构建和鉴定DNA疫苗
验证pVAX1-HA2-fimA及MyD88佐剂疫苗是否正确构建和表达
构建重组质粒,转化大肠杆菌,进行菌落PCR和Sanger测序确认序列;在HEK293T细胞中转染,通过RT-PCR和Western blot检测HA2、FimA和MyD88表达,CCK-8评估细胞增殖。
Intranasal MyD88-adjuvanted DNA vaccine against P. gingivalis in rat periodontitis.
包含体外293T细胞表达验证、大鼠牙周炎模型免疫效果评估、流式细胞术分析免疫细胞、RNA-seq转录组机制探索及安全性评估。
SD大鼠牙周炎模型 HEK293T细胞
MyD88佐剂组(E组)给予100 μg pVAX1-HA2-fimA-MyD88,鼻内免疫,共3次 牙周炎模型通过结扎上颌第二磨牙建立,4周后确认模型成功 免疫时间点为9、10、12周,检测时间点为9、13、17周 每组样本量:免疫学检测n=3,骨丢失分析n=3 统计分析使用单因素方差分析和事后Tukey检验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证pVAX1-HA2-fimA及MyD88佐剂疫苗是否正确构建和表达
构建重组质粒,转化大肠杆菌,进行菌落PCR和Sanger测序确认序列;在HEK293T细胞中转染,通过RT-PCR和Western blot检测HA2、FimA和MyD88表达,CCK-8评估细胞增殖。
确定最优免疫剂量
15只SD大鼠随机分为5组(每组3只),分别给予生理盐水、100 μg空载体和50、100、200 μg重组疫苗,鼻内免疫,每周收集唾液,ELISA检测SIgA。
建立牙周炎模型并分配实验组
通过在SD大鼠上颌第二磨牙结扎3-0丝线诱导牙周炎,4周后通过H&E染色和micro-CT确认模型成功,剩余大鼠随机分为5组(A-E)。
评估疫苗诱导的黏膜和全身免疫反应
在模型建立后9、10、12周进行鼻内免疫,在9、13、17周收集血液和唾液,ELISA检测抗体和细胞因子;在13周安乐死部分大鼠,流式分析脾脏和肠系膜淋巴结免疫细胞。
评估疫苗对牙槽骨丢失的保护作用
在17周收集上颌骨,micro-CT扫描并三维重建,测量CEJ-ABC距离评估骨丢失。
评估疫苗的安全性
每周记录体重,实验终点收集主要器官进行H&E染色检查。
探索MyD88佐剂增强免疫原性的分子机制
对13周脾脏样本进行RNA-seq,分析差异表达基因,进行GO和GSEA富集,构建PPI网络,并用RT-qPCR验证关键DEGs。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM高糖培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 细胞转染 | 脂质体转染试剂3000 | Thermo Fisher | -- |
| Western blot | Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher | -- |
| PageRuler预染蛋白Marker | Thermo Fisher | -- | |
| RT-qPCR | PrimeScript逆转录试剂盒 | Takara | -- |
| TB Green Premix Ex Taq II | Takara | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Takara | -- |
| PCR | 2× SanTaq PCR预混液 | Sigma | -- |
| 流式细胞术 | 细胞刺激和蛋白转运抑制剂试剂盒 | Elabscience | -- |
| 抗体检测 | 辣根过氧化物酶标记抗大鼠IgA抗体 | Abcam | -- |
| 流式细胞术 | 抗CXCR5抗体 | Abcam | -- |
| Western blot | 抗Tubulin抗体 | Bioworld | -- |
| 动物实验 | 异氟烷 | RWD | -- |
| ELISA | 抗HA2抗体 | -- | -- |
| 抗FimA抗体 | -- | -- | |
| 流式细胞术 | APC抗大鼠CD45RA [OX-33] | -- | -- |
| FITC抗大鼠CD3 [G4.18] | -- | -- | |
| PE抗大鼠CD8a [OX-8] | -- | -- | |
| PerCP/Cyanine5.5抗大鼠CD3 [G4.18] | -- | -- | |
| FITC抗大鼠CD4抗体 | -- | -- | |
| PE抗ICOS (CD278) | -- | -- | |
| FITC抗大鼠CD4抗体 | BioLegend | -- | |
| IL-4单克隆抗体(Ox81) eFluor 660 | eBioscience | -- | |
| FITC小鼠抗大鼠IFN-γ (DB-1) | BD Pharmingen | -- | |
| Western blot | HRP标记山羊抗大鼠IgG | Proteintech | -- |
| CoraLite594山羊抗兔IgG | Proteintech | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 结扎时间、动物品系、年龄、性别、丝线规格 阅读提示:Methods: Experimental groups and periodontitis model establishment |
| 免疫方案 | 免疫剂量、途径、次数、时间点、麻醉方式 阅读提示:Methods: Vaccination and Efficacy Assessment |
| 抗体检测 | 样本类型、采集时间、检测指标、试剂盒 阅读提示:Methods: Vaccination and Efficacy Assessment; Results: Fig. 4 |
| 流式细胞术 | 组织来源、细胞表面标记、刺激条件 阅读提示:Methods: Vaccination and Efficacy Assessment; Figure legends: Fig. 5, 6 |
| 骨丢失评估 | 扫描参数、测量位点、统计方法 阅读提示:Methods: Quantification of Alveolar Bone Loss; Results: Fig. 7 |
| RNA-seq | 样本分组、测序平台、差异表达阈值、验证基因 阅读提示:Methods: Bioinformatics Analysis and Validation; Results: Fig. 9 |