融合事件可视化与分类
观察单个囊泡融合事件,区分不同的融合模式(收缩、关闭、停留)
使用全细胞电容记录和共聚焦成像,通过Atto 655和Atto 488染料标记融合孔状态,并对融合事件进行分类。
ATPase N-ethylmaleimide-sensitive factor mediated calcium dependent fusion pore closure and endocytosis.
包含多种独立证据层级:细胞模型(嗜铬细胞、DRG神经元、INS-1细胞)、基因敲除与回补、药理学抑制、FRET传感器机制验证,以及功能测定(内吞、RRP补充)。
大鼠肾上腺嗜铬细胞 大鼠背根神经节神经元 INS-1细胞(大鼠胰岛瘤细胞系)
NSF抑制剂浓度:NEM 1 μM,NSFp 10 μM,PAO 1 μM 基因编辑:CRISPR/Cas9 sgRNA序列靶向NSF,经Sanger测序验证 RNA干扰:NSF-siRNA cocktail (10 nM) 细胞外Ca2+浓度:2.5 mM用于慢速和快速内吞,5 mM用于过冲内吞;无Ca2+用于钙非依赖内吞
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
观察单个囊泡融合事件,区分不同的融合模式(收缩、关闭、停留)
使用全细胞电容记录和共聚焦成像,通过Atto 655和Atto 488染料标记融合孔状态,并对融合事件进行分类。
通过药理抑制剂或肽段阻断NSF活性,观察融合孔关闭的变化
使用NEM (1 μM)、NSFp (10 μM) 和PAO (1 μM)处理细胞,记录融合事件,分析关闭型融合比例、开放和关闭时间。
验证NSF在融合孔关闭中的必要性,并通过回补恢复功能
使用CRISPR/Cas9敲除INS-1细胞中的NSF,通过Western blot验证,并观察融合事件变化;回补通过过表达NSF-P2A-Clover实现。
评估NSF活性抑制对多种内吞形式的影响
通过全细胞电容记录测量去极化后的膜电容衰减,区分慢速、快速和过冲内吞,并检测RRP补充。
确定NSF是否参与钙非依赖的内吞
在无钙浴液中,用10次100 ms脉冲(5 Hz)刺激DRG神经元,记录内吞反应,比较NSF抑制剂处理前后的变化。
直接观察NSF对trans-SNARE复合物中间体的分解作用
构建VAMP2-Clover和syntaxin1-mRuby2 FRET传感器,在去极化刺激下实时监测FRET信号变化,并比较NSF抑制和对照组。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 低糖DMEM培养基 | Gibco | -- |
| RPMI 1640培养基 | HyClone | -- | |
| 胶原酶I | Sigma | -- | |
| 透明质酸酶 | Sigma | -- | |
| 多聚赖氨酸 | Sigma | -- | |
| β-巯基乙醇 | Solarbio | -- | |
| 脂质体转染试剂 | Yeasen | -- | |
| RNA干扰 | CALNP™ RNAi (D-nano) 转染试剂 | -- | -- |
| NSF-siRNA混合物 | Sangon | -- | |
| ATPase活性检测 | ATP活性检测试剂盒 | Elabscience | -- |
| 基因编辑 | LentiCRISPRv2-mCherry载体 | Addgene | -- |
| 病毒包装 | pMD2.G包装质粒 | Beyotime | -- |
| psPAX包装质粒 | Beyotime | -- | |
| 聚凝胺 | Yeasen | -- | |
| Western blot | β-actin抗体 | Servicebio | GB15003 |
| GAPDH抗体 | Servicebio | GB15004 | |
| Cas9抗体 | Abcam | ab191468 | |
| NSF抗体 | Boster | A00585 | |
| HRP偶联二抗 | Servicebio | GB23301/3 | |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 647偶联的抗兔IgG二抗 | Signalway Antibody | L3018 |
| 电生理记录 | EPC-10放大器 | HEKA | -- |
| Patch Master软件 | HEKA | -- | |
| 共聚焦成像 | TCS SP8共聚焦显微镜 | Leica | -- |
| 成像染料 | Atto 655染料 | Sigma | -- |
| Atto 488染料 | Sigma | -- | |
| 细胞培养 | Hoechst33342染料 | Yeason | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 大鼠品系、年龄、体重;细胞培养条件(培养基、血清、孵育时间) 阅读提示:Methods: Animals and cell culture |
| 电生理记录 | 细胞外液成分(Ca2+浓度、TTX等)、电极内液成分、去极化参数、记录温度 阅读提示:Methods: Electrophysiology |
| 融合事件成像 | 染料浓度(Atto 655/Atto 488)、激光波长、检测器设置、成像区域和时间分辨率 阅读提示:Methods: Confocal imaging; Figure legends |
| NSF抑制剂处理 | NEM、NSFp、PAO浓度和处理时间 阅读提示:Methods: Confocal imaging; Results and Figure legends |
| 基因敲除 | sgRNA序列、转染方法、敲除验证(Western blot、测序) 阅读提示:Methods: NSF-KO and rescue cell line generation |