临床样本分析
评估胰腺癌组织中CD59表达与TAM浸润的相关性及其对患者生存的影响。
收集74例PDAC患者的肿瘤及癌旁组织构建组织芯片,通过免疫组化检测CD59和CD163表达,并分析其与临床病理特征及生存的关系。
Pancreatic cancer-educated macrophages protect cancer cells from complement-dependent cytotoxicity by up-regulation of CD59.
文献包含患者组织芯片、细胞共培养、功能验证、机制验证等多层实验,且体外实验验证功能,RNA-seq及基因操作验证机制。
THP-1巨噬细胞与胰腺癌细胞共培养模型 胰腺癌组织芯片 胰腺癌细胞系(AsPC-1、BxPC-3、MiaPaCa-2等)
胰腺癌细胞系:AsPC-1、BxPC-3、MiaPaCa-2 THP-1细胞经PMA诱导为巨噬细胞,PMA浓度100 ng/mL 共培养时间:48小时 补体来源:新鲜人血清,稀释比例2:5 IL-6浓度梯度:0、0.01、1、10、100 nM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估胰腺癌组织中CD59表达与TAM浸润的相关性及其对患者生存的影响。
收集74例PDAC患者的肿瘤及癌旁组织构建组织芯片,通过免疫组化检测CD59和CD163表达,并分析其与临床病理特征及生存的关系。
验证胰腺癌教育巨噬细胞对癌细胞CD59表达的影响。
使用transwell共培养系统,将THP-1来源巨噬细胞与胰腺癌细胞共培养,通过western blot、流式细胞术和免疫荧光检测CD59表达。
确定CD59上调对补体依赖性细胞毒性(CDC)的影响。
使用siRNA敲低CD59后进行CDC实验,并通过annexin V/PI染色检测细胞死亡;同时共培养后评估细胞存活率。
探究巨噬细胞调节CD59表达的信号通路。
通过RNA-seq分析共培养后差异表达基因,关注IL-6R/STAT3通路;使用IL-6中和抗体、siRNA敲低IL-6和STAT3、AG490抑制剂验证通路。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | HyClone | -- |
| DMEM培养基 | HyClone | -- | |
| 胎牛血清 | HyClone | -- | |
| 细胞诱导 | 佛波醇12-十四酸酯13-乙酸酯 | Sigma-Aldrich | -- |
| 细胞培养 | Transwell插入物 | Corning | -- |
| siRNA转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 细胞裂解 | SDS裂解缓冲液 | -- | -- |
| Western blot | 硝酸纤维素膜 | Millipore | -- |
| ECL试剂盒 | Applygen | -- | |
| qRT-PCR | TRIzol试剂 | Takara | Cat#9108 |
| 逆转录试剂盒 | Takara | Cat. #RR037A | |
| TB Green预混Ex Taq | Takara | Cat. #RR420A | |
| 免疫荧光 | 山羊抗兔Alexa Fluor 488 IgG | Invitrogen | Cat # A-11034 |
| DAPI | -- | -- | |
| 流式分析 | 抗人CD59 FITC抗体 | Biolegend | -- |
| 抗人CD163 PerCP抗体 | Biolegend | -- | |
| FITC Annexin V凋亡检测试剂盒 | Neobioscience | -- | |
| ELISA | IL-6 ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- |
| RNA-seq | NEBNext Ultra RNA文库制备试剂盒 | NEB | -- |
| RNA Nano 6000检测试剂盒 | Agilent Technologies | -- | |
| NanoPhotometer分光光度计 | IMPLEN | -- | |
| 免疫组化 | CD59抗体 | Sigma-Aldrich | HPA026494 |
| CD163抗体 | Abcam | ab182422 | |
| Western blot | 抗GAPDH抗体 | Santa Cruz Biotechnology | FL-335 |
| 抗Arg-1抗体 | Proteintech | 16001-1-AP | |
| 抗IFN-γ抗体 | Abcam | ab9657 | |
| 抗iNOS抗体 | Abcam | ab3523 | |
| 抗IL-6抗体 | Abcam | ab6672 | |
| 抗STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | D1B2J | |
| 抗磷酸化STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | Ser727 | |
| HRP标记二抗 | Zsbio | -- | |
| 机制研究 | 重组人IL-6 | Peprotech | -- |
| IL-6中和抗体 | Abcam | ab9324 | |
| AG490 | Sigma-Aldrich | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 样本纳入标准:74例PDAC患者,年龄34-85,R0切除,未接受新辅助化疗;组织芯片构建;CD59表达评分(H-score);TAM浸润密度(CD163阳性细胞/mm²) 阅读提示:Methods: PDAC sample collection and tissue microarray construction; Immunohistochemistry (IHC) assay and evaluation |
| 细胞培养与共培养 | 胰腺癌细胞系:AsPC-1、BxPC-3、MiaPaCa-2等;THP-1细胞浓度2.5×10^5/mL,PMA诱导浓度100 ng/mL,时间24小时;共培养时间48小时;transwell孔径0.4 μm 阅读提示:Methods: Cell culture and treatment |
| siRNA敲低 | siRNA浓度50 nM;转染试剂:Lipofectamine 3000;目标序列:si-h-CD59: GGTTACAAGTGTATAACAA;si-h-IL-6: GGAGTTTGAGGTATACCTA;si-h-STAT3: CATCTGCCTAGATCGGCTA 阅读提示:Methods: siRNA transfection |
| CDC实验 | 新鲜人血清稀释比例2:5;热处理血清作为对照;细胞密度2.0×10^5/mL;孵育时间24小时;检测:annexin V/PI 阅读提示:Methods: CDC and apoptosis assays |
| 机制验证 | IL-6重组蛋白浓度:0、0.01、1、10、100 nM;STAT3抑制剂AG490浓度依赖性实验;IL-6中和抗体使用 阅读提示:Results: Pancreatic cancer-educated macrophages induced the upregulation of CD59...; Methods: Cell culture and treatment |