PPE的制备与成分分析
制备PPE并鉴定其活性成分,为后续研究提供物质基础。
采用50%乙醇超声辅助提取石榴皮,通过UPLC-ESI-MS/MS进行代谢物分析,HPLC定量主要多酚(安石榴苷、鞣花酸、没食子酸)。
Pomegranate peel extract alleviates diabetic retinopathy by suppressing the PI3K/AKT/HIF-1α/VEGF pathway and gut microbiota modulation.
包含STZ诱导的DR大鼠模型、高糖诱导的ARPE-19细胞、HUVECs细胞功能实验以及肠道菌群宏基因组分析等多个独立证据层级,并进行了功能验证(如氧化应激、VEGF释放)和机制验证(如Western blot)。
STZ诱导的DR大鼠模型 高糖诱导的ARPE-19细胞 HUVECs细胞 大鼠粪便样本
PPE给药剂量:50、100、200 mg/kg/d,灌胃,持续8周 ARPE-19细胞高糖处理浓度:30 mM D-glucose,处理48小时 PPE细胞处理浓度:50、100、200 μg/mL STZ诱导糖尿病剂量:50 mg/kg,腹腔注射 Western blot检测蛋白:VEGF、HIF-1α、p-PI3K、PI3K、p-AKT、AKT
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
制备PPE并鉴定其活性成分,为后续研究提供物质基础。
采用50%乙醇超声辅助提取石榴皮,通过UPLC-ESI-MS/MS进行代谢物分析,HPLC定量主要多酚(安石榴苷、鞣花酸、没食子酸)。
预测PPE抗DR的潜在靶点和信号通路。
利用SwissADME、SuperPred、Swiss Target Prediction、GeneCards、OMIM、TTD等数据库筛选活性化合物靶点和DR相关靶点,获取交集靶点,构建PPI网络,进行GO和KEGG富集分析。
建立1型糖尿病DR大鼠模型,评估PPE对DR的治疗作用。
雄性SD大鼠腹腔注射STZ (50 mg/kg)诱导糖尿病,随机分为5组:模型组、PPE低(50 mg/kg/d)、中(100 mg/kg/d)、高(200 mg/kg/d)剂量组、阳性对照组(羟苯磺酸钙,50 mg/kg/d),灌胃给药8周。
评估PPE对DR大鼠血糖、血脂和炎症因子的改善作用。
每周监测体重、FBG、摄食量和饮水量;第7周进行口服葡萄糖耐量试验(OGTT);检测血清TC、TG、IL-6、IL-1β、TNF-α水平;检测血清ALT、AST、肌酐、BUN水平。
评估PPE对DR大鼠视网膜结构损伤的保护作用。
通过眼表照相观察眼底变化;H&E染色观察视网膜结构,量化各层厚度。
评估PPE对DR大鼠全身和视网膜氧化应激的缓解作用。
检测血清和视网膜中MDA水平、SOD和GSH-Px活性;视网膜ROS水平;血清和晶状体中AR活性;血清AGEs水平。
验证PPE对DR大鼠视网膜中PI3K/AKT/HIF-1α/VEGF通路蛋白表达的影响。
通过Western blot检测视网膜组织中VEGF、HIF-1α、p-PI3K、PI3K、p-AKT、AKT的蛋白表达水平。
评估PPE对高糖条件下ARPE-19细胞氧化应激的缓解作用。
ARPE-19细胞用30 mM D-glucose和/或PPE处理48小时,检测ROS水平、MDA水平、SOD和GSH-Px活性。
评估PPE对高糖条件下ARPE-19细胞VEGF表达和分泌及内皮细胞功能的影响。
收集ARPE-19细胞条件培养基,通过伤口愈合实验评估HUVECs迁移;ELISA检测VEGF释放;Western blot检测VEGF、HIF-1α、p-PI3K、PI3K、p-AKT、AKT表达。
评估PPE对DR大鼠肠道菌群组成和功能的影响。
收集粪便样本,进行宏基因组测序,分析菌群组成、多样性、差异菌群及功能通路。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| PPE制备 | 50%乙醇 | -- | -- |
| 代谢物检测 | 2-氯苯丙氨酸 | -- | -- |
| PPE成分分析 | 安石榴苷 | Chengdu Must Bio-technology Co., Ltd. | 65995-63-3 |
| 鞣花酸 | Yuanye Bio-technology Co., Ltd. | 476-66-4 | |
| 没食子酸 | Macklin Biochemical Co., Ltd. | 149-91-7 | |
| 动物造模 | 链脲佐菌素 | Solarbio Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Thermo Fisher Technology Co., Ltd. | -- |
| DMEM/F12培养基 | Thermo Fisher Technology Co., Ltd. | -- | |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Technology Co., Ltd. | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8细胞增殖检测试剂盒 | Biyuntian Biological Co., Ltd. | C0039 |
| 氧化应激检测 | 活性氧检测试剂盒 | Biyuntian Biological Co., Ltd. | S0033S |
| Western blot | RIPA裂解液 | Biyuntian Biological Co., Ltd. | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Biyuntian Biological Co., Ltd. | P0009 | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| HIF-1α抗体 | Sevier Biotechnology Co., Ltd. | GB114936 | |
| VEGF抗体 | Sevier Biotechnology Co., Ltd. | GB11034B | |
| PI3K抗体 | Sevier Biotechnology Co., Ltd. | GB11525 | |
| p-AKT抗体 | Sevier Biotechnology Co., Ltd. | GB150002 | |
| AKT抗体 | Sevier Biotechnology Co., Ltd. | GB15689 | |
| p-PI3K抗体 | Affinity Biosciences | AF3242 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 81115-1-RR | |
