分析GSDME表达与预后
评估GSDME在胃癌组织中的表达水平及其与患者预后的关系。
利用TCGA-STAD数据分析GSDM家族表达;Kaplan-Meier Plotter分析GSDME表达与OS/PFS关系;IHC检测胃癌组织芯片中GSDME蛋白表达。
The novel BCL-2/BCL-XL inhibitor APG-1252-mediated cleavage of GSDME enhances the antitumor efficacy of HER2-targeted therapy in HER2-positive gastric cancer.
文献包含患者样本分析、体外细胞实验、体内异种移植瘤模型等多个独立证据层级,并进行了功能验证(GSDME过表达/敲低)和机制验证(激酶阵列及信号通路蛋白检测)。
HER2阳性胃癌细胞系NCI-N87、SNU-216、MKN-7 拉帕替尼耐药细胞系SNU-216-LR GSDME过表达的NCI-N87异种移植瘤BALB/c裸鼠模型 胃癌患者组织样本(含HER2阴性和阳性)
细胞系:NCI-N87、SNU-216、MKN-7,均为人HER2阳性胃癌细胞系。 药物处理:APG-1252-M1(体外)及APG-1252(体内),拉帕替尼,曲妥珠单抗。 剂量:体外实验APG-1252-M1、拉帕替尼的浓度梯度;体内APG-1252 50 mg/kg,拉帕替尼 100 mg/kg。 时间:体外处理24、48、72小时;体内给药2周。 动物模型:BALB/c裸鼠皮下接种NCI-N87-GSDME细胞,每组5只。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估GSDME在胃癌组织中的表达水平及其与患者预后的关系。
利用TCGA-STAD数据分析GSDM家族表达;Kaplan-Meier Plotter分析GSDME表达与OS/PFS关系;IHC检测胃癌组织芯片中GSDME蛋白表达。
探讨HER2靶向药物(曲妥珠单抗、拉帕替尼)是否上调GSDME表达。
Western blot和RT-qPCR检测药物处理后GSDME表达;荧光素酶报告基因检测GSDME启动子活性。
明确GSDME表达水平是否影响HER2靶向药物的敏感性。
通过慢病毒或siRNA过表达/敲低GSDME,检测细胞增殖、凋亡及药物敏感性;构建拉帕替尼耐药细胞系SNU-216-LR并检测GSDME表达及敲低后敏感性。
探索BCL-2/BCL-XL抑制剂APG-1252-M1能否诱导HER2阳性胃癌细胞发生GSDME介导的焦亡。
CCK-8检测细胞活力;LDH释放实验;观察细胞形态变化;Western blot检测caspase-3和GSDME剪切;使用Z-VAD-FMK验证caspase依赖性。
检测APG-1252-M1与拉帕替尼(或曲妥珠单抗)联合是否协同诱导焦亡并抑制增殖。
CCK-8检测细胞活力并计算联合指数(CI);克隆形成实验检测集落形成;流式细胞术检测凋亡;Western blot检测凋亡和焦亡标志物。
证明GSDME表达水平决定细胞死亡方式(凋亡或焦亡)。
在GSDME过表达或敲低细胞中,检测联合用药后的LDH释放、细胞形态、Western blot标志物。
评估APG-1252联合拉帕替尼在异种移植瘤模型中的疗效和安全性。
皮下接种GSDME过表达的NCI-N87细胞,随机分为四组(对照组、APG-1252组、拉帕替尼组、联合组),监测肿瘤体积和体重,检测Ki-67和TUNEL,Western blot检测相关蛋白。
阐明联合用药协同诱导焦亡的分子机制。
磷酸化激酶阵列检测差异磷酸化蛋白;Western blot验证相关通路;过表达或敲低GSK-3β检测MCL-1变化及细胞表型;TMRE染色检测线粒体膜电位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | 文中未明确说明 | -- |
| 胎牛血清 | 文中未明确说明 | -- | |
| 青霉素-链霉素 | 文中未明确说明 | -- | |
| 药物处理 | APG-1252 | Ascentage Pharma Group, Inc. | -- |
| APG-1252-M1 | Ascentage Pharma Group, Inc. | -- | |
| 拉帕替尼 | Selleck Chemicals | -- | |
| 曲妥珠单抗 | Selleck Chemicals | -- | |
| 细胞处理 | Z-VAD-FMK | Selleck Chemicals | -- |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Life Technologies | -- |
| GP-transfect-Mate转染系统 | GenePharma Group, Inc. | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Dojindo | -- |
| LDH释放检测 | LDH释放检测试剂盒 | Dojindo | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | Neobioscience | -- |
| 线粒体膜电位检测 | TMRE染色试剂盒 | Beyotime | C2001S |
| 磷酸化激酶检测 | 人磷酸化激酶阵列试剂盒 | R&D Systems | ARY003C |
| Western blot | 细胞裂解液 | Cell Signaling Technology | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| PVDF膜 | Roche | -- | |
| Bio-Rad ClarityTM Western ECL底物 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| RT-qPCR | RNA快速纯化试剂盒 | ESscience Biotech | -- |
| 逆转录试剂盒 | ESscience Biotech | -- | |
| ChamQTM SYBR® qPCR预混液 | Vazyme Biotech | -- | |
| 荧光素酶报告基因检测 | 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Yeasen Biotechnology | 11402ES60 |
| IHC和TUNEL染色 | GSDME抗体 | Origene | TA376814 |
| Ki-67抗体 | Abcam | 9027 | |
| 原位细胞死亡检测试剂盒 | Promega | G7130 | |
| 成像 | 徕卡显微镜 | Leica | -- |
| 流式细胞术 | 流式细胞仪 | BD Bioscience | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism软件 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养条件:NCI-N87、SNU-216、MKN-7均使用RPMI-1640培养基,添加10% FBS、100 IU/mL青霉素和100 mg/mL链霉素,在37°C、5% CO2湿润环境中培养。 阅读提示:见Materials and methods - Cell lines and reagents |
| 药物处理 | APG-1252-M1和拉帕替尼的工作浓度及处理时间:体外实验使用DMSO溶解至40 mM储备液,具体浓度需根据实验目的调整。 阅读提示:见Materials and methods - Cell lines and reagents 及 Figure legends |
| 细胞活力检测 | CCK-8检测:细胞接种密度(7000 cells/well)、处理时间、加入CCK-8溶液后的孵育时间(2小时)及测量波长(450 nm)。 阅读提示:见Materials and methods - Cell viability detection |
| Western blot | 蛋白质提取和检测:使用Cell Signaling Technology的裂解液和BCA试剂盒定量,SDS-PAGE分离,PVDF膜转印,5%脱脂牛奶封闭,一抗4°C孵育过夜,HRP标记二抗,ECL显色。 阅读提示:见Materials and methods - Western blotting |
| 体内动物模型 | BALB/c裸鼠(4-6周龄,雌性)皮下接种5×10^6个GSDME过表达NCI-N87细胞,肿瘤生长至100-200 mm³后随机分组,APG-1252 50 mg/kg静脉注射,每周2次,持续2周;拉帕替尼 100 mg/kg灌胃,每日1次,持续2周。 阅读提示:见Materials and methods - In vivo xenograft experiment |