人牙囊干细胞来源外泌体通过抑制牙周膜细胞焦亡减少牙根吸收

Human dental follicle stem cell-derived exosomes reduce root resorption by inhibiting periodontal ligament cell pyroptosis.

作者信息Xinyi Li, Xinyang Liu, Jianing Zhou, Ping Zhang, Song Chen, Ding Bai
PMID39985080
发布时间2025-02-21
DOI10.1186/s13287-025-04216-6

实验完整度

高

研究包含体外PDLC共培养、THP1极化与破骨分化、大鼠RR模型体内验证、外泌体miRNA测序及机制验证(荧光素酶报告、MSP),多层证据并包含功能与机制验证。

主要模型

人牙囊干细胞及人牙周膜细胞 大鼠牙根吸收模型 THP1细胞来源巨噬细胞 HEK293细胞

重点核对

动物分组:56只雄性Wistar大鼠随机分为8组,每组7只 加力方式:大鼠左侧上颌第一磨牙与切牙间施加100 g力,持续21天 外泌体注射:每两天向牙周膜注射10 μL(20 μg)外泌体 miR-140-3p抑制剂注射:每两天注射0.5 nmol抑制剂 PDLC力学刺激:2 g/cm²压缩力作用12小时

摘要

背景:探讨牙囊干细胞来源的外泌体(DFSC-Exos)通过抑制牙周膜细胞(PDLC)焦亡减少破骨细胞生成和牙根吸收(RR)的治疗效果及机制。方法:将DFSC-Exos(有力刺激的Force-Exos或无刺激的Ctrl-Exos)与人口腔PDLC共培养,并在建立RR模型后注射到大鼠牙周膜(PDL)中。随后,检测吸收体积、PDLC焦亡比例及NLRP3介导的焦亡通路激活,以研究DFSC-Exos对RR期间PDLC焦亡的治疗作用。此外,M1/M2巨噬细胞数量、破骨细胞形成和transwell极化实验阐明了Force-Exo处理通过抑制焦亡在巨噬细胞极化和破骨细胞生成中的作用。外泌体miRNA测序和生物信息学分析用于鉴定差异丰富的外泌体来源miRNA,以及miRNA调控的主要生物学过程和通路。给予miRNA抑制剂进一步验证了外泌体miRNA通过调节焦亡对RR的调控。此外,探索了涉及候选miRNA和相关通路的潜在机制。结果:力刺激DFSCs释放的外泌体(Force-Exos)抑制NOD样受体3(NLRP3)介导的PDLC焦亡,进而影响M1巨噬细胞活化和破骨细胞形成。基于外泌体miRNA测序,Force-Exos中的miR-140-3p被转移到PDLCs中,给予miR-140-3p抑制剂显著逆转了Force-Exos引起的PDLC焦亡减少、M1巨噬细胞极化、破骨细胞数量和吸收体积的减少。更重要的是,机制研究表明miR-140-3p通过靶向DNA甲基转移酶1(DNMT1)改变PDLCs中细胞因子信号传导抑制因子(SOCS1)的DNA甲基化和下游核因子κB(NF-κB)信号通路来介导Force-Exos的功能。用DFSC来源的外泌体miR-140-3p阻断DNMT1/SOCS1/NFκB轴可下调NLRP3介导的PDLC焦亡,进而影响M1极化和破骨细胞形成,从而减轻RR。结论:DFSC-Exos通过miR-140-3p阻断DNMT1/SOCS1/NFκB轴下调NLRP3介导的PDLC焦亡,进而影响M1极化和破骨细胞形成,从而减轻RR。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
牙囊干细胞来源外泌体是否以及如何通过抑制牙周膜细胞焦亡减少牙根吸收?
核心机制
Force-Exos中的miR-140-3p靶向DNMT1,下调SOCS1启动子甲基化,上调SOCS1表达,抑制NF-κB信号通路,从而下调NLRP3介导的PDLC焦亡,减少M1极化及破骨细胞形成,最终减轻牙根吸收。
主要证据
体内大鼠RR模型显示Force-Exos减少吸收体积、TRAP阳性破骨细胞数和PDLC焦亡;体外共培养显示抑制NLRP3通路蛋白表达、M1/M2比率及破骨细胞分化;miR-140-3p抑制剂逆转这些效应,双荧光素酶报告实验证实miR-140-3p直接靶向DNMT1。
研究意义
该研究突出了外泌体介导的表观遗传调控改善牙周炎性微环境的潜力,为预防和治疗破骨细胞引发的牙根吸收提供了新途径。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