| ELISA | VEGF ELISA试剂盒 | Shanghai Enzyme Linked Biotechnology Co., Ltd. | ml106795 |
| AR ELISA试剂盒 | Shanghai Enzyme Linked Biotechnology Co., Ltd. | ml059014 | |
| IL-1β ELISA试剂盒 | NeoBioscience Co., Ltd. | ERC007 | |
| IL-6 ELISA试剂盒 | NeoBioscience Co., Ltd. | ERC003 | |
| TNF-α ELISA试剂盒 | NeoBioscience Co., Ltd. | ERC102a | |
| 生化检测 | 甘油三酯测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A110-1-1 |
| 总胆固醇测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A111-1-1 | |
| 丙二醛测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A003-1 | |
| 超氧化物歧化酶测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A001-3-2 | |
| 谷胱甘肽过氧化物酶测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A006-2-1 | |
| 丙氨酸氨基转移酶测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | C009-2-1 | |
| 天冬氨酸氨基转移酶测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | C010-2-1 | |
| 肌酐测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | C011-2-1 | |
| 血尿素氮测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | C013-2-1 | |
| 晚期糖基化终末产物测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | H250-1-1 | |
| 细胞实验 | Hoechst 33342染色液 | Thermo Fisher Technology Co., Ltd. | -- |
| 组织学分析 | FAS眼球固定液 | Servicebio | -- |
| 石蜡 | -- | -- | |
| 显微镜(尼康TS2) | Nikon | -- | |
| 细胞实验 | 酶标仪(Synergy2) | Bio-Tek | -- |
| EVOS M7000显微镜 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blot | ChemiDoc Touch成像系统 | Bio-Rad | -- |
| 宏基因组测序 | VAMNE粪便/土壤DNA提取试剂盒-BOX 2 | Vazyme | -- |
| Illumina Novaseq X plus测序平台 | Illumina Inc. | -- | |
| α-葡萄糖苷酶抑制实验 | α-葡萄糖苷酶 | Yuanye Bio-technology Co., Ltd. | -- |
| 阿卡波糖 | Yuanye Bio-technology Co., Ltd. | -- | |
| 醛糖还原酶抑制实验 | DL-甘油醛 | Yuanye Bio-technology Co., Ltd. | -- |
| PPE制备 | 柠檬酸-柠檬酸钠缓冲液 | -- | -- |
| PPE成分分析 | 安石榴林 | Sichuan Weikeqi Biological Technology Co., Ltd. | 65995-64-4 |
| 芹菜素 | Sichuan Weikeqi Biological Technology Co., Ltd. | 520-36-5 | |
| 槲皮素 | Sichuan Weikeqi Biological Technology Co., Ltd. | 117-39-5 | |
| 细胞培养 | D-葡萄糖 | Macklin Biochemical Co., Ltd. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| PPE制备 | 提取溶剂浓度(50%乙醇)、料液比(10g/100mL)、超声时间(1小时)、温度(50°C)、功率(240W)、提取次数(2次) 阅读提示:Materials and methods, Preparation and characterization of PPE |
| STZ诱导DR大鼠模型 | STZ剂量(50 mg/kg)、溶剂(0.1 mol/L柠檬酸缓冲液,pH 4.5)、给药途径(腹腔注射)、糖尿病判定标准(FBG ≥ 16.7 mmol/L) 阅读提示:Materials and methods, Induction of DR in rats |
| PPE给药 | 剂量(50、100、200 mg/kg/d)、给药途径(灌胃)、频率(每日)、持续时间(8周)、阳性对照(CD 50 mg/kg/d)、溶剂(PBS) 阅读提示:Materials and methods, Administration of PPE to STZ-induced DR rats |
| ARPE-19细胞高糖模型 | 高糖浓度(30 mM D-glucose)、处理时间(48小时)、PPE浓度(50、100、200 μg/mL) 阅读提示:Materials and methods, Culture and treatment of ARPE-19 and HUVECs cells |
| Western blot | 一抗稀释比(VEGF 1:2000, HIF-1α 1:600, p-PI3K 1:1000, PI3K 1:1000, p-AKT 1:1000, AKT 1:1000, β-actin 1:3000)、二抗稀释比(1:3000)、内参(β-actin) 阅读提示:Materials and methods, Western blot |
| 宏基因组分析 | 样本量(每组6个)、DNA提取试剂盒(VAMNE Stool/Soil DNA Extraction Kit-BOX 2)、测序平台(Illumina Novaseq X plus)、差异分析阈值(q < 0.05) 阅读提示:Materials and methods, Metagenomic analysis of gut microbiome |