临床样本分析
评估GAS6-AS2在AS患者血清中的表达及其诊断和预后价值。
收集107例AS患者和105例健康对照的血清,通过RT-qPCR检测GAS6-AS2表达,分析其与临床指标的相关性,并进行ROC曲线、K-M生存分析和Cox回归。
LncRNA GAS6-AS2 regulates vascular smooth muscle cell senescence through the miR-138-5p/AKT1 axis and serves as a diagnostic and prognostic marker for atherosclerosis.
包含临床样本分析、细胞模型验证、双荧光素酶报告实验、功能拯救实验等多个独立证据层级,并进行了功能与机制验证。
ox-LDL诱导的血管平滑肌细胞(VSMCs) 动脉粥样硬化患者血清样本
动脉粥样硬化患者血清样本(107例)和健康对照(105例) ox-LDL浓度(0, 20, 40, 80 µg/mL)处理VSMCs 24小时 si-GAS6-AS2、miR-138-5p mimics/inhibitors、oe-AKT1转染 SA-β-Gal阳性细胞比例、衰老相关基因(p16, p21, p53)及炎症因子(IL-6, IL-1β)检测 双荧光素酶报告基因实验验证miR-138-5p与GAS6-AS2和AKT1的结合
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估GAS6-AS2在AS患者血清中的表达及其诊断和预后价值。
收集107例AS患者和105例健康对照的血清,通过RT-qPCR检测GAS6-AS2表达,分析其与临床指标的相关性,并进行ROC曲线、K-M生存分析和Cox回归。
建立AS细胞模型,观察ox-LDL对VSMC活力、衰老和炎症的影响。
使用不同浓度ox-LDL(0、20、40、80 µg/mL)处理VSMCs 24小时,检测细胞活力、SA-β-Gal阳性细胞比例、衰老相关基因和炎症因子水平。
验证GAS6-AS2敲低对ox-LDL诱导的VSMC衰老和炎症的影响。
将si-GAS6-AS2转染至VSMCs,检测GAS6-AS2表达、SA-β-Gal阳性细胞、衰老相关基因和炎症因子水平。
预测GAS6-AS2可能结合的miRNA及其靶基因,构建ceRNA调控轴。
通过lncRNASNP数据库预测GAS6-AS2结合的miRNAs,通过starBase预测miR-138-5p靶基因并与GeneCard中AS相关基因取交集,对交集基因进行GO和KEGG分析。
验证GAS6-AS2是否直接结合miR-138-5p并影响其表达。
通过双荧光素酶报告基因实验检测miR-138-5p mimics对GAS6-AS2-WT和MUT荧光素酶活性的影响;RT-qPCR检测AS患者血清和ox-LDL处理的VSMCs中miR-138-5p的表达,以及si-GAS6-AS2对miR-138-5p表达的影响。
验证miR-138-5p是否靶向AKT1并抑制其表达。
通过双荧光素酶报告基因实验检测miR-138-5p mimics对AKT1-WT和MUT荧光素酶活性的影响;RT-qPCR检测AS患者血清和ox-LDL处理的VSMCs中AKT1表达,以及anti-miR-138-5p对AKT1表达的影响。
验证GAS6-AS2通过miR-138-5p/AKT1轴调控ox-LDL诱导的VSMC衰老和炎症。
在ox-LDL诱导的VSMCs中共转染si-GAS6-AS2、anti-miR-138-5p、oe-AKT1等,检测AKT1表达、SA-β-Gal阳性细胞、衰老相关基因和炎症因子水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | VSMCs专用培养基 | Gibco | -- |
| 氧化低密度脂蛋白 | Sigma-Aldrich | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | -- | -- |
| PrimeScript逆转录试剂盒 | TaKaRa | -- | |
| SYBR Green预混液 | Roche | -- | |
| 细胞转染 | GAS6-AS2小干扰RNA | GenePharma | -- |
| miR-138-5p模拟物 | GenePharma | -- | |
| miR-138-5p抑制剂 | GenePharma | -- | |
| AKT1过表达载体 | GenePharma | -- | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Dojindo | -- |
| 细胞衰老检测 | SA-β-Gal细胞衰老荧光检测试剂盒 | Elabscience | -- |
| 双荧光素酶报告实验 | 荧光素酶报告质粒 | Yeason | -- |
| 双荧光素酶基因检测试剂盒 | Yeason | -- | |
| ELISA | IL-6和IL-1β ELISA试剂盒 | Abcam | -- |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 细胞凋亡分析 | BD FACS Calibur流式细胞仪 | BD | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | AS患者和健康对照的纳入标准、排除标准、样本量、基线特征(如年龄、性别、BMI等) 阅读提示:Materials and methods: Research objects and sample collection; Table 2 |
| 细胞培养和ox-LDL处理 | VSMCs来源、培养基(Gibco VSMCs-specific medium)、培养条件(37°C, 5% CO2)、细胞密度(1×10^4 cells/well)、ox-LDL浓度(0、20、40、80 µg/mL)和处理时间(24小时) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and construction of ox-LDL injury model; Figure 2 legend |
| 细胞转染 | si-GAS6-AS2、miR-138-5p mimics/inhibitors、oe-AKT1的序列或来源(GenePharma)、转染试剂(Lipofectamine 3000)及使用浓度、转染时间(48小时) 阅读提示:Materials and methods: Cell transfection |
| 检测方法 | RT-qPCR引物序列(Table 1)、内参(GAPDH、U6)、SA-β-Gal检测试剂盒(Elabscience)及操作步骤、ELISA试剂盒(Abcam)及操作步骤、Western blot抗体信息及稀释比例 阅读提示:Materials and methods: RT-qPCR, Cell senescence, ELISA, Western blot; Table 1; Figure legends |
| 双荧光素酶报告实验 | GAS6-AS2和AKT1野生型/突变型载体构建(Yeason)、共转染的miR-138-5p mimics或miR-NC、检测时间(48小时) 阅读提示:Materials and methods: Dual-luciferase assay; Figure 4 and 5 legends |