HIRI模型建立与Btg2表达分析
建立小鼠HIRI模型并检测Btg2在HIRI后的表达变化。
对雄性C57BL/6J小鼠进行70%缺血(1小时)再灌注(6小时)手术,收集肝脏和血清样本。通过RNA-Seq、Western blot、RT-qPCR、IHC和免疫荧光检测Btg2表达。
Btg2 inhibits Fmo1 UFMylation thus exacerbating ferroptosis and apoptosis in hepatic ischemia-reperfusion injury.
包含体内小鼠HIRI模型(Btg2敲除/转基因、AAV介导的Fmo1过表达/敲低)、体外原代肝细胞H/R模型、代谢组学、IP-MS、分子对接与虚拟筛选,并进行了功能验证和机制验证。
C57BL/6J小鼠70% HIRI模型 Btg2全身敲除(Btg2-/-)小鼠 肝细胞特异性Btg2转基因(Btg2HTG)小鼠 原代小鼠肝细胞
Btg2表达在HIRI后显著升高,并在1h缺血/6h再灌注时达到峰值 Btg2敲除减轻HIRI诱导的炎症、线粒体损伤和凋亡,而Btg2过表达加重这些损伤 Btg2与Fmo1相互作用并通过Box-C结构域抑制Fmo1的UFM化,促进其K48泛素化降解 Fmo1过表达恢复牛磺酸合成,抑制铁死亡和凋亡,减轻HIRI DTA(25mg/kg,口服灌胃,每日一次,持续7天)通过抑制Btg2减轻HIRI
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立小鼠HIRI模型并检测Btg2在HIRI后的表达变化。
对雄性C57BL/6J小鼠进行70%缺血(1小时)再灌注(6小时)手术,收集肝脏和血清样本。通过RNA-Seq、Western blot、RT-qPCR、IHC和免疫荧光检测Btg2表达。
验证Btg2对HIRI炎症、凋亡和线粒体损伤的影响。
使用Btg2全身敲除(Btg2-/-)和肝细胞特异性转基因(Btg2HTG)小鼠,在HIRI后评估血清ALT/AST/LDH水平、H&E染色、TEM、TUNEL、免疫荧光(CD11b/Ly6G)、ELISA、Western blot和RT-qPCR等。
鉴定Btg2的相互作用蛋白,并研究其对牛磺酸合成的调控。
通过代谢组学分析Btg2-/-和Btg2+/+小鼠肝脏代谢差异,发现牛磺酸代谢显著受影响。通过IP-MS鉴定Fmo1为Btg2的相互作用蛋白,并用co-IP和免疫荧光验证。通过Btg2截短体定位结合域。检测Btg2过表达/敲低对Fmo1蛋白和mRNA水平的影响,以及肝脏牛磺酸浓度。
验证Fmo1过表达或敲低对HIRI中铁死亡、凋亡和组织损伤的作用。
在Btg2HTG原代肝细胞中过表达Fmo1(AdFmo1),在Btg2-/-原代肝细胞中敲低Fmo1(AdshFmo1),进行H/R处理后检测炎症因子、牛磺酸水平、Fe2+、LPO、MDA、GSH、细胞活力和铁死亡相关蛋白表达。体内使用AAV8-Fmo1和AAV8-shFmo1进行过表达和敲低,评估肝损伤、凋亡、铁死亡和组织学变化。
探究Btg2促进Fmo1降解的具体分子机制,特别是UFM化和泛素化的关系。
通过CHX实验检测Fmo1蛋白半衰期,用MG132抑制蛋白酶体。在AML12细胞中敲低si-Btg2或过表达Btg2-Flag,检测Fmo1泛素化水平。通过IP-MS筛选E3连接酶,确定Ufl1。验证Ufl1对Fmo1表达的影响,以及Btg2对Ufl1-Fmo1相互作用的影响。在HEK293T细胞中模拟UFM化系统,检测Fmo1的UFM化和K48泛素化。
筛选并验证天然化合物DTA对Btg2的抑制作用及其对HIRI的保护作用。
通过虚拟筛选(AutoDock Vina)和分子动力学模拟,从3191种天然化合物中筛选出DTA和DTI。在体内外实验中,评估DTA(体内25 mg/kg口服灌胃;体外25 μM处理)对HIRI和H/R诱导的损伤的保护作用,检测肝功能、组织学、凋亡、铁死亡、牛磺酸水平等指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | ExCell Bio | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Beyotime | -- | |
| 1640培养基 | Gibco | -- | |
| DMEM/F12培养基 | 未明确说明 | -- | |
| 细胞分离 | IV型胶原酶 | Solarbio Lifesciences | -- |
| Percoll分离液 | Biosharp | -- | |
| 细胞培养 | D-Hanks平衡盐溶液 | -- | -- |
| HIRI模型 | 无损伤微血管夹 | -- | -- |
| 基因操作 | AdBtg2腺病毒 | Genepharma | -- |
| AdshBtg2腺病毒 | Genepharma | -- | |
| AAV8-Fmo1 | Genepharma | -- | |
| AAV8-shFmo1 | Genepharma | -- | |
| RNA提取与RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | PrimeScript™ RT试剂盒(含gDNA Eraser) | Takara | -- |
| TB Green Premix Ex Taq II | Takara | -- | |
| CFX96实时荧光定量PCR检测系统 | Bio-Rad | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | MedChemExpress | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Beyotime | -- |
| 肝功能指标检测 | ALT检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- |
| AST检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- | |
| LDH检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- | |
| 氧化应激指标检测 | MDA检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| GSH检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- | |
