工程化益生菌来源的外膜囊泡作为功能性疫苗载体以增强针对SARS-CoV-2的免疫应答

Engineering probiotic-derived outer membrane vesicles as functional vaccine carriers to enhance immunity against SARS-CoV-2.

作者信息Jing Wo, Zhao-Yong Lv, Jia-Nan Sun, Hao Tang, Nan Qi, Bang-Ce Ye
PMID36510593
期刊iScience
发布时间2023-01
DOI10.1016/j.isci.2022.105772

实验完整度

包含分子构建、体外细胞实验(BMDC成熟)、动物免疫实验等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。

主要模型

Escherichia coli Nissle 1917 (EcN)及其衍生菌株 DC2.4细胞系 小鼠骨髓来源树突状细胞(BMDC) BALB/c小鼠

重点核对

OMV制备:菌株在LB培养基中37°C培养18h,诱导时加入30mM阿拉伯糖,超速离心和过滤纯化 免疫剂量:小鼠腹腔注射10μg OMV(总蛋白),RBD+Alum组为2μg RBD混合Alum,共三次(第0、10、20天) BMDC成熟实验:BMDC与PBS、LPS (0.24mg/mL)、RBD (100ng/mL)、WT-OMVs (25μg/mL)或NR-OMVs (25μg/mL)共培养12h 表面展示验证:Proteinase K处理OMVs后检测荧光或ELISA,以确认抗原定位

摘要

由于SARS-CoV-2变异株的持续出现,如何高效展示多价抗原引起了人们的极大兴趣。细菌外膜囊泡(OMVs)因其自佐剂特性和可修饰抗原的能力,可作为一种有吸引力的疫苗递送系统。在此,我们基于工程化OMVs建立了一个双价抗原展示平台,使用mCherry和GFP,并证明了SARS-CoV-2的两种不同抗原可以同时呈现在OMVs的腔隙和表面。比较免疫原性时,ClyA-NG06融合蛋白和棘突蛋白的受体结合域(RBD)在OMV腔隙中诱导了比单独展示ClyA-NG06融合蛋白或RBD的OMVs更强的小鼠体液免疫应答。总之,我们提供了一种在同一个OMV的腔隙和表面展示SARS-CoV-2抗原的有效方法,并强调了OMVs作为通用多抗原载体的潜力。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
如何利用工程化细菌外膜囊泡(OMVs)同时展示SARS-CoV-2的多个抗原,并增强其免疫原性?
核心机制
OMVs的周质表达系统(OmpA信号肽)有助于RBD的正确折叠,通过ClyA融合在表面展示NG06,协同增强抗体应答。
主要证据
NR-OMVs(腔内RBD,表面NG06)免疫小鼠后,产生比单独NG06-OMVs或RBD-OMVs更强的抗RBD IgG抗体应答,且优于RBD+Alum组。
研究意义
为开发基于OMVs的多抗原疫苗载体提供了一种有效策略,具有作为通用多抗原载体的潜力。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

构建OMV腔内表达平台

比较三种腔内表达模式(OmpA-SP、Lpp-SP+C、OmpA(1-199aa))的载量效率

通过Red/ET方法将mCherry融合基因整合到EcN基因组,分别构建OSm-OMVs、LSm-OMVs、OLm-OMVs,检测荧光强度。

2

构建双抗原展示OMV(mG-OMV)

验证OMV表面和腔内能否同时展示两种不同抗原

通过质粒pBAD24表达ClyA-GFP融合蛋白,与腔内表达mCherry的EcN-NM菌株组合,纯化后通过Western blot和荧光分析确认。

3

构建NR-OMV疫苗候选物

将SARS-CoV-2 RBD(腔内)和NG06(表面)共展示在OMV上

通过周质表达将RBD装载到OMV腔内,利用ClyA-NG06融合展示在表面,通过Western blot和ELISA验证。

4

体外BMDC成熟实验

评估NR-OMVs是否能被树突状细胞摄取并促进其成熟

用DiD标记的OMV与DC2.4共培养,流式检测摄取;将BMDC与PBS、LPS、RBD、WT-OMVs、NR-OMVs共培养,检测CD86、MHC-II表达和细胞因子分泌。

