验证CytK的细胞毒性
确定CytK是否对巨噬细胞具有毒性效应
用不同浓度的重组CytK处理dTHP-1细胞,观察细胞形态变化,检测LDH释放和PI摄取。
Bacillus cereus cytotoxin K triggers gasdermin D-dependent pyroptosis.
包含细胞模型(THP-1巨噬细胞)上的功能验证(LDH、PI)、关键基因敲除(GSDMD KO)和抑制剂实验,以及机制验证(Casp1/GSDMD切割、离子流检测、脂质结合)。
PMA分化的THP-1巨噬细胞(dTHP-1) THP-1 GSDMD敲除细胞系 THP-1 Casp1敲低细胞系 THP-1 NLRP3敲低细胞系
CytK浓度(25-1000 nM)和时间依赖性细胞死亡 GSDMD抑制剂NSA和caspase-1抑制剂Ac-YVAD-CMK的作用 NLRP3抑制剂MCC950的作用 K+外流和细胞内Ca2+积累的检测 磷脂酸结合对CytK诱导焦亡的必要性
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定CytK是否对巨噬细胞具有毒性效应
用不同浓度的重组CytK处理dTHP-1细胞,观察细胞形态变化,检测LDH释放和PI摄取。
确定CytK诱导的细胞死亡是否为GSDMD介导的焦亡
使用焦亡抑制剂(zVAD, NSA)和Caspase抑制剂处理细胞,检测Casp1和GSDMD的切割,以及IL-1β释放;使用GSDMD敲除细胞系验证。
确定NLRP3是否参与CytK诱导的焦亡
使用NLRP3抑制剂MCC950处理细胞,检测细胞死亡和Casp1/GSDMD切割;使用NLRP3和Casp1敲低细胞系验证。
确定K+外流和Ca2+积累是否参与CytK诱导的焦亡
测量CytK处理后细胞内K+浓度变化和Ca2+浓度变化;通过补充KCl或使用BAPTA-AM(细胞内Ca2+螯合剂)处理细胞,检测对细胞死亡和Casp1/GSDMD切割的影响。
确定CytK是否结合细胞膜并造成损伤
分离细胞膜和胞质部分,检测CytK分布;使用免疫荧光显微镜定位CytK;使用扫描电子显微镜观察膜损伤。
确定CytK结合的膜脂质及其在焦亡中的作用
使用膜脂质条带检测CytK与多种脂质的结合;使用R59022降低磷脂酸(PA)水平,检测对CytK诱导焦亡的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640基础培养基(1×) | Gibco | C22400500BT |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099-141C | |
| 青霉素-链霉素 | HyClone | SV30010 | |
| 佛波醇12-十四酸酯13-乙酸酯(PMA) | Sigma | P1585 | |
| 细胞刺激 | Opti-MEM培养基 | Gibco | 31985-070 |
| 重组蛋白表达与纯化 | ClonExpress II一步克隆试剂盒 | Vazyme | C112 |
| 大肠杆菌BL21(DE3) | TransGen Biotech | CD601 | |
| 异丙基-β-d-硫代半乳糖苷(IPTG) | Solarbio | I8070 | |
| 重组蛋白纯化 | Ni-NTA琼脂糖 | QIAGEN | -- |
| 抑制剂处理 | Ac-DEVD-CHO | Sigma | A0835 |
| Ac-YVAD-cmk | Sigma | SML0429 | |
| Z-VAD-FMK | Selleck | S7023 | |
| 坏死磺酰胺(NSA) | Selleck | S8251 | |
| Necrostatin-1稳定型(Nec-1s) | Selleck | S8641 | |
| BAPTA-AM | Selleck | S7534 | |
| R59022 | ApexBio | B6967 | |
| 阳性对照处理 | 尼日利亚菌素(Nig) | Sigma | 481990 |
| 抗体中和实验 | 兔IgG(对照抗体) | Sangon Biotech | D110502 |
| 免疫印迹 | 硝酸纤维素膜 | Cytiva | A29740189 |
| 抗Caspase-1抗体 | Cell Signaling Technology | 2225S | |
| 抗GSDMD抗体 | Cell Signaling Technology | 96458S | |
| 抗IL-1β抗体 | Cell Signaling Technology | 12703S | |
| 抗CD11b抗体 | Proteintech | 66519-1-Ig | |
| 抗6×His标签抗体 | Abcam | ab213204 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab181602 | |
| 抗β-actin抗体 | ABclonal | AC004 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | Abcam | ab97051 | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG | ABclonal | AS003 | |
| ECL化学发光试剂盒 | Beyotime | P0018S | |
| 免疫印迹成像 | GelDoc XR凝胶成像系统 | Bio-Rad | -- |
| 细胞毒性检测 | CytoTox 96®非放射性细胞毒性检测试剂盒 | Promega | G1780 |
| 细胞因子检测 | 人IL-1β ELISA试剂盒 | NeoBioscience | EHC002B |
| 显微镜观察 | 显微镜(Ti-S/L100) | Nikon | -- |
| 共聚焦显微镜(Zeiss LSM 710) | Zeiss | -- | |
| 碘化丙啶(PI) | Beyotime | ST511 | |
| 免疫荧光 | 山羊抗兔抗体(Alexa Fluor 488) | Abcam | ab150081 |
| DAPI | Beyotime | C1002 | |
| 细胞膜/胞质分离 | 膜和胞质蛋白提取试剂盒 | Sangon Biotech | C510005 |
| 脂质结合实验 | 膜脂质条 | Echelon Biosciences | P-6002 |
| 无脂肪酸BSA | Sigma | SRE0098 | |
| HRP标记的小鼠抗His标签抗体 | ABclonal | AE028 | |
| 细胞内离子检测 | ICP-OES光谱仪(Optima 7300 DV) | PerkinElmer | -- |
| Fluo-4 AM | Invitrogen | F14201 | |
| Pluronic F-127 | Beyotime | ST501 | |
| Tecan Infinite® M1000 Pro多功能酶标仪 | Tecan | -- | |
| 96孔黑板,透明平底 | Costar | 3603 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与分化 | THP-1细胞来源;PMA浓度(50-100 nM)和分化时间(过夜);培养基和添加剂 阅读提示:Methods: Cell culture |
| CytK处理 | CytK浓度(25-1000 nM)、处理时间(1小时)、培养基(Opti-MEM) 阅读提示:Methods: Stimulation of THP-1 cells with CytK |
| 抑制剂处理 | 抑制剂种类和浓度(如MCC950 5 μM,BAPTA-AM浓度,KCl浓度等)和预处理时间(如R59022预处理6小时) 阅读提示:Methods: Stimulation of THP-1 cells with CytK |
| 细胞死亡检测 | LDH释放检测方法(CytoTox 96试剂盒)和PI摄取检测 阅读提示:Methods: Cytotoxicity and IL-1β release analysis; Microscopy |
| 免疫印迹 | 抗体列表、稀释度、细胞裂解和上清制备方法 阅读提示:Methods: Immunoblotting |
| 离子检测 | K+检测方法(ICP-OES)和Ca2+检测方法(Fluo-4 AM)的具体条件 阅读提示:Methods: Intracellular K+ measurement; Intracellular Ca2+ detection |