体外协同效应验证
验证IRIN与放疗联合是否对结直肠癌细胞具有协同杀伤作用
使用HCT8和HT29细胞,进行CCK-8细胞活力检测、克隆形成实验、ROS检测和凋亡分析,并计算Bliss协同评分。
Combination of irinotecan silicasome nanoparticles with radiation therapy sensitizes immunotherapy by modulating the activation of the cGAS/STING pathway for colorectal cancer.
包含细胞实验(CCK-8、克隆形成、凋亡、Western blot等)、动物实验(MC38移植瘤模型)、药物分布与PK分析以及免疫微环境检测,并进行机制验证。
HCT8人结直肠癌细胞系 HT29人结直肠癌细胞系 MC38小鼠结直肠癌细胞系 MC38皮下移植瘤模型(C57BL/6小鼠)
IRIN浓度及处理时间(如3μM、12h、36h) 放疗剂量及分次(如2 Gy或4 Gy,分次方案) 细胞系(HCT8、HT29、MC38) 给药剂量和途径(40 mg/kg静脉注射) 抗PD-1抗体剂量和给药方案(100 μg,腹腔注射)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证IRIN与放疗联合是否对结直肠癌细胞具有协同杀伤作用
使用HCT8和HT29细胞,进行CCK-8细胞活力检测、克隆形成实验、ROS检测和凋亡分析,并计算Bliss协同评分。
检测IRIN联合放疗是否增加DNA损伤并激活cGAS/STING通路
通过免疫荧光检测γ-H2AX和dsDNA焦点,qRT-PCR检测cGAS和STING mRNA水平,Western blot检测通路蛋白表达。
验证IRIN联合放疗是否上调MHC-I和PD-L1表达及I型干扰素相关基因
流式细胞术检测细胞表面MHC-I和PD-L1,qRT-PCR检测IFN-α、IFN-β、ISG15、NLRC5、TAP1,ELISA检测IFN-α和IFN-β分泌,Western blot检测β2M。
验证IRIN硅质体与游离IRIN在体外具有相似的抗肿瘤效果和cGAS/STING通路激活能力
CCK-8测定IC50,Western blot检测MC38细胞中STING、p-IRF3、p-TBK1表达。
评估IRIN硅质体在体内的分布、血液循环时间和肿瘤药物浓度
使用DyLight680标记硅质体进行IVIS成像,测定血浆和肿瘤组织中IRIN浓度,计算药代参数。
比较IRIN硅质体或游离IRIN联合放疗在MC38移植瘤模型中的抗肿瘤效果
测量肿瘤体积变化,比较不同治疗组疗效。
评估IRIN硅质体联合放疗对肿瘤内免疫细胞浸润的影响
流式细胞术分析肿瘤内CD4+、CD8+ T细胞和CD11c+ DC比例,免疫荧光检测IFN-γ表达。
验证IRIN硅质体联合放疗基础上加入抗PD-1抗体是否能进一步抑制肿瘤生长
MC38荷瘤小鼠接受联合治疗,测量肿瘤体积。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | KeyGEN BioTECH Co., Ltd. | -- |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 青霉素/链霉素 | KeyGEN BioTECH Co., Ltd. | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Targetmol | -- |
| ROS检测 | ROS检测试剂盒 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-APC/PI凋亡试剂盒 | MULTISCIENCES Biotech Co., Ltd. | -- |
| 免疫荧光 | 抗γ-H2AX抗体 | Cell Signaling Technology | 9718 |
| 抗dsDNA抗体 | Abcam | ab27156 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 增强化学发光试剂盒 | Millipore | -- | |
| 流式细胞术 | APC标记抗人HLA-A, B, C抗体 | BioLegend | 311410 |
| PE标记抗人CD274抗体 | BioLegend | 329707 | |
| 同型对照IgG | BioLegend | 400313 | |
| qRT-PCR | RNA提取试剂盒 | Sparkjade Scientific Instruments Co., Ltd. | -- |