5

小鼠免疫实验

评估NR-OMVs诱导的体液免疫应答

BALB/c小鼠腹腔注射不同疫苗,第0、10、20天免疫,第10、30天采血,ELISA检测抗RBD IgG滴度。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
SARS-CoV-2 (2019-nCoV) Spike RBD抗体SinoBiological40592-T62
GFP标签单克隆抗体Proteintech66002-1-Ig
mCherry多克隆抗体Proteintech26765-1-AP
山羊抗兔IgG-HRPProteintechSA00001-2
PE抗小鼠CD11cTONBO50-0114-U100
APC-CD86单克隆抗体eBioscience17-0862-81
FITC-MHC II类单克隆抗体eBioscience11-5321-81
大肠杆菌DH5αBiobwBio82081
大肠杆菌MG1655BiobwBio82268
大肠杆菌Nissle 1917BiobwBio089890
重组SARS-CoV-2 Spike RBD蛋白Sangon BiotechC500304-0001
DiD细胞标记液Thermo FisherV22887
FastDigest HindIIIThermo FisherFD0505
FastDigest NcoIThermo FisherFD0574
四水合钼酸铵SolarbioA7120
Phanta Max超保真DNA聚合酶VazymeP505-d1
蛋白酶KTransGenGE201-01
10×PBS缓冲液SolarbioP1002
蛋白质分子量标准Thermo Fisher26617
牛血清白蛋白SolarbioA8010
脂多糖SolarbioL8880
胎牛血清BIOIND04-001-1A
RPMI 1640培养基Gibco11875176
胰蛋白酶-EDTAGibco25200072
青霉素-链霉素溶液SolarbioP1400
粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子PeproTech96-315-03–5
白细胞介素-4PeproTech96-214-14–5
红细胞裂解液BeyotimeC3702
50×TAE缓冲液Sangon BiotechB548101-0500
L-(+)-阿拉伯糖Sangon BiotechA610071-0025
LumiQ HRP底物溶液ShareBioSB-WB012
质粒提取试剂盒TIANGENDP103
凝胶回收试剂盒TIANGENDP219
Hieff Clone® Plus多片段一步克隆试剂盒YEASEN10912ES10
细菌膜囊泡分离试剂盒RENGENBacMv40-10
小鼠TNF-α ELISA试剂盒QuantiCytoEMC102a
小鼠IL-6 ELISA试剂盒QuantiCytoECM004.96
SARS-CoV-2 (2019-nCoV) Spike RBD抗体滴度检测试剂盒SinoBiologicalKIT006
细胞计数试剂盒(CCK-8)YEASEN40203ES60
BCA蛋白定量试剂盒BeyotimeP0012
BMDC,BALB/c血浆Ziyuan Laboratory Animal Science and Technology Co. Ltd.--
DC2.4细胞KeyGEN BiotechKG581
BALB/c小鼠Ziyuan Laboratory Animal Science and Technology Co. Ltd.--
质粒pBAD-ClyA-GFP----
质粒pBAD-ClyA-NG06----
质粒pBAD-ClyA-RBD----
质粒pBAD24MiaolingbioP0082
质粒pKD46MiaolingbioP0098
质粒pKD3MiaolingbioP0095
质粒pET28a(+)-GFPMiaolingbioP0024
质粒pET28a(+)-mCherry----
质粒pSET152----
ZetaView PMX110纳米颗粒跟踪分析仪Particle Metrix--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
菌株构建
菌株EcN、EcNΔnlpI、EcN-LSm等构建方法,使用Red/ET重组和pKD46质粒,需验证敲除或插入的正确性
阅读提示:STAR★Methods - Construction of plasmids and deletion mutants
OMV制备
培养条件(LB培养基,37°C,18h)、诱导剂浓度(30mM阿拉伯糖)、纯化方法(0.22μm过滤、100kDa超滤、OMV分离试剂盒)
阅读提示:STAR★Methods - Preparation of OMVs
抗原定位验证
Western blot检测ClyA-GFP、OmpA-mCherry、RBD、NG06;Proteinase K处理验证表面与腔内定位
阅读提示:STAR★Methods - Western blot analysis, Proteinase K treatment assay
BMDC成熟实验
BMDC获取方法、刺激物浓度(LPS 0.24mg/mL, RBD 100ng/mL, OMV 25μg/mL)、共培养时间12h、流式抗体(CD11c, CD86, MHC-II)、细胞因子检测(IL-6, TNF-α)
阅读提示:STAR★Methods - Acquisition and maturation of BMDCs
小鼠免疫实验
BALB/c小鼠品系、周龄、性别(8周龄雌性)、免疫剂量(10μg OMV,RBD+Alum为2μg RBD+Alum)、免疫途径(腹腔注射)、免疫时间(0,10,20天)、采血时间(10,30天)、每组动物数量(n=6)
阅读提示:STAR★Methods - Mouse immunization