验证Tsc1或Tsc2缺陷对细胞增殖和凋亡的影响
确认Tsc1或Tsc2杂合缺失是否促进增殖并抑制凋亡。
使用原代Tsc1+/−和Tsc2+/− MEFs,通过CCK-8、EdU、流式细胞术和Western blot检测增殖、细胞周期和凋亡标志物。
GSK-J4 Suppresses Tumorigenesis by Targeting the PERK-c-Myc Pathway Through Endoplasmic Reticulum Stress Activation in Tuberous Sclerosis Complex.
包含细胞实验(原代MEFs)和动物模型(Tsc1+/−和Tsc2+/−小鼠)两个独立证据层级,并进行了功能验证(细胞周期、凋亡)和机制验证(ERS通路、PERK抑制、c-Myc调控)。
原代Tsc1+/−和Tsc2+/−小鼠胚胎成纤维细胞(MEFs) Tsc1+/−和Tsc2+/−小鼠(C57BL/6背景)
GSK-J4处理浓度(如2 μM、6 μM)和处理时间(48小时) 原代MEFs分离方法(E12.5胚胎,P4-P8代) 动物模型:12-13月龄雄性Tsc1+/−和Tsc2+/−小鼠,每组n=3 联合用药方案:GSK-J4(0.4 mg/kg,皮下注射,每日一次,共10天)和雷帕霉素(1 mg/kg,腹腔注射,隔日一次,共20天) PERK抑制剂GSK2606414(10 μM)和ERS抑制剂4-PBA(3 mM)的使用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认Tsc1或Tsc2杂合缺失是否促进增殖并抑制凋亡。
使用原代Tsc1+/−和Tsc2+/− MEFs,通过CCK-8、EdU、流式细胞术和Western blot检测增殖、细胞周期和凋亡标志物。
探究Tsc1或Tsc2缺失是否导致H3K27me3水平降低。
通过免疫荧光和Western blot检测WT、Tsc1+/−和Tsc2+/− MEFs中H3K27me3水平。
探究GSK-J4是否能逆转Tsc缺陷细胞的促增殖和抗凋亡表型。
用不同浓度GSK-J4处理原代Tsc1+/−和Tsc2+/− MEFs及WT MEFs,通过流式细胞术和Western blot检测细胞周期和凋亡。
确定GSK-J4是否通过激活ERS发挥抗肿瘤作用。
检测GSK-J4处理后GRP78表达,并使用ERS抑制剂4-PBA共处理,评估细胞周期和凋亡变化。
探究GSK-J4是否通过PERK-ATF4-CHOP轴抑制c-Myc表达。
通过qPCR检测ERS相关转录因子,Western blot检测p-PERK、CHOP、c-Myc,免疫荧光检测ATF4和c-Myc,并使用PERK抑制剂GSK2606414验证。
检验GSK-J4与雷帕霉素联用是否协同抑制肿瘤生长并改善肾功能。
体外:CCK-8、流式检测联合用药对细胞活力和凋亡的影响,CompuSyn分析协同指数。体内:Tsc1+/−和Tsc2+/−小鼠给药后检测BUN和CRE水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | BOSTER | -- |
| 胎牛血清 | SORFA | -- | |
| 胰蛋白酶-EDTA | -- | -- | |
| 200目尼龙膜 | Solarbio | -- | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | NCM Biotech | -- |
| DNA合成检测 | BeyoClick™ EdU-555细胞增殖试剂盒 | Beyotime Biotech Inc | C0075S |
| 细胞周期分析 | DNA定量分析试剂盒 | Solarbio | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-AbFluor™ 488凋亡检测试剂盒 | Abbkine | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 逆转录 | Prime Script RT Master Mix | TAKARA | -- |
| qPCR | iQ SYBR Green Supermix | Mei5 Bioservices Co., Ltd | -- |
| qPCR引物 | qPCR引物 | Sangon Biotech | -- |
| Western blot | PAGE凝胶快速制备试剂盒 | EpiZyme | -- |
| PVDF膜 | GE | -- | |
| Western blot设备 | Bio-Rad | -- | |
| CyclinD1抗体 | Zenbio | -- | |
| GRP78抗体 | Zenbio | -- | |
| p-PERK抗体 | Zenbio | -- | |
| PERK抗体 | Zenbio | -- | |
| CHOP抗体 | Zenbio | -- | |
| ATF4抗体 | Zenbio | -- | |
| c-Myc抗体 | Zenbio | -- | |
| Cleaved-caspase3抗体 | Wanleibio | -- | |
| PCNA抗体 | Elabscience | -- | |
| TSC1抗体 | Proteintech | -- | |
| TSC2抗体 | Proteintech | -- | |
| P70S6K抗体 | Proteintech | -- | |
| p-P70S6K抗体 | Proteintech | -- | |
| H3抗体 | Solarbio | -- | |
| H3K27me3抗体 | Solarbio | -- | |
| Tubulin抗体 | Servicebio | -- | |
| 二抗 | Proteintech | -- | |
| Western blot成像 | Amersham Imager 600 | -- | -- |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | -- | -- |
| 牛血清白蛋白 | Solarbio | -- | |
| DAPI | Solarbio | -- | |
| 激光扫描共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| 血液生化检测 | BUN检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- |
| CRE检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- | |
| 药物处理 | GSK-J4 | -- | -- |
| 雷帕霉素 | -- | -- | |
| 4-苯基丁酸 | -- | -- | |
| GSK2606414 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | MEFs来源(Tsc1+/−和Tsc2+/−原代细胞,来自Peking Union Medical College) 阅读提示:Materials and Methods, 4.1. Cell Cultures |
| 药物处理 | GSK-J4浓度(如2、4、6 µM)和处理时间(48小时) 阅读提示:Figure legends 3, 5, 6 |
| 药物处理 | ERS抑制剂4-PBA浓度(3 mM)与GSK-J4(6 µM)联用 阅读提示:Figure 4 legend |
| 药物处理 | PERK抑制剂GSK2606414浓度(10 µM)与GSK-J4(6 µM)联用 阅读提示:Figure 5 legend |
| 动物实验 | 小鼠基因型(Tsc1+/−和Tsc2+/−,C57BL/6背景),年龄12-13月龄,雄性,每组n=3 阅读提示:Materials and Methods, 4.12. In Vivo Animal Models |
| 动物实验 | 给药方案:GSK-J4(0.4 mg/kg,s.c.每日一次,10天);雷帕霉素(1 mg/kg,i.p.隔日一次,20天) 阅读提示:Materials and Methods, 4.12. In Vivo Animal Models |
| 统计 | 统计方法:t-test或one-way ANOVA,p<0.05为显著 阅读提示:Materials and Methods, 4.13. Statistical Analysis |