患者组织中坏死性凋亡标志物检测
评估HNSCC患者肿瘤组织中坏死性凋亡的存在及程度
对191例HNSCC患者肿瘤及癌旁组织进行免疫组化染色检测p-MLKL、MLKL表达,并与H&E染色对照评估坏死形态。
Necroptosis in head and neck squamous cell carcinoma: characterization of clinicopathological relevance and in vitro cell model.
研究包含患者组织免疫组化、WB分析及预后生存分析,并利用细胞系、抑制剂、基因敲除/过表达建立和验证坏死性凋亡模型,涵盖体外功能与机制验证。
SCC25和FaDu HNSCC细胞系 HNSCC患者组织样本 HT29结直肠癌细胞系(阳性对照)
TSZ处理浓度:TNF-α 30 ng/ml、Smac mimetic 1 μM、zVAD-fmk 50 μM(SCC25)或100 μM(FaDu) TSZ处理时间:SCC25 24小时,FaDu 48小时 坏死性凋亡抑制:Nec-1 10 μM,GSK'872 5 μM,NSA 1 μM MLKL敲低慢病毒载体psi-LVRU6P-MLKL,puromycin筛选浓度1-2 μg/ml DAMP收集:SCC25 TSZ处理8小时,FaDu 24小时后换液再培养8或12小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估HNSCC患者肿瘤组织中坏死性凋亡的存在及程度
对191例HNSCC患者肿瘤及癌旁组织进行免疫组化染色检测p-MLKL、MLKL表达,并与H&E染色对照评估坏死形态。
量化坏死性凋亡在肿瘤坏死中的比例,并分析其与患者预后的关系
对40例患者的连续切片进行p-MLKL和H&E染色,计数坏死灶;对191例患者进行Kaplan-Meier生存分析和Cox回归分析。
在HNSCC细胞系中诱导并验证坏死性凋亡
用TSZ处理SCC25和FaDu细胞,通过PI染色、Western blot检测p-MLKL、cleaved caspase-3,AO-PI染色和TEM观察形态,并使用Nec-1、GSK'872、NSA抑制验证通路。
验证MLKL是否为TSZ诱导坏死性凋亡的关键执行分子
构建MLKL敲低和过表达稳定细胞系,检测TSZ处理后p-MLKL水平及细胞死亡率。
探讨坏死性凋亡释放的DAMPs是否促进HNSCC细胞迁移和侵袭
收集TSZ处理后的条件培养基,处理正常SCC25、FaDu及TSZ不敏感细胞,通过Transwell实验检测迁移和侵袭能力,并ELISA检测DAMPs浓度。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12 1:1培养基 | Gibco | -- |
| MEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 氢化可的松 | Solarbio | -- | |
| 药物处理 | 肿瘤坏死因子-α | PeproTech | -- |
| Smac模拟物AT-406 | Selleck Chemicals | -- | |
| zVAD-fmk | Selleck Chemicals | -- | |
| Necrostatin-1 | Selleck Chemicals | -- | |
| GSK'872 | Selleck Chemicals | -- | |
| 坏死磺酰胺 | Selleck Chemicals | -- | |
| Western blot | 抗RIP1抗体 | Cell Signaling Technology | 3493 |
| 抗p-RIP1抗体 | Cell Signaling Technology | 44590 | |
| 抗RIP3抗体 | Cell Signaling Technology | 13526 | |
| 抗p-RIP3抗体 | Cell Signaling Technology | 93654 | |
| 抗cleaved caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661 | |
| 抗β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 12620 | |
| 抗MLKL抗体 | Abcam | ab184718 | |
| 抗磷酸化MLKL抗体 | Abcam | ab187091 | |
| 抗GAPDH抗体 | CWBIO | CW0100M | |
| 细胞死亡检测 | 碘化丙啶 | BD Biosciences | -- |
| 吖啶橙 | Solarbio | -- | |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白测定试剂盒 | CWBIO | -- |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| Immobilon ECL Ultra Western HRP底物 | Millipore | -- | |
| GeneGnome XRQ系统 | Syngene | -- | |
| 细胞培养 | 嘌呤霉素 | -- | -- |
| RNA提取 | RNAzol试剂 | Molecular Research Center | -- |
| RNA定量 | NanoDrop2000分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RT-qPCR | PrimeScript RT试剂盒 | Takara | -- |
| SYBR PrimeScript RT-PCR试剂盒 | Roche | -- | |
| 基因敲低 | psi-LVRU6P-MLKL质粒 | GeneCopoeia | -- |
| Lenti-Pac FIV表达包装试剂盒 | GeneCopoeia | -- | |
| 细胞增殖 | CCK-8细胞计数试剂盒 | Dojindo | -- |
| Transwell实验 | Matrigel基质胶 | BD Biosciences | -- |
| ELISA | 人IL-1β ELISA试剂盒 | NeoBioscience | -- |
| 人IL6 ELISA试剂盒 | NeoBioscience | -- | |
| 人IL8 ELISA试剂盒 | NeoBioscience | -- | |
| 人HMGB1 ELISA试剂盒 | Telenbiotech | -- | |
| 流式细胞术 | Cytoflex流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
| 透射电镜 | JEM-1400透射电子显微镜 | JEOL | -- |
| 荧光显微镜 | Axio显微镜 | Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者组织样本 | 患者来源、手术时间、是否术前治疗、伦理审批号 阅读提示:Methods and materials: Patients and tissue samples |
| 免疫组化 | 抗原修复条件、抗体浓度、评分标准 阅读提示:Methods and materials: Immunohistochemistry |
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基、FBS浓度、氢化可的松浓度 阅读提示:Methods and materials: Cell culture and reagents |
| TSZ处理 | TNF-α、Smac mimetic、zVAD-fmk浓度,处理时间 阅读提示:Methods and materials: Induction/inhibition of necroptosis |
| 坏死性凋亡抑制 | Nec-1、GSK'872、NSA浓度 阅读提示:Methods and materials: Induction/inhibition of necroptosis |
| DAMP收集 | 处理时间、换液时间、收集时间、离心条件 阅读提示:Methods and materials: Collection of DAMPs |
| Transwell实验 | 细胞种密度、趋化时间、基质胶浓度 阅读提示:Methods and materials: Transwell migration and invasion assay |