| 逆转录试剂盒 | Sparkjade Scientific Instruments Co., Ltd. | -- | |
| SYBR Green qPCR试剂盒 | Sparkjade Scientific Instruments Co., Ltd. | -- | |
| ELISA | 人IFN-α ELISA试剂盒 | MULTISCIENCES Biotech Co., Ltd. | -- |
| 人IFN-β ELISA试剂盒 | NEOBIOSCIENCE Biotech Co., Ltd. | -- | |
| 纳米颗粒表征 | Zetasizer Nano ZS ZEN3600粒度仪 | -- | -- |
| 透射电子显微镜(JEM-2100plus) | -- | -- | |
| 体内分布 | IVIS Lumina Series III成像系统 | PerkinElmer, Inc. | -- |
| 抗CD31抗体 | Abcam | ab222783 | |
| 药物浓度检测 | 液相色谱-质谱联用仪(6495C) | Agilent Technologies Inc. | -- |
| 动物照射 | X射线照射仪(SARRP3) | Xstrahl | -- |
| 动物实验 | 抗PD-1抗体 | Hengrui Pharmaceuticals Co., Ltd. | -- |
| 流式细胞术 | BD LSRFortessa流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 免疫荧光 | 自动化多重免疫组化染色仪(BOND RXm) | Leica | -- |
| 玻片扫描仪(VS200) | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞活力检测 | 细胞系(HCT8、HT29)及其来源,IRIN浓度梯度,照射剂量(2 Gy),处理时间(48h) 阅读提示:Methods 4.2 Cell viability assay |
| 克隆形成实验 | 细胞接种密度(150-1200/well),照射剂量(0-6 Gy),IRIN预处理浓度(1 μM)和时间(12h),培养时间(14天) 阅读提示:Methods 4.3 Colony formation assay |
| ROS检测 | 细胞密度(5×10^5/well),处理条件(IRIN 3 μM,照射4 Gy),DCFH-DA孵育时间(30min) 阅读提示:Methods 4.4 ROS detection |
| 凋亡检测 | 细胞密度(5×10^5/well),处理条件(IRIN 3 μM,照射4 Gy),检测时间(照射后48h),Annexin V和PI用量 阅读提示:Methods 4.5 Apoptosis assay |
| cGAS/STING通路检测 | 细胞系(HCT8、MC38),处理条件(IRIN 3 μM,照射4 Gy),检测时间点(照射后24h或36h) 阅读提示:Methods 4.9 qRT-PCR 和 4.7 Western blotting |
| 体内分布 | MC38肿瘤模型建立(5×10^5细胞皮下注射),IRIN等效剂量40 mg/kg IV,DyLight680标记,成像时间(48h、72h) 阅读提示:Methods 4.12 In vivo distribution of silicasomes |
| 药代动力学 | 健康C57BL/6小鼠(10-12周),IRIN剂量40 mg/kg IV,采血时间点(0.5-48h),LC-MS检测 阅读提示:Methods 4.13 Measurement of plasma and tumor IRIN concentrations |
| 抗肿瘤疗效评估 | MC38荷瘤小鼠,给药方案(40 mg/kg IV,每3天一次,共4次),放疗方案(2 Gy/次,共4次),起始治疗肿瘤体积约100 mm3,肿瘤测量频率 阅读提示:Methods 4.15 Evaluating the in vivo efficacy |
| 免疫微环境分析 | 治疗组别,取样时间(末次放疗后48h),流式抗体(CD4、CD8、CD11c等),IFN-γ染色 阅读提示:Methods 4.15 及 Figure 6 legend |
| 联合抗PD-1治疗 | 抗PD-1抗体剂量(100 μg)和给药方案(腹腔注射,放疗后第1天开始,共3次) 阅读提示:Methods 4.15 及 Figure 6J legend |