猪初乳免疫球蛋白与肠道菌群关联分析
比较NX和LW母猪初乳免疫球蛋白水平,并鉴定与免疫球蛋白相关的差异肠道菌群。
收集母猪粪便和初乳,进行16S rDNA测序和LEfSe分析,并采用Spearman相关分析差异菌群与免疫球蛋白水平的关系。
Maternal supplementation with Lactobacillus reuteri enhances colostrum sIgA secretion and immune function of offspring.
包含猪粪便16S测序与初乳Ig相关性分析、LR分离培养、小鼠孕期干预和后代ETEC攻毒实验,并进行了功能与机制验证(qPCR、Western blot、ELISA、免疫荧光)。
宁乡猪(NX)和长白猪(LW)母猪 孕期BALB/C小鼠模型 ETEC挑战的断奶后代小鼠
LR补充剂量:10¹⁰ CFU/kg日粮 LR补充时间:从妊娠第0.5天至泌乳第7天(LD7) ETEC攻毒剂量:10⁸ CFU/小鼠,口服灌胃 后代分组:CON+PBS、CON+ETEC、LR+ETEC 样本量:每组8只(部分实验为16只/组)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较NX和LW母猪初乳免疫球蛋白水平,并鉴定与免疫球蛋白相关的差异肠道菌群。
收集母猪粪便和初乳,进行16S rDNA测序和LEfSe分析,并采用Spearman相关分析差异菌群与免疫球蛋白水平的关系。
从NX猪粪便中分离LR菌株并鉴定其特性。
将粪便样本在MRS琼脂上厌氧培养,挑取疑似菌落纯化,通过16S rRNA基因测序(引物27F/1492R)鉴定菌种。
验证LR补充对母体乳腺IgA分泌、肠道免疫和菌群的影响。
将孕鼠随机分为CON和LR组,LR组饲喂含LR的日粮,收集初乳、乳腺、回肠和结肠内容物,检测IgA/sIgA、pIgR、细胞因子、SCFA和菌群。
评估母体LR补充对后代抵抗ETEC感染的能力。
断奶后,将CON和LR组后代分别用PBS或ETEC攻毒,24小时后检测体重、脾脏指数、血清LPS和细胞因子,以及回肠屏障基因表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细菌培养 | MRS琼脂 | -- | -- |
| 酶标仪(Infinite M PLEX,TECAN) | TECAN | -- | |
| 16S测序 | AMPure XT磁珠 | Beckman Coulter Genomics | -- |
| Qubit荧光计 | Invitrogen | -- | |
| Illumina NovaSeq平台 | Illumina | -- | |
| qPCR | Seno粪便基因组DNA提取试剂盒 | Seno | -- |
| 免疫球蛋白定量 | ELISA定量试剂盒 | Elabscience Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| 血清参数测定 | 内毒素检测试剂盒(动态显色法) | Xiamen Bioendo Technology co., Ltd. | -- |
| 细胞因子检测 | 小鼠Th1/Th2/Th17 CBA试剂盒 | BD Biosciences | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂(P1048) | Beyotime | P1048 | |
| BCA蛋白浓度测定试剂盒(P0012) | Beyotime | P0012 | |
| 一抗和二抗(AF2800,HAF017) | R&D Systems | AF2800, HAF017 | |
| 化学发光试剂(P10300) | NCM Biotech | P10300 | |
| RT-PCR | Trizol试剂 | Takara | -- |
| Nanodrop One分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Premix Taq | Takara | -- | |
| TB Premix Ex Taq | Takara | -- | |
| LightCycler480II实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| 免疫荧光 | Quickblock免疫染色封闭液 | Beyotime | -- |
| 共聚焦荧光显微镜(Zeiss) | Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 母猪菌群与初乳分析 | 每组9头母猪;分娩时采集粪便和初乳;16S测序V3-V4区;LEfSe LDA>3,P<0.05;Spearman相关性分析 阅读提示:Methods: Sows and sample collection; DNA extraction and 16S rDNA gene sequencing; Results: Fig. 1 |
| LR分离培养 | MRS琼脂厌氧培养;37°C,24小时;分离菌株16S rRNA测序;鉴定为LR DSM 20016(99.86%相似性) 阅读提示:Methods: Isolation and culture of the bacterial strain of LR; Results: Fig. 2 |
| 孕期小鼠干预 | 7周龄BALB/C小鼠;32只孕鼠随机分组(n=16/组);LR剂量10¹⁰ CFU/kg日粮;干预时间从GD0.5至LD7;后标准饮食至断奶 阅读提示:Methods: Mice experiment design; Fig. 3 |
| 后代ETEC攻毒 | ETEC O149:K91,K88ac,剂量10⁸ CFU/小鼠,口服灌胃100µL;分组:CON+PBS、CON+ETEC、LR+ETEC,每组8只;攻毒后24小时采样 阅读提示:Methods: Mice experiment design; Fig. 7 |
| 分子检测 | RT-PCR引物序列见补充表1;Western blot抗体(AF2800, HAF017);ELISA试剂盒(Elabscience);内毒素检测试剂盒(Bioendo) 阅读提示:Methods: Real-time PCR; Western blotting; Quantitation of immunoglobulins; Serum parameters assay |