筛选差异表达基因并验证NR4A3上调
在STZ诱导的DPN小鼠坐骨神经中筛选差异表达基因,并验证NR4A3的表达变化。
对正常小鼠和STZ诱导的糖尿病小鼠坐骨神经进行mRNA-seq,筛选差异表达基因,并通过western blot、qPCR和免疫组化验证NR4A3的表达。
NR4A3 alleviates diabetic neuropathy via GLS2-mediated mitochondrial repair and Schwann cell differentiation.
包含STZ诱导的体内DPN小鼠模型、高糖诱导的体外施万细胞模型,并通过AAV9和慢病毒进行功能获得与缺失验证,结合ChIP-seq、mRNA-seq及双荧光素酶报告基因验证机制。
STZ诱导的DPN小鼠模型 高糖诱导的施万细胞模型 HEK293T细胞
STZ剂量150 mg/kg腹腔注射,空腹血糖≥300 mg/dL视为糖尿病 AAV9-Mpz-NR4A3或AAV9-Mpz-Vector鞘内注射,剂量20 μL(10^12 vg/mL),注射速率≤5 μL/min 施万细胞高糖处理浓度100 mmol/L,处理48小时 慢病毒感染MOI=20 GLS2启动子NR4A3结合位点(-305至-297)突变为5'-GTCAGAAG-3'
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在STZ诱导的DPN小鼠坐骨神经中筛选差异表达基因,并验证NR4A3的表达变化。
对正常小鼠和STZ诱导的糖尿病小鼠坐骨神经进行mRNA-seq,筛选差异表达基因,并通过western blot、qPCR和免疫组化验证NR4A3的表达。
通过AAV9介导的施万细胞特异性NR4A3过表达,评估对DPN小鼠神经功能的影响。
对STZ诱导的DPN小鼠鞘内注射AAV9-Mpz-NR4A3或对照病毒,之后检测体重、空腹血糖、运动神经传导速度(MNCV)和感觉神经动作电位(SNAP),并用免疫荧光检测S100B和NR4A3表达。
探究NR4A3过表达对坐骨神经病理损伤和施万细胞分化状态的影响。
通过H&E染色、甲苯胺蓝染色和透射电镜观察神经纤维和髓鞘结构,并通过免疫荧光、qPCR和western blot检测去分化标志物(p-cJUN(S63)、p75NTR)和分化标志物(MBP、P0)的表达。
评估NR4A3过表达对DPN小鼠坐骨神经氧化应激和线粒体功能的影响。
检测GSH/GSSG比值、ROS水平(DHE染色)、ATP、FAD、NAD+/NADH比值和mtDNA含量。
在高糖诱导的施万细胞损伤模型中验证NR4A3的抗凋亡和维持分化作用。
用慢病毒过表达NR4A3,用高糖处理细胞,检测凋亡标志物cleaved caspase-3、去分化标志物p-cJUN(S63)、p75NTR和分化标志物MBP、P0的表达。
探究NR4A3对高糖诱导的施万细胞线粒体功能障碍的影响。
检测线粒体ROS(MitoSOX)、NAD+/NADH、ATP、FAD、mtDNA含量和复合物IV活性。
通过组学分析鉴定NR4A3的下游靶基因。
进行ChIP-seq和mRNA-seq,通过Venn分析筛选重叠基因,并利用IGV观察NR4A3在GLS2启动子区域的结合峰。
验证NR4A3是否直接结合GLS2启动子并促进其转录。
通过western blot和qPCR检测NR4A3过表达或敲低后GLS2的表达;通过双荧光素酶报告基因实验验证NR4A3对GLS2启动子活性的影响。
确定GLS2是否为NR4A3介导的线粒体保护所必需。
在NR4A3过表达的施万细胞中敲低GLS2,检测线粒体ROS、NAD+/NADH、ATP和FAD水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型建立 | 链脲佐菌素 | Macklin | S6089 |
| Western blot | 抗NR4A3抗体 | Santa Cruz | sc-393902 |
| 免疫荧光 | 抗S100B抗体 | Proteintech | 66616-1-Ig |
| Western blot | 抗GLS2抗体 | Affinity | DF13386 |
| 抗p-cjun(S63)抗体 | Thermo Fisher | PA5-17890 | |
| 免疫荧光、Western blot | 抗cleaved caspase 3抗体 | Affinity | AF7022 |
| Western blot | 抗MBP抗体 | Affinity | AF4085 |
| 抗P0抗体 | Abclonal | A21931 | |
| 抗p75NTR抗体 | Affinity | DF6821 | |
| SDS-PAGE凝胶 | Solarbio | D1010 | |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| 增强化学发光试剂 | Solarbio | PE0010 | |
| HE染色 | 伊红 | Sangon | A600190 |
| 甲苯胺蓝染色 | 甲苯胺蓝 | Solarbio | G3662 |
| RNA提取 | TRIpure试剂 | BioTeke | RP1001 |
| 线粒体ROS检测 | MitoTracker Green | Maokangbio | MX4309 |
| MitoSOX红色 | Maokangbio | MX4313 | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | PC0020 |
| cDNA合成 | All-in-One第一链cDNA合成试剂盒 | Magen Biotech | MD80101 |
| 氧化应激检测 | 总谷胱甘肽/氧化型谷胱甘肽比色法检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K097-M |
| ATP检测 | ATP检测试剂盒 | Byotime | S0026 |
| FAD检测 | 黄素腺嘌呤二核苷酸检测试剂盒 | Abcam | ab204710 |
| NAD+/NADH检测 | 辅酶I NAD(H)含量检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng | A114 |
| mtDNA提取 | 线粒体DNA提取试剂盒 | Biovision | K280-50 |
| 双荧光素酶报告基因实验 | 荧光素酶检测试剂盒 | KeyGen Biotech | KGE3302 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | STZ剂量150 mg/kg腹腔注射,空腹血糖≥300 mg/dL视为糖尿病;小鼠周龄8周,雄性C57BL/6 阅读提示:STAR Methods: Experimental model and study participant details |
| 病毒注射 | AAV9-Mpz-NR4A3或AAV9-Mpz-Vector鞘内注射,剂量20 μL(10^12 vg/mL),注射速率≤5 μL/min 阅读提示:STAR Methods: Experimental model and study participant details |
| 体外细胞实验 | 施万细胞高糖浓度100 mmol/L,处理48小时;慢病毒感染MOI=20 阅读提示:STAR Methods: Cell culture and lentiviral infection treatment; Figure 5 legend |
| 双荧光素酶实验 | GLS2启动子NR4A3结合位点(-305至-297)突变为5'-GTCAGAAG-3' 阅读提示:STAR Methods: Dual-luciferase assay |