细胞模型建立与转染
建立表达WT、G2019S和I1371V LRRK2的细胞模型,以比较突变效应
在SH-SY5Y、U87和iPSC来源的FPCs中,利用jetPRIME转染pDEST51-LRRK2-WT、G2019S、I1371V质粒,并用杀稻瘟菌素筛选稳定表达。
Membrane Dysfunction as a Central Mechanism in LRRK2-Associated Parkinson's Disease: Comparative Analysis of G2019S and I1371V Variants.
包含多种细胞模型(SH-SY5Y、U87、iPSC来源FPCs)上的功能验证(膜流动性、胆固醇含量、拓扑、DAT功能),以及机制验证(Rab8A/Rab10磷酸化、脂质组学)和药理学干预。
SH-SY5Y细胞 U87细胞 健康人iPSC来源底板细胞(FPCs)
细胞系:SH-SY5Y、U87、FPCs 质粒:pDEST51-LRRK2-WT、-G2019S、-I1371V,转染时间18小时(SH-SY5Y/U87)或4小时(FPCs) 抑制剂处理:10 μM MLi-2、10 μM GW5074,处理24小时 胆固醇检测:总胆固醇和膜胆固醇(ELISA) 膜流动性:TMA-DPH荧光偏振,测量各向异性 多巴胺摄取:50 μM多巴胺处理2小时,ELISA检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立表达WT、G2019S和I1371V LRRK2的细胞模型,以比较突变效应
在SH-SY5Y、U87和iPSC来源的FPCs中,利用jetPRIME转染pDEST51-LRRK2-WT、G2019S、I1371V质粒,并用杀稻瘟菌素筛选稳定表达。
评估LRRK2突变对膜胆固醇含量和膜流动性的影响
使用ELISA检测总胆固醇和膜胆固醇,使用TMA-DPH荧光偏振测量膜各向异性。
检测LRRK2突变对细胞膜微域结构和拓扑的影响
利用免疫细胞化学和流式检测caveolin-1表面表达,并采用原子力显微镜(AFM)观察膜拓扑和微域结构。
全面评估LRRK2突变对膜脂质组成的影响
提取膜脂质,通过LC-MS/MS进行脂质组学分析,比较WT、G2019S和I1371V细胞间脂质峰面积。
评估LRRK2突变对多巴胺能功能的影响
通过免疫细胞化学和流式检测细胞表面DAT表达,并用多巴胺ELISA检测细胞多巴胺摄取。
验证LRRK2突变对自磷酸化和底物磷酸化的影响
通过免疫细胞化学、流式和免疫印迹检测pS1292 LRRK2、pRab8A和pRab10水平。
比较非选择性LRRK2调节剂GW5074和激酶选择性抑制剂MLi-2对I1371V突变效应的挽救效果
用10 μM MLi-2或GW5074处理I1371V转染的SH-SY5Y和U87细胞24小时,评估Rab磷酸化、膜流动性、膜胆固醇、caveolin-1表达和膜拓扑。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F-12培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Himedia | -- | |
| Glutamax添加剂 | Gibco | 35050061 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15070063 | |
| iPSC培养 | 基因敲除血清替代物 | Gibco | 10828028 |
| 非必需氨基酸 | Gibco | 11140050 | |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | Immunotools | 11343627 | |
| Geltrex基质胶 | Gibco | A1413302 | |
| StemFlex培养基 | Gibco | A3349401 | |
| 神经分化 | Neurobasal培养基 | Gibco | 10888022 |
| 神经诱导添加剂 | Gibco | A1647701 | |
| StemPro Accutase消化液 | Gibco | A1110501 | |
| Advanced DMEM/F-12培养基 | Gibco | 12634010 | |
| 成纤维细胞生长因子8 | Immunotools | 11344836 | |
| 转染 | jetPRIME DNA转染试剂 | Polyplus-transfection | -- |
| pDEST51-LRRK2-WT质粒 | Addgene | #25080 | |
