临床样本分析
检测SCG2在CRC组织和配对正常组织中的表达,并分析其与预后的关系。
通过IHC染色检测270例CRC组织和115例正常肠组织中SCG2表达,并分析其与无病生存期和总生存期的相关性。
Secretogranin II impairs tumor growth and angiogenesis by promoting degradation of hypoxia-inducible factor-1α in colorectal cancer.
研究包含临床样本分析、细胞实验、动物模型(皮下移植瘤和Matrigel plug实验)以及机制验证(RNA-seq、Co-IP等),明确功能验证和机制验证。
SW620和RKO结直肠癌细胞系 BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型 HUVEC血管生成模型 270例CRC临床组织样本(HXCRC队列)
SCG2在CRC组织和细胞系中的表达水平 SCG2过表达对肿瘤生长和血管生成的影响(肿瘤体积和重量) VEGF表达在SCG2抑制血管生成中的作用(通过rescue实验) SCG2与VHL的相互作用及HIF-1α降解(Co-IP和MG132处理) SCG2蛋白治疗的体内效果(10μg/次,第8、10、12天瘤内注射)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测SCG2在CRC组织和配对正常组织中的表达,并分析其与预后的关系。
通过IHC染色检测270例CRC组织和115例正常肠组织中SCG2表达,并分析其与无病生存期和总生存期的相关性。
验证SCG2在体内对CRC肿瘤生长的功能。
使用慢病毒系统在SW620和RKO细胞中稳定过表达SCG2,注射入裸鼠皮下建立移植瘤模型,检测肿瘤体积和重量。
确定SCG2对肿瘤血管生成的影响。
通过CD31 IHC染色、Matrigel plug实验、HUVEC管形成和侵袭实验评估血管生成。
探索SCG2抑制血管生成的分子机制。
对SW620-Ctrl和SW620-SCG2肿瘤进行mRNA测序,筛选差异表达基因并进行KEGG通路富集分析。
验证SCG2是否通过抑制VEGF表达来抑制血管生成。
通过qPCR、Western blot、ELISA和IHC检测VEGF的表达,并通过rescue实验验证VEGF在SCG2抑制血管生成中的作用。
阐述SCG2调节VEGF表达的分子机制。
通过Western blot检测HIF-1α和HIF-1β表达,使用MG132抑制蛋白酶体,Co-IP检测SCG2与VHL和HIF-1α的相互作用,DMOG处理验证HIF-1α的作用。
评估SCG2蛋白对CRC肿瘤生长的影响。
在SW620移植瘤模型中,于细胞注射后第8、10、12天瘤内注射SCG2蛋白(10μg/次),对照组注射IgG,比较肿瘤体积和重量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| MEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| EGM培养基 | Merck Millipore | -- | |
| 慢病毒感染 | 慢病毒SCG2过表达系统 | Gene Pharma | -- |
| 空载体对照 | Gene Pharma | -- | |
| 药物处理 | 嘌呤霉素 | -- | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Merck Millipore | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 聚偏二氟乙烯膜 | Merck Millipore | -- | |
| 化学发光试剂盒 | Merck Millipore | -- | |
| 动物实验 | 基质胶 | Merck Millipore | -- |
| SCG2蛋白 | ProteinTech | -- | |
| 对照IgG | ProteinTech | -- | |
| 组织学染色 | 抗SCG2抗体 | Life Span Biosciences | LS-B10869 |
| 抗HIF-1α抗体 | Abcam | ab51608 | |
| 抗VEGF抗体 | Abcam | ab150375 | |
| 抗CD31抗体 | Abcam | ab28364 | |
| 二抗 | Zsbio | -- | |
| Texas Red偶联二抗 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| DAPI | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 显微镜 | BX 51显微镜 | Olympus | -- |
| HUVEC实验 | Transwell小室 | Corning | 8.0 µm |
| 结晶紫溶液 | Beyotime | -- | |
| 中性树胶 | Beyotime | -- | |
| RNA提取和qPCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| PrimeScript RT试剂盒(去除gDNA) | Takara | RR047B | |
| TB绿预混Ex TaqII | Takara | RR820A | |
| CF96定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| RNA测序 | RNA Nano 6000分析试剂盒 | Agilent | -- |
| Bioanalyzer 2100系统 | Agilent | -- | |
| ELISA | VEGF ELISA试剂盒 | NeoBioscience | -- |
| 免疫共沉淀 | PureProteome蛋白A和蛋白G磁珠 | Merck Millipore | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | SCG2蛋白表达水平(低/高),IHC染色条件,生存分析分组和统计方法 阅读提示:Methods 2.1, Results 3.1, Figure 1 |
| 细胞培养和处理 | 细胞系来源,培养基,血清浓度,MOI=20,嘌呤霉素浓度2 μg/mL,感染筛选时间 阅读提示:Methods 2.2 |
| Western blot | 蛋白上样量10 μg,SDS-PAGE浓度,一抗孵育条件,二抗孵育温度和时间 阅读提示:Methods 2.3 |
| 动物实验 | 小鼠品系和年龄、细胞注射数量、肿瘤体积测量和计算、SCG2蛋白剂量和注射时间 阅读提示:Methods 2.4, Results 3.2, 3.7, Figures 2, 7 |
| 组织学染色 | 切片厚度、抗原修复条件、抗体浓度(未明确) 阅读提示:Methods 2.5 |
| HUVEC管形成和侵袭实验 | 细胞数量、Matrigel体积和浓度、培养时间 阅读提示:Methods 2.6, Results 3.3 |
| RNA提取和qPCR | RNA用量、反转录试剂盒、qPCR试剂、内参基因GAPDH 阅读提示:Methods 2.7 |
| ELISA | 样本收集条件、ELISA试剂盒 阅读提示:Methods 2.8 |
| 免疫共沉淀 | 抗体(SCG2和VHL)、磁珠类型、裂解缓冲液 阅读提示:Methods 2.9 |
| 机制研究 | MG132处理时间(4小时)、DMOG浓度(未明确)和处理时间(24小时) 阅读提示:Results 3.5, Figure 5 |