外泌体分离与表征

验证DFSC-Exos的物理特性和标志物表达

从有无力学刺激的DFSC培养上清中通过超速离心分离外泌体;通过Western blot检测CD9、CD63、TSG101,TEM观察形态,NTA分析粒径和分布。

2

体外PDLC焦亡模型

评估Force-Exos对PDLC焦亡的抑制作用

PDLCs与外泌体共培养后施加压缩力,通过Hoechst/PI染色、流式细胞术检测焦亡比例,Western blot检测NLRP3、caspase-1、GSDMD等蛋白,ELISA检测IL-1β分泌。

3

体内大鼠牙根吸收模型

验证Force-Exos在体内对牙根吸收的影响

建立大鼠正畸力诱导的RR模型,注射PBS、Ctrl-Exos或Force-Exos,通过micro-CT检测吸收体积,TRAP染色计数破骨细胞,TUNEL和免疫荧光检测PDLC焦亡,免疫组化检测IL-1β和IL-18。

4

巨噬细胞极化与破骨细胞形成评估

探究Force-Exos抑制焦亡后对巨噬细胞极化和破骨细胞生成的影响

通过transwell共培养THP1巨噬细胞与处理后的PDLCs,流式检测M1/M2比例;通过TRAP染色和Western blot检测破骨细胞标志物(NFAT2、MMP9、CTSK)评估破骨分化。

5

外泌体miRNA测序及功能验证

鉴定Force-Exos中差异miRNA及其功能

对Ctrl-Exos和Force-Exos进行miRNA测序,筛选差异miRNA并KEGG分析;在PDLCs中抑制miR-140-3p,检测焦亡、M1/M2比率及破骨细胞形成;体内给予miR-140-3p抑制剂验证其对RR的影响。

