmunoprecipitation) |
| 统计与分析 | 统计方法(t-test, ANOVA);显著性阈值;重复实验次数 阅读提示:Methods 2.11 (Statistical analysis) |