IL-38表达与AD相关性分析
探究IL-38在皮肤中的表达及其与AD发生发展的关系。
利用HPA数据库分析IL-38在人组织中的表达,GEO数据集分析AD患者皮肤中IL-38表达,构建DNFB诱导AD模型,通过IHC、RT-qPCR、Western blot检测IL-38表达。
IL-38 Aggravates Atopic Dermatitis via Facilitating Migration of Langerhans cells.
包含基因敲除小鼠模型、DNFB诱导AD模型、体外BM-LCs细胞实验、信号通路抑制剂验证、体内抑制剂治疗实验等多层级功能验证与机制验证。
K14Cre/+-IL-38f/f小鼠 IL-38f/f小鼠 DNFB诱导的AD小鼠模型 小鼠骨髓来源的LC样细胞(BM-LCs)
角质形成细胞特异性敲除IL-38对皮肤屏障和免疫的影响 DNFB诱导AD模型的方案(0.5%致敏和0.2%激发) rmIL-38皮下注射剂量(1 mg/kg)和给药方案 IRAK4抑制剂Zimlovisertib的给药方式(TDDs或口服)和剂量 LC迁移检测方法(FITC涂抹和Transwell实验)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究IL-38在皮肤中的表达及其与AD发生发展的关系。
利用HPA数据库分析IL-38在人组织中的表达,GEO数据集分析AD患者皮肤中IL-38表达,构建DNFB诱导AD模型,通过IHC、RT-qPCR、Western blot检测IL-38表达。
验证敲除效率和稳态下皮肤屏障及免疫的影响。
通过Cre-loxP系统生成K14Cre/+-IL-38f/f小鼠,RT-qPCR和Western blot确认敲除,通过甲苯胺蓝染色和TEWL评估屏障功能,流式细胞术检测免疫细胞。
确定角质形成细胞IL-38缺失对AD样皮肤炎症的影响。
对K14Cre/+-IL-38f/f和IL-38f/f小鼠进行DNFB诱导,评估皮炎评分、表皮厚度、血清IgE、肥大细胞数量、炎症细胞因子表达和免疫细胞浸润。
探究IL-38是否通过影响LCs迁移进而影响T细胞分化。
流式细胞术检测淋巴结中Th1/Th2细胞、皮肤和淋巴结中DC亚群,FITC涂抹检测LCs迁移。
验证IL-38是否直接趋化LCs或通过上调CCR7促进迁移。
诱导BM-LCs,Transwell实验检测IL-38趋化性和CCL21诱导的迁移,RT-qPCR和流式检测CCR7表达。
验证IL-38是否通过IL-36R/IRAK4/NF-κB通路调控CCR7。
BM-LCs中加入rmIL-38、IL-36Ra、IRAK4抑制剂Zimlovisertib或NF-κB抑制剂QNZ,检测CCR7表达和蛋白磷酸化。
评估IRAK4抑制剂对DNFB诱导AD的治疗作用。
DNFB诱导AD小鼠,经皮或口服给予Zimlovisertib或QNZ,评估皮炎评分、炎症因子、免疫细胞浸润和T细胞分化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型构建 | IL-38-floxed小鼠 | Cyagen Biosciences Inc. | -- |
| Krt14-Cre小鼠 | Nanjing Biomedical Research Institute of Nanjing University | J004782 | |
| 动物实验 | C57BL/6小鼠 | Vital River Laboratory Animal Technology Co., Ltd. | 219 |
| 基因分型 | 基因组DNA提取试剂盒 | Bimake | B40015 |
| AD诱导 | 重组小鼠IL-38蛋白 | Adipogen | AG-40B-0101-C010 |
| 皮肤屏障功能检测 | GPSkin经皮水分丢失测量仪 | GPOWER | -- |
| 组织染色 | 甲苯胺蓝 | -- | -- |
| 图像采集 | 奥林巴斯BX600显微镜 | Olympus Corporation | -- |
| SPOT Flex相机 | Olympus Corporation | -- | |
| 图像分析 | ImagePro Plus软件 | Media Cybernetics | -- |
| 免疫组化 | IL-38抗体 | Abcam | ab180898 |
| DAB底物试剂盒 | ZSGB-BIO | ZLI-9017 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RNA质量检测 | NanoDrop 2000分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 反转录 | PrimeScript RT试剂盒(含gDNA Eraser) | Takara Bio | RR047A |
| qPCR | TB Green Premix Ex Taq II试剂 | Takara Bio | RR820 |
| LightCycler96 PCR仪 | Roche | -- | |
| Western blot | SDS-PAGE凝胶 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- |
| PVDF膜 | Merck Millipore | -- | |
| β-肌动蛋白抗体 | CST | 4970s | |
| 小鼠IL-38抗体 | R&D Systems | MAB7774 | |
| IRAK4抗体 | CST | 4363s | |
| 磷酸化IRAK4抗体 | CST | 11927s | |
| NF-κB p65抗体 | CST | 8242s | |
| 磷酸化NF-κB p65抗体 | CST | 3033s | |
| 剥离缓冲液 | Beyotime | P0025 | |
