构建ATP再生级联表达载体
构建共表达AK、ADK、ACK的质粒,验证三酶级联的表达和功能性ATP再生。
通过重叠延伸PCR将AK、ADK、ACK基因组装到pET28a载体(两个版本:pET28a-aadck和pET28a-AADCK),转化大肠杆菌DH5α,再转入BL21(DE3)表达。
Synthesis and Biological Activity Characterization of Vascular Endothelial Growth Factor Using an Optimized Wheat Germ Cell-Free System.
研究包括分子克隆、原核表达、全细胞催化ATP合成、无细胞蛋白表达优化,以及细胞增殖、迁移、管形成等体外功能验证,并包含多种蛋白的表达验证。
人脐静脉内皮细胞(HUVECs) 人皮肤成纤维细胞(HSFs) 大肠杆菌BL21(DE3)工程菌株 麦胚无细胞蛋白合成系统
ATP再生酶级联反应(AK、ADK、ACK)的共表达及活性 全细胞催化ATP产生的条件(时间、温度、底物浓度等) 麦胚无细胞系统优化参数(WGE浓度、CrK、钾离子、镁离子等) VEGF165无细胞合成及纯化后的生物活性验证
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
构建共表达AK、ADK、ACK的质粒,验证三酶级联的表达和功能性ATP再生。
通过重叠延伸PCR将AK、ADK、ACK基因组装到pET28a载体(两个版本:pET28a-aadck和pET28a-AADCK),转化大肠杆菌DH5α,再转入BL21(DE3)表达。
优化全细胞催化条件,高效生产ATP。
使用表达级联酶的整细胞,在含腺苷、Mg2+、乙酰磷酸(ACP)的缓冲液中反应,优化时间、温度、底物浓度等参数。
建立并优化基于麦胚提取物的无细胞蛋白合成系统,实现多种功能性蛋白的高效表达。
制备麦胚提取物,进行体外转录和翻译,优化翻译条件(如WGE浓度、CrK、K+、Mg2+、氨基酸等),表达并检测多种蛋白。
利用优化系统合成VEGF165,并纯化获得高纯度蛋白。
通过IVT合成mRNA,在无细胞系统中翻译,使用Ni磁珠纯化,超滤脱盐,ELISA定量。
验证无细胞合成的VEGF165是否具有促进细胞增殖、迁移和血管生成等生物活性。
使用HUVECs和HSFs进行CCK-8、EdU、划痕实验、Transwell、管形成等实验,评估VEGF165活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 分子克隆 | pET28a质粒 | Sangon Biotech | -- |
| pEU质粒 | Tiangen Biotech | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 分子克隆 | 限制性内切酶 | Takara Bio | -- |
| 无细胞蛋白合成 | 核糖核酸酶抑制剂 | Promega | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Promega | -- | |
| 分子克隆 | FastPure凝胶DNA提取试剂盒 | Vazyme Biotech | -- |
| Western blot | 6×His标签单克隆抗体 | Proteintech Group | -- |
| 辣根过氧化物酶偶联的山羊抗小鼠IgG | Proteintech Group | -- | |
| 细胞活性检测 | Calcein AM/PI双染试剂盒 | Elabscience | -- |
| 细胞骨架染色 | 肌动蛋白示踪剂红-罗丹明 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 细胞核染色 | Hoechst 33342 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 细胞增殖检测 | Click-iT EdU-488细胞增殖检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 无细胞蛋白合成 | 重组蛋白PDI | Beyotime Biotechnology | -- |
| 蛋白纯化 | His标签蛋白纯化磁珠 | GenScript | -- |
| ATP检测 | 高效液相色谱 | -- | -- |
| PCR扩增 | Phanta Flash预混液 | Vazyme | -- |
| 体外转录 | Sp6 RNA聚合酶 | -- | -- |
| NanoDrop分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 蛋白检测 | 激光扫描共聚焦显微镜(LSM 900) | Carl Zeiss | -- |
| 蛋白纯化 | Ni磁珠 | GenScript | -- |
| 离心过滤器(3 kDa截留) | Merck | -- | |
| 蛋白定量 | ELISA试剂盒 | Elabscience | H2158 |
| 细胞活性检测 | CCK-8试剂盒 | Solarbio | -- |
| 细胞活力检测 | 酶标仪 | Leica | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| ATP再生工程菌构建 | 菌株:E. coli BL21(DE3);质粒:pET28a-aadck和pET28a-AADCK;诱导剂IPTG浓度0.1 mM;诱导温度16°C或25°C。 阅读提示:见Materials and Methods第2.6节和第3.3节,以及图2 |
| 全细胞催化ATP生产 | 反应时间3.5小时,温度35°C,ACP浓度140 mM,Mg2+浓度16 mM,细胞浓度8 g/L,pH 7.5。 阅读提示:见Materials and Methods第2.6节和图3 |
| 麦胚无细胞蛋白合成系统优化 | WGE浓度60%,CrK浓度0.5 mg/mL,K+浓度200 mM,Mg2+浓度3 mM,氨基酸浓度0.6 mM,肌酸磷酸浓度4 mM;翻译条件15°C,15小时。 阅读提示:见Materials and Methods第2.9节和图5 |
| VEGF165合成与纯化 | IVT条件:37°C,3-6小时;翻译条件:15°C,15小时,无DTT,添加PDI 0.2 mg/mL;纯化使用Ni磁珠,超滤截留3 kDa。 阅读提示:见Materials and Methods第2.8-2.10节和补充材料 |
| 细胞生物活性验证 | 细胞类型:HUVECs和HSFs;VEGF165浓度150 pg/mL(划痕和管形成实验);处理时间:CCK-8 1天,EdU 12小时,管形成4小时;重复数n=3。 阅读提示:见Materials and Methods第2.11节和图6、图7 |