分析GSE41418数据及建立CP小鼠模型
观察USP1在CP中的表达变化并建立可靠的小鼠模型。
分析GSE41418数据集,鉴定差异表达基因;用雨蛙素诱导C57BL/6J小鼠8周建立CP模型,通过病理染色和USP1表达检测验证模型。
A Novel Insight into Chronic Pancreatitis Pathogenesis: the USP1/ITGB5 Axis-Mediated Stellate Cell Activation.
包含体内小鼠模型、体外原代hPSCs、蛋白质组学、Co-IP、挽救实验及通路验证等多个独立证据层级。
C57BL/6J小鼠CP模型 原代人胰腺星状细胞(hPSCs)
8周雨蛙素诱导小鼠CP模型,剂量50 µg/kg,每日6次,每周3次 小鼠Usp1敲低使用慢病毒(2×10^6 TU)腹腔注射,2周后诱导CP hPSCs用hTGF-β1(5 ng/mL)处理24小时 ITGB5敲低或过表达均用慢病毒载体 PI3K激动剂740 YP预处理浓度20 µM,2小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
观察USP1在CP中的表达变化并建立可靠的小鼠模型。
分析GSE41418数据集,鉴定差异表达基因;用雨蛙素诱导C57BL/6J小鼠8周建立CP模型,通过病理染色和USP1表达检测验证模型。
验证Usp1在CP进展中的作用。
通过慢病毒介导的Usp1敲低,观察胰腺组织病理评分、胰腺重量/体重比、胰蛋白酶活性、炎症因子和纤维化指标。
验证USP1在PSC活化和ECM产生中的作用。
在hTGF-β1诱导的hPSCs中敲低USP1,检测USP1表达、ECM蛋白(COL1A1、COL1A2、FN)和α-SMA。
寻找USP1在PSC活化中的直接靶点。
通过IP-LC/MS和label-free proteomics鉴定与USP1相互作用的蛋白,与GSE41418分析交叉,确定ITGB5为候选;Co-IP验证交互,泛素化实验检测ITGB5泛素化水平。
验证ITGB5是否通过PI3K/AKT通路介导PSC活化。
在hPSCs中敲低ITGB5,检测PI3K/AKT磷酸化水平及PSC活化标志物;使用PI3K激动剂740 YP进行功能恢复实验。
确认ITGB5是USP1促进PSC活化的关键下游介质。
在USP1敲低的hPSCs中过表达ITGB5,检测ECM蛋白和α-SMA表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | 雨蛙素 | Macklin | B803321 |
| 细胞培养与处理 | 人转化生长因子-β1 | MCE | HY-P78668 |
| 740 YP | Aladdin | Y413859 | |
| 组织学分析 | 苏木素溶液 | Solarbio | H8070 |
| 伊红溶液 | Sangon | A600190 | |
| 天狼星红溶液 | Solarbio | G1471 | |
| 乙醇 | SINOPHARM | 10009218 | |
| 胰蛋白酶活性检测 | 胰蛋白酶活性比色检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K843-M |
| 羟脯氨酸检测 | 羟脯氨酸检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A030 |
| ELISA | 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | Lianke Biotechnology | EK282 |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | Lianke Biotechnology | EK206 | |
| 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | Lianke Biotechnology | EK201B | |
| 小鼠TGF-β1 ELISA试剂盒 | Lianke Biotechnology | EK981 | |
| 小鼠PDGFB ELISA试剂盒 | Wuhan Fine Biological Technology | EM0269 | |
| RNA提取 | TRIpure试剂 | BioTeke | RP1001 |
| cDNA合成 | All-in-One第一链合成预混液 | Magen Biotechnology | MD80101 |
| 实时荧光定量PCR | 2×Taq PCR预混液 | Solarbio | PC1150 |
| SYBR Green试剂 | Solarbio | SR4110 | |
| ExicyclerTM 96系统 | Bioneer | -- | |
| 蛋白提取 | RIPA蛋白裂解液 | Proteintech | PR20001 |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Proteintech | PK10026 |
| SDS-PAGE | SDS-PAGE凝胶试剂盒 | Proteintech | PR20003 |
| 蛋白质印迹 | PVDF膜 | Thermo Fisher Scientific | LC2005 |
| 增强型化学发光检测试剂盒 | Proteintech | PK10003 | |
| 免疫荧光 | 牛血清白蛋白 | Sangon Biotech | A602440-0050 |
| DAPI | Aladdin | D106471-5 mg | |
| 曲拉通X-100 | Beyotime | ST795 | |
| 蛋白质印迹 | USP1抗体 | Proteintech | 14346-1-AP |
| FN抗体 | ABclonal | A16678 | |
| COL1A1抗体 | Zenbio | R26615 | |
| COL1A2抗体 | Zenbio | 343277 | |
| 蛋白质印迹/免疫沉淀 | ITGB5抗体 | Santa Cruz | SC398214 |
| 蛋白质印迹 | PI3K抗体 | Affinity | AF6242 |
| p-PI3K抗体 | Affinity | AF3242 | |
| AKT抗体 | Affinity | AF6261 | |
| p-AKT抗体 | Affinity | AF0016 | |
| β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| 免疫荧光 | α-SMA抗体 | Affinity | AF1032 |
| COL1A1抗体 | Affinity | AF7001 | |
| 免疫沉淀 | 泛素抗体 | Abcam | Ab134953 |
| 蛋白质印迹/免疫沉淀 | 山羊抗兔IgG-HRP | Proteintech | SA00001-2 |
| 蛋白质印迹 | 山羊抗小鼠IgG-HRP | Proteintech | SA00001-1 |
| 免疫荧光 | 山羊抗兔IgG-Alexa Fluor | Invitrogen | A27039 |
| 免疫共沉淀 | Protein G磁珠 | Proteintech | PR40025 |
| 蛋白质组学 | 二硫苏糖醇 | Amresco | M109-5G |
| 质谱分析 | Q Exactive HF-X质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 高效液相色谱 | 高效液相色谱系统(RIGOL L-3000) | RIGOL TECHNOLOGIES | L-3000 |
| 显微镜 | 光学显微镜(BX53) | Olympus | BX53 |
| 酶标仪 | ELX-800酶标仪 | BIOTEK | ELX-800 |
| RNA浓度测定 | Nanodrop One分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | C57BL/6J小鼠周龄、雨蛙素剂量、注射频率和持续时间、对照组处理 阅读提示:Methods中的Animal Model |
| 细胞培养与处理 | hPSCs来源、TGF-β1浓度和处理时间、慢病毒感染条件、740 YP浓度和预处理时间 阅读提示:Methods中的Cell Culture |
| 组织学分析 | 切片厚度、染色时间、病理评分标准 阅读提示:Methods中的Histopathological Analysis |
| 分子检测 | 抗体稀释比例、ELISA试剂盒型号、RNA提取和qPCR条件 阅读提示:Methods中的Western Blot, ELISA, Real time PCR |
| 机制验证 | Co-IP和泛素化检测的条件,包括抗体量、孵育时间、Protein G beads体积 阅读提示:Methods中的Co-immunoprecipitation (Co-IP) and Ubiquitination Assay |