6

机制研究:靶点验证

验证miR-140-3p靶向DNMT1及其对SOCS1/NF-κB轴的调控

通过双荧光素酶报告实验验证miR-140-3p与DNMT1 3'UTR的结合;在PDLCs中过表达miR-140-3p或使用DNMT1 siRNA/Decitabine,检测SOCS1甲基化水平(MSP)及蛋白表达。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
I型胶原酶----
中性蛋白酶II----
超速离心机Beckman Coulter--
成骨诱导分化培养基Cyagen--
成脂诱导分化培养基Cyagen--
透射电子显微镜HitachiHT7700
Zetasizer Nano ZS分析系统Zetasizer--
PKH26膜标记染料Life--
鬼笔环肽Life--
DAPILife--
Alexa Fluor 488山羊抗兔Zhongshan Bio-TechZF-0511
Alexa Fluor 594驴抗兔Abcamab150108
DAPISigma--
倒置显微镜OlympusCKX53
共聚焦显微镜OlympusFV1000
荧光显微镜LeicaDMI
miR-140-3p抑制剂Ribobio--
miR-140-3p模拟物Ribobio--
Lipofectamine 3000转染试剂Invitrogen--
地西他滨MCEHY-A0004
显微CT 50Scanco Medical--
Mimics 21.0软件Materialise--
3-matic Research 13.0软件Materialise--
TRAP染色试剂盒Sigma-Aldrich--
TUNEL凋亡检测试剂盒Beyotime--
IL-1β抗体AffinityAF4006
IL-18抗体AffinityDF6252
NLRP3抗体AffinityDF7438
Caspase-1抗体AffinityAF4005
CD68抗体Bio-RadMCA341GA
iNOS抗体BioworldBS1186
CD163抗体BioworldBS71200
miRNeasy血清/血浆试剂盒Qiagen--
FITC标记的膜联蛋白VBD Biosciences556547
碘化丙啶BD Biosciences556547
人IL-1β ELISA试剂盒NeobioscienceEHC002b
透射电子显微镜HitachiHT7800
Transwell小室Corning3401
佛波醇肉豆蔻酸酯SigmaP8139
巨噬细胞集落刺激因子Novoprotein--
核因子κB受体活化因子配体Novoprotein--
RIPA裂解液BeyotimeP0013B
BCA蛋白定量试剂盒BeyotimeP0010S
PVDF膜Millipore--
NLRP3抗体AffinityDF7438
pro-Caspase-1抗体AffinityAF5418
Caspase-1抗体AffinityAF4005
GSDMD抗体AffinityAF4012
pro-IL-1β抗体AffinityAF5103
IL-1β抗体AffinityAF4006
IL-18抗体AffinityDF6252
NF-κB抗体BioworldBS1254
磷酸化NF-κB抗体BioworldBS1254P
NFAT2抗体Abcam183023
MMP9抗体Abcamab76003
CTSK抗体Abcamab207086
SOCS1抗体BosterBA2306
DNMT1抗体HuabioET1702-77
β-actin抗体AffinityT0022
HRP标记的山羊抗小鼠IgGBosterBA1051
HRP标记的山羊抗兔IgGBosterBA1054
ECL化学发光试剂MilliporeWBKLS0500
ChemiDoc Touch成像系统Bio-Rad--
Trizol试剂Invitrogen--
Prime Script RT试剂盒(含gDNA Eraser)TakaraRR047A
TB Green Premix Ex Taq IITakara--
实时荧光定量PCR系统Applied BiosystemsQuantStudio
DNMT1 siRNATsingke--
引物Tsingke--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
外泌体分离与表征
外泌体分离的离心力及时间、超离转子类型、DFSC培养条件、外泌体蛋白定量方法
阅读提示:Materials and methods 中 “Cell culture and exosome isolation” 小节
体外PDLC焦亡实验
PDLC来源、代数、压缩力施加的具体方法(2 g/cm², 12 h)、外泌体处理浓度和时间(100 μg/ml, 24 h)
阅读提示:Materials and methods 中 “Cell culture and exosome isolation” 和 “In vitro co-culture experiments” 小节
动物模型建立与处理
大鼠品系、周龄、体重、分组数量、加力装置(闭合线圈弹簧)、力值100 g、时间21天、外泌体注射剂量(10 μL, 20 μg)和频率(隔天)、miR-140-3p抑制剂剂量(0.5 nmol)和注射时间
阅读提示:Materials and methods 中 “Animals and application of force” 小节
micro-CT分析
扫描参数(80 kV, 500 μA, 6 μm分辨率)、图像重建阈值(3000 HU)、吸收体积计算方法(以对侧为参考)
阅读提示:Materials and methods 中 “Micro-computed tomography (micro-CT) analysis” 小节
焦亡检测
TUNEL染色步骤、NLRP3和caspase-1抗体稀释比(1:100)、Hoechst/PI染色时间、流式细胞术Annexin V/PI用量及细胞密度
阅读提示:Materials and methods 中 “Histological, immunohistochemical and immunofluorescence staining”、“Hoechst 33,342 /PI fluorescence staining” 和 “Flow cytometry” 小节
巨噬细胞极化和破骨形成检测
THP1细胞密度、PMA浓度(50 ng/ml)和处理时间(72 h)、M-CSF和RANKL浓度(50 ng/ml)、共培养时间(48 h)、破骨分化培养时间(14天)
阅读提示:Materials and methods 中 “THP1 cell-derived macrophage transwell assay” 和 “THP1 cell-derived osteoclastogenesis” 小节
机制验证实验
miR-140-3p抑制剂浓度(50 nM)、转染时间(24 h)、DNMT1 siRNA序列和转染方法、Decitabine浓度(500 nM)、双荧光素酶报告实验载体制备及内参
阅读提示:Materials and methods 中 “In vitro co-culture experiments”、“Luciferase assay” 和 “Methylation-specific polymerase chain reaction (MSP)” 小节