临床样本和数据库筛选MYBL2表达及预后关联
评估MYBL2在LSCC中的表达水平及其与患者预后的关系
对20对LSCC肿瘤及癌旁组织进行RNA-seq,并结合TCGA和GSE59102数据集进行差异表达及单因素Cox回归分析;使用组织微阵列进行IHC染色验证。
The MYBL2-GTSE1 axis promotes laryngeal squamous cell carcinoma progression by regulating PI3K/AKT-dependent glycolytic reprogramming.
包含临床组织样本分析、体外细胞功能实验、代谢分析、转录调控验证及体内异种移植模型,并进行了功能回复实验。
LSCC细胞系AMC-HN-8 LSCC细胞系TU138 BALB/c裸鼠异种移植模型 临床LSCC组织及组织微阵列
MYBL2敲低在AMC-HN-8和TU138细胞中的效率及功能表型 MYBL2对GTSE1启动子的直接结合及转录激活 GTSE1敲低或PI3K抑制剂LY294002对MYBL2诱导功能的逆转作用 体内实验中MYBL2过表达和GTSE1敲低对肿瘤生长的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估MYBL2在LSCC中的表达水平及其与患者预后的关系
对20对LSCC肿瘤及癌旁组织进行RNA-seq,并结合TCGA和GSE59102数据集进行差异表达及单因素Cox回归分析;使用组织微阵列进行IHC染色验证。
验证MYBL2对LSCC细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡的影响
在AMC-HN-8和TU138细胞中敲低MYBL2,通过CCK-8、克隆形成、伤口愈合、Transwell和流式凋亡实验检测细胞功能。
探究MYBL2对LSCC细胞糖酵解和线粒体呼吸的影响
通过Seahorse XF96分析ECAR和OCR,并用Western blot检测糖酵解蛋白表达。
验证MYBL2是否直接结合GTSE1启动子并调控其转录
通过ChIP-qPCR和双荧光素酶报告实验,检测MYBL2与GTSE1启动子的结合及其对转录活性的影响。
确定GTSE1是否为MYBL2致癌功能的关键介质
在MYBL2过表达的同时敲低GTSE1,通过CCK-8、伤口愈合和Transwell实验检测细胞增殖、迁移和侵袭能力的变化。
在体内验证MYBL2-GTSE1轴对肿瘤生长的影响
在雌性BALB/c裸鼠皮下接种稳定转染的TU138细胞系(NC+shCtrl, MYBL2+shCtrl, NC+shGTSE1, MYBL2+shGTSE1),测量肿瘤体积和重量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 肿瘤组织分析 | TRIzol试剂 | Beyotime | R0016 |
| RT-qPCR | RevertAid第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | K1621 |
| Bestar SYBR Green 预混液 | DBI Bioscience | DBI-2073 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Beyotime | P1045 | |
| PVDF膜 | Merck | IPVH00010 | |
| 5%脱脂牛奶/TBST | Beyotime | ST828 | |
| ECL发光液 | Beyotime | P0018S | |
| 克隆形成 | 结晶紫 | Solarbio | G1062 |
| CCK-8 | CCK-8试剂 | Beyotime | C0038 |
| Transwell | 基质胶 | Beyotime | C0383 |
| 凋亡检测 | Annexin V-APC/PI凋亡检测试剂盒 | Elabscience | E-CK-A217 |
| 星形孢菌素 | Selleck | S1421 | |
| 代谢分析 | Seahorse XF96分析仪 | Agilent Technologies | -- |
| IHC | DAB显色剂 | Abcam | ab64238 |
| ChIP | 抗MYBL2抗体 | Proteintech | 18896-1-AP |
| 兔对照IgG | Abclonal | AC005 | |
| 蛋白A琼脂糖珠 | BIO-RAD | 1614813 | |
| 双荧光素酶实验 | 双荧光素酶报告检测试剂盒 | Beyotime | RG027 |
| 细胞培养 | 1640培养基 | BDBIO | L1039-500 |
| 动物实验 | 基质胶 | Corning | BD356234 |
| 药物处理 | LY294002 | Beyotime | S1737 |
| MK-2206 | Selleck | S1078 | |
| 二甲基亚砜 | Beyotime | Y026158 | |
| 细胞培养 | 嘌呤霉素 | Beyotime | ST551 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(AMC-HN-8, TU138等)及培养条件,慢病毒感染MOI=30,嘌呤霉素筛选浓度及时间(14天),药物处理浓度和时间(LY294002 10 μM, MK-2206 5 μM, 24小时)。 阅读提示:参见Materials and methods中的Cell culture, lentiviral transduction, and drug treatment部分。 |
| 功能实验 | 细胞接种密度(CCK-8:5000细胞/孔;克隆形成:500细胞/孔;Transwell:5×10^4细胞),处理时间(CCK-8 5天,克隆形成8天,伤口愈合48小时,Transwell 24小时),凋亡检测细胞量(1×10^5)。 阅读提示:参见Materials and methods中的对应实验小节。 |
| 代谢分析 | Seahorse分析仪型号,使用的试剂浓度(葡萄糖10 mM, 寡霉素1.5 μM, 2-DG 50 mM, FCCP 1.0 μM, 鱼藤酮/抗霉素A 0.5 μM),细胞数量归一化方式。 阅读提示:参见Materials and methods中的Measurement of ECAR and OCR部分。 |
| 转录调控验证 | ChIP实验中的交联条件、裂解和超声条件,抗体使用(anti-MYBL2 1μg,IgG对照),双荧光素酶报告实验的转染量(pGL3-GTSE1启动子质粒,MYBL2过表达质粒,pRL-TK内参)及检测时间点(48小时)。 阅读提示:参见Materials and methods中的Chromatin immunoprecipitation assay和Dual-luciferase reporter assays部分。 |
| 体内动物实验 | 小鼠品系、性别、周龄和体重(雌性BALB/c裸鼠4-5周龄,18-22g),分组和样本量(4组,每组3只),注射细胞数(1×10^6),观察时间(21天),肿瘤体积测量频率(每3-4天)。 阅读提示:参见Materials and methods中的Animals study部分。 |