细胞感染与粘附表型分析
评估ataT缺失对EHEC粘附能力和宿主炎症反应的影响。
用EHEC野生型(WT)、ΔataT和ΔataR感染HT-29细胞,检测粘附菌数、IL-8分泌水平和A/E病变。
AtaT Improves the Stability of Pore-Forming Protein EspB by Acetylating Lysine 206 to Enhance Strain Virulence.
包含细胞感染模型、小鼠感染模型、体外乙酰化与降解实验、体内稳定性实验、转位实验、点突变与功能验证等多个独立证据层级。
HT-29细胞感染模型 BALB/c小鼠感染模型 HeLa细胞转位模型
ataT和ataR基因敲除突变株(ΔataT、ΔataR) 感染复数(MOI=10) II型分泌系统(T3SS)转位检测(Tir-TEM1报告系统) EspB K206位点突变(K206Q、K206R、K206A)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估ataT缺失对EHEC粘附能力和宿主炎症反应的影响。
用EHEC野生型(WT)、ΔataT和ΔataR感染HT-29细胞,检测粘附菌数、IL-8分泌水平和A/E病变。
评估ataT在体内对细菌定植和结肠炎症的影响。
用链霉素预处理BALB/c小鼠,口服感染WT、ΔataT和ΔataR,检测粪便排菌量、血清KC水平和结肠病理损伤。
鉴定AtaT的乙酰化底物,确认EspB为特异性底物。
将EspB等粘附蛋白与AtaT共表达,通过抗乙酰化抗体检测乙酰化水平。
验证乙酰化对EspB蛋白稳定性的影响。
将纯化的EspB和EspB-Ac暴露于EHEC蛋白酶,并检测EHEC内EspB的半衰期。
检测EspB乙酰化对T3SS效应子转位的影响。
使用Tir-TEM1报告系统,感染HeLa细胞后检测β-内酰胺酶活性。
确定AtaT介导的乙酰化位点,并验证其对蛋白稳定性和毒力的影响。
通过质谱鉴定乙酰化位点,构建点突变体(K206Q、K206R、K206A等),检测蛋白稳定性、粘附能力和炎症反应。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 10099141C |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 细胞感染 | 胰蛋白酶 | Gibco | 25200072 |
| RNA提取与qPCR | 总RNA提取试剂盒 | Trans | ER501-01 |
| 反转录试剂盒 | Trans | AT341-02 | |
| 实时荧光定量PCR试剂盒 | Trans | AQ131-03 | |
| 细胞因子检测 | IL-8 ELISA试剂盒 | NeoBioscience | EHC008.96 |
| 免疫荧光 | 抗大肠杆菌O157抗体 | Abcam | ab156617 |
| Alexa Fluor 488标记山羊抗小鼠IgG | Invitrogen | A-11029 | |
| Alexa Fluor 647标记鬼笔环肽 | Invitrogen | A30107 | |
| DAPI | Solarbio | C0065 | |
| 显微镜观察 | 蔡司LSM880激光共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
| 动物实验 | 链霉素 | -- | -- |
| 小鼠KC ELISA试剂盒 | NeoBioscience | EMC104.96 | |
| 蛋白表达 | 异丙基β-D-1-硫代半乳糖苷 | -- | -- |
| L-阿拉伯糖 | -- | -- | |
| 氯霉素 | -- | -- | |
| 卡那霉素 | -- | -- | |
| 安普霉素 | -- | -- | |
| 蛋白纯化 | Ni-NTA树脂 | -- | -- |
| 盐酸胍 | -- | -- | |
| 尿素 | -- | -- | |
| 蛋白降解 | 壮观霉素 | -- | -- |
| 转位实验 | CCF2/AM溶液 | Invitrogen | K1023 |
| 乙酰化检测 | 抗乙酰化赖氨酸抗体 | CST | 9441 |
| 抗His抗体 | CST | #12698 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞感染实验 | HT-29细胞数量、MOI、感染时间、胰蛋白酶和Triton X-100处理浓度和时间 阅读提示:Methods: Cellular Infection; Figure 1 |
| 小鼠感染实验 | 小鼠品系、性别、体重、链霉素预处理剂量和时间、感染剂量、粪便排菌量检测时间点、KC检测时间点 阅读提示:Methods: Mice Infection; Figure 2 |
| 乙酰化检测 | 菌株、质粒、诱导剂浓度(IPTG和L-阿拉伯糖)、共表达样品浓缩倍数 阅读提示:Methods: Acetylation Assays in vivo and in vitro; Figure 3A |
| 蛋白稳定性实验 | 体外降解的蛋白酶来源、浓度、孵育时间;体内降解的诱导时间、壮观霉素浓度、取样间隔 阅读提示:Methods: Degradation of EspB in vitro and in vivo; Figure 3B,C |
| 效应子转位实验 | HeLa细胞、MOI、感染时间、IPTG诱导时间、CCF2/AM孵育时间和浓度 阅读提示:Methods: Translocation Assay; Figure 3D |