| 山羊抗兔二抗 | Invitrogen | A27036 | |
| ECL化学发光试剂 | Merck Millipore | WBKLS0500 | |
| 流式细胞术 | RPMI培养基 | Gibco | -- |
| Liberase酶 | Roche | -- | |
| DNase酶 | Roche | -- | |
| gentleMACS组织处理器 | Miltenyi Biotech | -- | |
| 40 μm细胞过滤器 | BD Bioscience | 352340 | |
| 70 μm细胞过滤器 | BD Bioscience | 352350 | |
| NovoCyte流式细胞仪 | ACEA Biosciences | -- | |
| BD LSRFortessa流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| CD45-BV510抗体 | -- | 1033137 | |
| CD11b-APC抗体 | eBioscience | 17-0112-82 | |
| CD11c-APC/Cyanine7抗体 | -- | 117324 | |
| MHCII-FITC抗体 | eBioscience | 11-5322-81 | |
| CD64-PE/Cyanine7抗体 | -- | 139314 | |
| Gr-1-PE/Cyanine7抗体 | -- | 108416 | |
| CD207-PE抗体 | -- | 144204 | |
| CCR7-APC抗体 | -- | 120108 | |
| F4/80-FITC抗体 | -- | 123108 | |
| EPCAM-PE/Cyanine7抗体 | eBioscience | 25-5791-80 | |
| Siglec-F-FITC抗体 | -- | 155504 | |
| CD49bPE/Dazzle594抗体 | -- | 108923 | |
| FcεRIα-PE抗体 | -- | 134308 | |
| CD3-APC/Cyanine7抗体 | -- | 100222 | |
| CD4-PerCP/Cy5.5抗体 | -- | 100434 | |
| CD8-PE/Cyanine7抗体 | -- | 100722 | |
| IFN-γ-FITC抗体 | -- | 505806 | |
| 7-AAD染液 | -- | 420404 | |
| ELISA | 小鼠IgE ELISA试剂盒 | NeoBioscience | EMC117.96 |
| FITC迁移实验 | 异硫氰酸荧光素 | Sigma-Aldrich | -- |
| 邻苯二甲酸二丁酯 | Sigma-Aldrich | -- | |
| BM-LCs诱导 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | -- | |
| 重组小鼠GM-CSF | Peprotech | -- | |
| 重组人TGFβ1 | Peprotech | -- | |
| 体外刺激 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | -- |
| 重组小鼠IL-36Ra | Peprotech | 210-36RA | |
| QNZ (NF-κB抑制剂) | Selleck | S4902 | |
| Zimlovisertib (IRAK4抑制剂) | Selleck | S8531 | |
| Transwell迁移 | 24孔Transwell板(8 μm孔径聚碳酸酯膜) | Corning | -- |
| 重组小鼠CCL21 | Peprotech | 250-13 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系:C57BL/6背景,IL-38f/f和K14Cre/+-IL-38f/f;Krt14-Cre小鼠来源;饲养条件 阅读提示:Materials and Methods: Animals |
| AD诱导 | DNFB浓度:0.5%致敏、0.2%激发;溶剂:丙酮/橄榄油(4:1);致敏和激发时间点 阅读提示:Materials and Methods: DNFB-induced AD-like skin inflammation model |
| 药物处理 | rmIL-38皮下注射剂量:1 mg/kg;注射时间和频率:从第5天开始,每两天一次,共15天 阅读提示:Materials and Methods: DNFB-induced AD-like skin inflammation model |
| 抑制剂治疗 | Zimlovisertib剂量:经皮20 mg/kg,口服10 mg/kg;QNZ剂量:经皮2 mg/kg,口服1 mg/kg;给药方式:TDDs或口服;开始时间:第6天 阅读提示:Materials and Methods: Inhibitors treatment assay in AD |
| LC迁移检测 | FITC浓度:1% (w/v);溶剂:丙酮:邻苯二甲酸二丁酯(1:1);处理时间:72小时 阅读提示:Materials and Methods: FITC painting and in vivo LCs migration assay |
| BM-LCs诱导和体外刺激 | 细胞因子:GM-CSF 20 ng/ml, TGFβ1 10 ng/ml;刺激时间:7天;刺激物浓度:rmIL-38 100 ng/mL, LPS 100 ng/mL, rmIL-36Ra 100 ng/mL, Zimlovisertib 100 nM, QNZ 10 μM 阅读提示:Materials and Methods: Induction of BM-derived LC-like cells and stimulation assays in vitro |