冷冻保存卵巢组织的转录组分析
揭示冷冻保存诱导的卵巢损伤中差异表达基因和关键调控通路
对冷冻前后小鼠卵巢组织进行RNA-seq,鉴定差异表达基因,并通过热图分析铁死亡相关基因的表达变化。
Umbilical cord mesenchymal stem cells and their extracellular vesicles attenuate cryopreservation-induced ovarian injury via the suppression of ferroptosis in an in vitro culture system.
包含RNA-seq、体外培养模型、移植模型、卵母细胞发育评估等多层次证据,并进行了铁死亡相关分子和生化验证。
6-8周龄雌性BALB/c小鼠卵巢组织 人脐带间充质干细胞(UC-MSCs)及其来源的细胞外囊泡(MSC-EVs) 卵巢肾被膜下移植模型
小鼠品系和年龄:BALB/c,6-8周龄 体外培养系统:Matrigel包埋,transwell培养4天,培养基每48小时更换 UC-MSCs共培养浓度或剂量(文中未明确说明) MSC-EVs处理剂量:5.5×10^10 particles/mL Erastin浓度:30 μM,处理前2天;Fer-1浓度:50 μM,处理前2天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
揭示冷冻保存诱导的卵巢损伤中差异表达基因和关键调控通路
对冷冻前后小鼠卵巢组织进行RNA-seq,鉴定差异表达基因,并通过热图分析铁死亡相关基因的表达变化。
验证冷冻保存组织是否出现铁死亡特征,并用Erastin模拟铁死亡
通过免疫组化检测GPX4和ACSL4表达,比色法检测Fe2+和GSH,C11-BODIPY染色检测脂质过氧化;并用Erastin处理新鲜卵巢组织模拟铁死亡。
评估UC-MSCs是否通过抑制铁死亡减轻冷冻损伤
将冷冻卵巢组织与UC-MSCs共培养4天,检测铁死亡标志物、脂质过氧化、血管生成和凋亡指标,并与Fer-1处理组比较。
验证MSC-EVs的纯度、粒径和卵巢组织摄取效率
利用TEM、NTA和Western blot表征MSC-EVs;用PKH26标记后与冷冻卵巢组织共培养,通过共聚焦显微镜观察摄取情况。
评估MSC-EVs是否通过抑制铁死亡改善卵巢损伤
将冷冻卵巢组织与MSC-EVs共培养4天,检测HE染色、CD31、TUNEL、铁死亡标志物和脂质过氧化等指标。
验证UC-MSCs和MSC-EVs对冷冻卵巢移植后组织存活、血管化和功能恢复的影响
将冷冻卵巢组织经体外培养后移植至去势小鼠肾被膜下,通过HE染色、TUNEL、超声成像、ELISA评估移植物组织学、凋亡、血流和激素分泌。
评估UC-MSCs和MSC-EVs对冷冻卵巢组织卵母细胞成熟和早期胚胎发育的影响
从体外培养的卵巢组织获取GV卵母细胞,进行IVM、PA和胚胎培养,统计成熟率、激活率、2细胞率和囊胚率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F-12培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Beyotime | -- | |
| EV分离 | EV无血清MSC培养基 | Umibio | -- |
| 细胞外囊泡分离试剂盒 | Umibio | -- | |
| 磷酸盐缓冲液 | Gibco | -- | |
| EV表征 | 透射电子显微镜 | JEOL | -- |
| 纳米颗粒跟踪分析仪 | Particle Metrix | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Yeasen | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 抗CD9抗体 | Abcam | -- | |
| 抗CD81抗体 | Abcam | -- | |
| 抗Alix抗体 | Abcam | -- | |
| 抗Calnexin抗体 | Proteintech | -- | |
| 增强化学发光检测系统 | Tanon | -- | |
| 卵巢组织培养 | 基质胶 | Corning | -- |
| Transwell小室(0.4 μm,聚碳酸酯膜) | Corning | -- | |
| 药物处理 | Erastin | MedChemExpress | -- |
| Ferrostatin-1 | MedChemExpress | -- | |
| RNA-seq | RNeasy MinElute纯化试剂盒 | Qiagen | -- |
| BGISEQ-500测序平台 | BGI | -- | |
| EV追踪 | PKH26染料 | Sigma-Aldrich | -- |
| 免疫组化 | 柠檬酸钠缓冲液(10 mM,pH 6.0) | Beyotime | -- |
| 抗GPX4抗体 | ABclonal | -- | |
| 抗ACSL4抗体 | ABclonal | -- | |
| 抗CD31抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗兔IgG二抗 | ABclonal | -- | |
| DAB底物 | -- | -- | |