| pDEST51-LRRK2-G2019S质粒 | Addgene | #29401 | |
| pDEST51-LRRK2-I1371V质粒 | Addgene | #29399 | |
| 杀稻瘟菌素 | Invitrogen | -- | |
| 药物处理 | MLi-2 | Cayman Chemical | 19305 |
| GW5074 | Cayman Chemical | 10010368 | |
| RNA提取 | TRIzol-LS试剂 | Invitrogen | 15596018 |
| RT-PCR | PrimeScript逆转录试剂盒 | TaKaRa | RR037A |
| EmeraldAmp PCR预混液 | TaKaRa | RR310A | |
| 免疫染色 | Triton X-100 | Himedia | RM845 |
| 牛血清白蛋白 | Himedia | MB083 | |
| DAPI | Sigma | -- | |
| DABCO抗淬灭剂 | -- | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| PageRuler预染近红外蛋白Ladder | Thermo Fisher Scientific | 26635 | |
| 膜流动性 | TMA-DPH探针 | -- | T204 |
| 胆固醇检测 | 总胆固醇比色试剂盒 | Elabscience | E-BC-K109-S |
| 多巴胺摄取 | 多巴胺 | Sigma | H8502G |
| 多巴胺ELISA试剂盒 | KINESISDx | K12-1302 | |
| AFM | 甲基-β-环糊精 | Sigma | -- |
| 脂质组学 | SPLASH脂质组学质谱内标 | -- | 330707 |
| 仪器 | EVOS M5000显微镜 | Thermo Fisher Scientific | AMF5000 |
| BD FACSVerse流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| Axio Observer.Z1/7共聚焦显微镜 | ZEISS | -- | |
| ZEISS LSM 980共聚焦显微镜 | ZEISS | -- | |
| Sapphire FL成像系统 | Azure Biosystems | -- | |
| Spark多功能酶标仪 | Tecan | -- | |
| Cole-Parmer匀浆器 | Cole-Parmer | -- | |
| NX20原子力显微镜 | PARK Systems | -- | |
| Dionex Ultimate3000超高效液相色谱 | Thermo Fisher | -- | |
| Q Exactive质谱仪 | Thermo Fisher | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与转染 | 细胞系(SH-SY5Y、U87、iPSC来源FPCs)、质粒(pDEST51-LRRK2-WT/G2019S/I1371V)、转染试剂(jetPRIME)、转染时间(SH-SY5Y/U87 18h,FPCs 4h)、筛选抗生素浓度(杀稻瘟菌素2 mg/mL 48h,FPCs 1.5 mg/mL 2h) 阅读提示:Methods 2.2 和 2.3 |
| 药物处理 | 药物(MLi-2、GW5074)浓度(10 μM)、处理时间(24小时)、对照组设置 阅读提示:Methods 2.3 和 Figure legends 8-10 |
| 膜胆固醇和膜流动性 | 细胞数量、膜组分分离方法、胆固醇ELISA试剂盒、TMA-DPH浓度和孵育时间、各向异性测量条件 阅读提示:Methods 2.8 和 2.9 |
| 多巴胺转运体与多巴胺摄取 | 多巴胺浓度(50 μM)、处理时间(2小时)、SH-SY5Y细胞、DAT检测方法(免疫染色/流式) 阅读提示:Methods 2.10 和 Figure 5 |
| LRRK2底物磷酸化 | 抗体(pRab8A、Rab8A、pRab10、Rab10、pS1292 LRRK2)、检测方法(ICC、FACS、Western blot)、定量方法(CTCF、荧光比值) 阅读提示:Methods 2.5-2.7 和 Figure 6-7 |
| 脂质组学 | 膜脂质提取方法(Folch法)、内标(SPLASH LIPIDOMIX)、LC-MS/MS参数、样本量(N=3) 阅读提示:Methods 2.12 和 2.13 |