| 组织学染色 | H&E染色试剂盒 | Solarbio Lifesciences | -- |
| 凋亡检测 | 原位凋亡检测试剂盒(TUNEL) | Beyotime | -- |
| 免疫染色 | 牛血清白蛋白 | -- | -- |
| Triton X-100 | -- | -- | |
| DAPI染料 | -- | -- | |
| 牛磺酸检测 | 牛磺酸检测试剂盒 | Cell Biolabs | -- |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1线粒体膜电位检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| 脂质过氧化物检测 | Liperfluo探针 | Dojindo | -- |
| 铁离子检测 | FerroOrange探针 | Dojindo | -- |
| TEM | 超薄切片机 | Leica | -- |
| 透射电子显微镜 | Thermo Fisher | -- | |
| 免疫沉淀 | 抗Flag抗体 | Merck | -- |
| IgG抗体 | Abmart | -- | |
| Protein A/G磁珠 | MedChemExpress | -- | |
| 质谱分析 | 快速银染试剂盒 | Beyotime | -- |
| nanoElute系统 | Bruker | -- | |
| timsTOF Pro质谱仪 | Bruker | -- | |
| C18色谱柱 | Thermo Scientific | -- | |
| 胰蛋白酶 | -- | -- | |
| 代谢组学 | Vanquish超高效液相色谱系统 | -- | -- |
| Q Exactive Orbitrap质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| HILIC色谱柱 | -- | -- | |
| ELISA | IL-6 ELISA试剂盒 | Neobioscience | -- |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Neobioscience | -- | |
| 药物处理 | DTA(曼陀罗素A) | Shanghai yuanye Bio-Technology | -- |
| 牛磺酸 | MedChemExpress | -- | |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| 羧甲基纤维素钠 | -- | -- | |
| 蛋白稳定性实验 | MG132蛋白酶体抑制剂 | -- | -- |
| 质粒转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 质粒构建 | Btg2-3xFlag质粒 | Tsingke Biotech | -- |
| Fmo1-His质粒 | Tsingke Biotech | -- | |
| Ufl1-HA质粒 | Tsingke Biotech | -- | |
| Uba5-HA质粒 | Tsingke Biotech | -- | |
| Ufc1-HA质粒 | Tsingke Biotech | -- | |
| Ddrgk1-HA质粒 | Tsingke Biotech | -- | |
| Ub-Myc质粒 | Tsingke Biotech | -- | |
| Ufm1-V5质粒 | Tsingke Biotech | -- | |
| 细胞系 | HEK293T细胞系 | Procell Life Science&Technology Co., Ltd. | -- |
| AML12细胞系 | Procell Life Science&Technology Co., Ltd. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠HIRI模型 | 小鼠品系(C57BL/6J)、性别(雄性)、年龄(6-8周)、体重(25-28g)、缺血时间(1小时)、再灌注时间(6小时)、缺血范围(70%) 阅读提示:Methods: Mouse HIRI model |
| 细胞缺氧/复氧(H/R)模型 | 缺氧时间(6小时)、复氧时间(6小时)、氧气浓度(1%)、无糖DMEM培养基 阅读提示:Methods: Cell hypoxia/reoxygenation (H/R) model |
| Btg2敲除小鼠构建 | Btg2敲除策略(Cyagen Biosciences)、基因型确认(PCR) 阅读提示:Methods: Animals |
| Btg2转基因小鼠构建 | CAG-LSL-Btg2敲入位点(Gt(ROSA)26Sor)、Alb-Cre小鼠、基因型确认(PCR) 阅读提示:Methods: Animals |
| 腺病毒转染 | 腺病毒类型(ADV7或ADV6)、MOI=50、感染时间(8小时) 阅读提示:Methods: Construction and transfection of adenoviral vectors |
| AAV8注射 | AAV8-TBG-Fmo1或AAV8-TBG-shFmo1、剂量(1.5×10^11 vg)、注射途径(尾静脉)、表达时间(3周) 阅读提示:Methods: Construction and transfection of adeno-associated virus 8 (AAV8) |
| Fmo1过表达/敲低体外实验 | AdFmo1或AdshFmo1、MOI、处理时间、H/R条件 阅读提示:Methods: Construction and transfection of adenoviral vectors; Results: Figure 5 |
| DTA处理 | DTA浓度(体内25mg/kg,口服灌胃,每日一次,连续7天;体外25μM)、溶解溶剂(DMSO储备液、1%羧甲基纤维素钠溶液) 阅读提示:Methods: Reagents intervention |
| 牛磺酸处理 | 牛磺酸浓度(200μg/g体重)、注射途径(尾静脉)、注射时间(HIRI前1小时) 阅读提示:Methods: Reagents intervention |
| 统计学分析 | 统计方法(t检验、ANOVA、Mann-Whitney U检验)、显著性阈值(P<0.05)、样本量(n值) 阅读提示:Methods: Statistical analysis |