| 全景成像系统 | 3DHISTECH | -- | |
| Image-Pro Plus 6.0软件 | Media Cybernetics | -- | |
| 铁离子检测 | 亚铁比色法检测试剂盒 | Elabscience | -- |
| 酶标仪(SpectraMax iD3) | -- | -- | |
| 脂质过氧化检测 | C11-BODIPY(581/591)荧光探针 | MedChemExpress | -- |
| Hoechst 33342染色液 | Beyotime | -- | |
| 激光扫描共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| RT-qPCR | 组织总RNA提取试剂盒 | Yeasen | -- |
| cDNA合成试剂盒 | Takara | -- | |
| SYBR Green荧光染料 | -- | -- | |
| Roche实时定量PCR仪 | Roche | -- | |
| 引物 | Sangon Biotech | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 抗β-actin抗体 | ABclonal | -- | |
| HRP标记的抗兔IgG二抗 | ABclonal | -- | |
| 增强化学发光试剂盒 | Biosharp | -- | |
| 化学发光成像系统 | Tanon | -- | |
| 卵巢组织培养(移植前) | α-MEM培养基 | Gibco | -- |
| 重组人促卵泡激素 | Merck | -- | |
| 胰岛素-转铁蛋白-硒(ITS-G) | Gibco | -- | |
| 组织学分析 | 全自动高分辨率扫描仪 | 3DHISTECH | -- |
| 凋亡检测 | 一步法TUNEL原位凋亡检测试剂盒 | Elabscience | -- |
| 激光扫描共聚焦显微镜 | ZEISS | -- | |
| ZEN软件(v2.3) | -- | -- | |
| 超声成像 | 小动物彩色多普勒超声系统 | VINNO | -- |
| 激素检测 | ELISA试剂盒 | Elabscience | -- |
| 卵母细胞操作 | M16培养基 | Sigma-Aldrich | -- |
| 无钙CZB培养基 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 氯化锶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞松弛素B | Sigma-Aldrich | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | UC-MSCs的分离方法、培养条件(DMEM/F-12含10% FBS、青霉素-链霉素,37°C,5% CO2) 阅读提示:Materials and methods 2.1 Cell culture |
| EV分离和表征 | UC-MSCs传代至25-50%融合度,更换EV无血清培养基培养48小时,收集条件培养基使用商业试剂盒分离;EV浓度和纯度通过TEM、NTA和Western blot验证 阅读提示:Materials and methods 2.2 Isolation and characterization of MSC-EVs |
| 卵巢组织体外培养 | 卵巢组织来源(6-8周龄BALB/c小鼠)、冷冻和解冻方法(先前描述)、培养体系(Matrigel包埋、transwell、DMEM/F-12、4天、每48小时换液) 阅读提示:Materials and methods 2.3 In vitro culture of ovarian tissues and experimental design |
| 药物处理 | Erastin浓度30 μM,处理前2天;Fer-1浓度50 μM,处理前2天 阅读提示:Materials and methods 2.3 In vitro culture of ovarian tissues and experimental design |
| MSC-EVs处理 | EV浓度5.5×10^10 particles/mL,每次800 μL,处理4天 阅读提示:Materials and methods 2.5 Tracking of MSC-EVs and immunofluorescence assay |
| 移植实验 | 移植前体外培养4天(IVG培养基:MEMα+10% FBS+100 mIU/mL r-hFSH+1% ITS-G),移植至去势小鼠肾被膜下,每肾一个卵巢,观察第3、7天 阅读提示:Materials and methods 2.12 Ovarian tissue transplantation |
| 卵母细胞评估 | GV卵母细胞机械分离,IVM 14小时,PA用SrCl2和2.5 μg/mL cytochalasin B处理6小时,评估MII、PA、2细胞、囊胚率 阅读提示:Materials and methods 2.17 Oocyte retrieval, in vitro maturation (IVM) and parthenogenetic activation (PA) |