鉴定PIH1D1与HPV E7的相互作用
验证HPV E7是否为R2TP复合物的相互作用伙伴。
在HeLa和CaSki细胞中进行内源共免疫沉淀,使用抗PIH1D1和抗E7抗体,并设IgG对照。
The R2TP complex stabilises E7 to drive human papillomavirus-mediated pathogenesis in cellular models of cervical cancer.
包含细胞系(HeLa、CaSki等)中的内源共免疫沉淀、体外GST pull-down、定点突变验证、功能实验(MTT、伤口愈合)和患者组织免疫组化等多个证据层级。
HeLa细胞(HPV18阳性) CaSki细胞(HPV16阳性) C33A细胞(HPV阴性宫颈上皮细胞) 宫颈癌患者组织样本
HPV E7蛋白与PIH1D1的相互作用依赖于CK2磷酸化,S32是关键丝氨酸残基。 PIH1D1敲低导致E7蛋白半衰期缩短(HeLa细胞中由45-90分钟降至30-45分钟)。 PIH1D1敲低显著降低CaSki细胞的增殖和迁移能力。 CX-4945处理破坏PIH1D1与E7的相互作用(2.5 μM,24小时)。 宫颈癌组织中PIH1D1、RPAP3和RUVBL1过表达(34例癌组织 vs 10例正常组织)。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证HPV E7是否为R2TP复合物的相互作用伙伴。
在HeLa和CaSki细胞中进行内源共免疫沉淀,使用抗PIH1D1和抗E7抗体,并设IgG对照。
确认E7与PIH1D1的相互作用依赖于CK2磷酸化,并检测与pRB的结合。
纯化GST标签的E7蛋白,进行体外激酶实验,与T98G细胞裂解液孵育后进行GST pull-down和Western blot。
确定E7上CK2磷酸化位点(S31和S32)是否为与PIH1D1结合所必需。
通过定点突变构建HPV16 E7的S31A、S32A和S31/32A突变体,表达GST融合蛋白,进行体外激酶实验和GST pull-down。
证明在宫颈癌细胞中E7介导pRB与PIH1D1/R2TP复合物的相互作用。
在CaSki细胞中敲低E7,免疫共沉淀检测pRB与PIH1D1的结合变化;同时用GST-PIH1D1和pRB过表达验证。
确定PIH1D1在宫颈癌细胞增殖、迁移和E7稳定性中的作用。
使用siRNA敲低PIH1D1,通过MTT和伤口愈合实验评估增殖和迁移;通过放线菌酮追踪实验分析E7半衰期。
检查R2TP复合物组分在宫颈癌组织中的表达水平。
对34例宫颈癌和10例正常宫颈组织进行免疫组化染色,检测PIH1D1、RPAP3和RUVBL1的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | HiMedia | AL007A |
| RPMI培养基 | Gibco | 164011875093 | |
| 胎牛血清 | Gibco | 10270106 | |
| 抗生素-抗真菌剂100X | Gibco | 15240096 | |
| 胰蛋白酶-EDTA溶液1X | HiMedia | TCL014 | |
| 克隆 | In-Fusion® HD克隆试剂盒 | Takara Bio USA, Inc. | 102518 |
| Thermo Scientific™ FastDigest EcoR1 | Thermo Scientific | FD0275 | |
| BamH1 | Thermo Scientific | FD0054 | |
| T4 DNA连接酶 | Thermo Scientific | EL0011 | |
| 定点突变 | Phusion定点突变试剂盒 | Thermo Scientific | F541 |
| 质粒提取 | QIAprep离心柱小提试剂盒 | -- | 27104 |
| 蛋白纯化 | LB培养基 | HiMedia | M1245 |
| 异丙基-β-D-1-硫代半乳糖苷 | Promega | V3953 | |
| 月桂酰肌氨酸钠 | SRL | 74090 | |
| Triton X-100 | BR Biochem Life Sciences | BC0198 | |
| 谷胱甘肽树脂 | GBioScience | 786-280 | |
| 考马斯亮蓝 | SRL | 93473 | |
| 牛血清白蛋白 | NEB | B9200S | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A/G PLUS-琼脂糖 | Santa Cruz | sc-2003 |
| 体外激酶实验 | 酪蛋白激酶2 | New England Biolabs | P6010S |
| 三磷酸腺苷 | New England Biolabs | P0756S | |
| 转染 | Lipofectamine™ 3000转染试剂 | Invitrogen | L3000001 |
| Lipofectamine RNAiMax试剂 | Invitrogen | 13778030 | |
| AllStars阴性对照siRNA | Qiagen | 1027280 | |
| NOP17 siRNA(h) | Santa Cruz | sc-97385 | |
| HPV16 E7 siRNA (hpv) | Santa Cruz | sc-270423 | |
| Western blotting | PVDF膜 | Merck Millipore | -- |
| 丽春红S | SRL | 38610 | |
| 脱脂奶粉 | HiMedia | GRM1254 | |
| 牛血清白蛋白 | SRL | 85171 | |
| Pierce™ ECL蛋白质印迹底物 | Thermo Scientific | 32109 | |
| femtoLUCENT™ PLUS-HRP | G-Biosciences | 786-081 | |
| MTT assay | MTT试剂 | Invitrogen | M6494 |
| 二甲基亚砜 | 文中未明确说明 | -- | |
| 免疫荧光染色 | DAPI溶液 | Thermo Scientific | 62248 |
| 邻位连接实验 | Duolink®原位橙色起始试剂盒(小鼠/兔) | Sigma-Aldrich | DUO92102 |
| CX-4945 | MCE | HY-50855 | |
| 免疫组织化学 | UltraVision Quanto检测系统HRP DAB | Thermo Scientific | TL-060-QHD |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 蛋白相互作用验证 | 细胞系(HeLa, CaSki, T98G),裂解液用量,抗体浓度,孵育时间 阅读提示:Materials and methods: Co-immunoprecipitation, GST pull-down assay; Figure legends 1,2,5,6 |
| 定点突变 | 突变位点(S31A, S32A, S31/32A),测序验证 阅读提示:Materials and methods: Site-directed mutagenesis; Figure 5 |
| 功能实验 | siRNA浓度(100 nM),转染时间(48小时),MTT检测时间点(24-120小时),伤口愈合观察时间点(0, 24, 48小时) 阅读提示:Materials and methods: Transfection, MTT assay, Wound healing assay; Figure 8A,B |
| 蛋白稳定性实验 | 放线菌酮浓度(100 μg/ml),处理时间点(0-90分钟) 阅读提示:Materials and methods: Cycloheximide treatment; Figure 8D,E |
| 免疫组织化学 | 组织样本数量(34例癌,10例正常),染色强度评分标准 阅读提示:Materials and methods: Immunohistochemistry; Figure 9 |