建立放射性肺损伤模型
在体内和体外模拟放射性肺损伤,以便研究其相关病理过程。
体内使用C57BL/6J小鼠进行胸部照射(8 Gy/天,连续3天);体外使用BEAS-2B细胞进行不同剂量(0、2、5、10 Gy)照射。
Ionizing radiation promotes lung injury by inducing ferroptosis-driven senescence in epithelial cells via NCOA4-mediated ferritinophagy.
研究包含体外BEAS-2B细胞模型、体内C57BL/6J小鼠模型及患者组织样本(未直接提及患者样本,但此处根据原文仅提及小鼠模型和细胞模型,无患者样本,因此依据为体外和体内模型及功能验证和机制验证),并同时进行了功能验证(Fer-1、3-MA、siRNA、化合物9a干预)和机制验证(Co-IP、铁蛋白自噬检测、线粒体功能评估)。
BEAS-2B人正常肺上皮细胞 C57BL/6J小鼠放射性肺损伤模型
细胞模型:BEAS-2B细胞,辐射剂量(0, 2, 5, 10 Gy),剂量率500 cGy/min 动物模型:C57BL/6J小鼠,6周龄雄性,胸部照射8 Gy/天,连续3天 Fer-1处理:体外10 μM预处理2小时,体内2 mg/kg腹腔注射 3-MA处理:5 mM预处理24小时 siRNA敲低:NCOA4-siRNA转染BEAS-2B细胞,收集时间为48小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在体内和体外模拟放射性肺损伤,以便研究其相关病理过程。
体内使用C57BL/6J小鼠进行胸部照射(8 Gy/天,连续3天);体外使用BEAS-2B细胞进行不同剂量(0、2、5、10 Gy)照射。
明确IR是否诱导肺上皮细胞铁死亡和衰老,并观察其随时间或剂量的变化。
检测GPX4表达、铁含量、MDA、GSH/GSSG、脂质ROS、SA-β-gal活性、衰老标志物P16/P21及SASP因子表达。
通过抑制铁死亡,观察其对细胞衰老和RILI的影响,评估二者的因果关系。
使用Fer-1(铁死亡抑制剂)处理BEAS-2B细胞和RILI小鼠模型,检测铁死亡和衰老相关指标。
确定铁蛋白自噬是否参与IR诱导的铁过载和铁死亡。
使用自噬抑制剂3-MA处理BEAS-2B细胞,检测FTH降解情况、自噬标志物(LC3、P62)以及铁死亡和衰老指标。
验证NCOA4是否介导IR诱导的铁蛋白自噬,是铁过载和铁死亡的上游调控因子。
检测IR后NCOA4表达变化;使用siRNA敲低NCOA4,检测铁蛋白自噬、铁死亡、衰老和线粒体功能相关指标;使用Co-IP验证NCOA4与FTH的相互作用。
探讨铁死亡是否导致线粒体功能障碍,以及敲低NCOA4是否改善线粒体功能。
检测MMP、MPTP、线粒体ROS、ATP水平和OCR,并通过TEM观察线粒体形态。
评估化合物9a(NCOA4-FTH相互作用抑制剂)在体内对RILI的治疗效果。
在RILI小鼠模型中腹腔注射化合物9a,检测铁蛋白自噬、铁死亡、线粒体功能、衰老和肺损伤相关指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 药物处理 | Ferrostatin-1 | Medchem Express | -- |
| 3-甲基腺嘌呤 | Medchem Express | -- | |
| 动物实验 | 化合物9a | GLPBIO | GC26219 |
| 组织染色 | 马松三色染色试剂盒 | Solarbio | G1340 |
| 免疫组织化学 | 抗GPX4抗体 | ZENBIO | R381958 |
| 抗Collagen I抗体 | Abcam | ab138492 | |
| 抗α-SMA抗体 | Cell Signaling Technology | 19245 | |
| 抗NCOA4抗体 | Immunoway | YT0302 | |
| 抗FTH抗体 | ServiceBio | GB115535 | |
| 免疫荧光 | 抗EpCAM抗体 | Proteintech | 21050-1-AP |
| 抗CDKN2A抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-1661 | |
| 抗FTH抗体 | HUILAN BIOTECH | Y0363 | |
| 抗LAMP2抗体 | HUILAN BIOTECH | Y0249 | |
| 溶酶体绿色荧光探针 | Beyotime | C1047 | |
| DAPI | Beyotime | -- | |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | GLPBIO | -- | |
| PVDF膜 | Merck Millipore | -- | |
| 抗P16抗体 | ZENBIO | R23895 | |
| 抗CDKN1A抗体 | Abclonal | A19094 | |
| 抗FTH抗体 | ZENBIO | R381204 | |
| 抗P62抗体 | BOSTER | M00300-1 | |
| 抗LC3B抗体 | Abmart | T55992 | |
| 抗NCOA4抗体 | Immunoway | YT0302 | |
| 抗β-actin抗体 | Proteintech | -- | |
| 二抗 | Proteintech | -- | |
| ECL检测试剂 | Proteintech | -- | |
| 免疫共沉淀 | 裂解液 | Beyotime | P0013 |
| 蛋白A/G磁珠 | MedChemExpress | HY-K0202 | |
| 铁检测 | 总铁离子比色测定试剂盒 | APPLYGEN | E1042-100 |
| 铁检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng | A039 | |
| FerroOrange探针 | Dojindo | F374 | |
| Hoechst 33342 | -- | -- | |
| MDA和GSH/GSSG测量 | MDA检测试剂盒 | Beyotime | S0131M |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | -- | -- |
| M5 Sprint qPCR RT试剂盒 | Mei5bio | -- | |
| PerfectStart Green qPCR SuperMix | TransGen Biotech | -- | |
| 引物 | Sangon Biotech | -- | |
| ROS测量 | DCFH-DA探针 | Beyotime | S0033S |
| C11-BODIPY581/591探针 | GLPBIO | GC40165 | |
| Mito-SOX Red探针 | Thermo Fisher Scientific | M36008 | |
| Mito-Tracker Green探针 | Beyotime | C1048 | |
| 衰老相关β-半乳糖苷酶测定 | β-半乳糖苷酶染色试剂盒 | Beyotime | C0602 |
| siRNA转染 | Lipo 8000转染试剂 | Beyotime | C0533 |
| 线粒体测量 | MPTP检测试剂盒 | BestBio | BB-48122 |
| MMP检测试剂盒 | BestBio | BB-4105 | |
| ATP检测试剂盒 | Beyotime | S0026 | |
| O2k能量代谢分析仪 | Oroboros | -- | |
| 完整细胞分析试剂盒 | Huawei | 023004 | |
| 寡霉素 | -- | -- | |
| FCCP | -- | -- | |
| 鱼藤酮 | -- | -- | |
| 透射电子显微镜 | 透射电子显微镜 | HITACHI | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞模型建立 | BEAS-2B细胞系来源,辐射剂量(0, 2, 5, 10 Gy),剂量率500 cGy/min 阅读提示:Materials and methods, 2.1 Cell sources and treatment |
| 动物模型建立 | 小鼠品系,周龄,性别,照射剂量(8 Gy/天,连续3天),剂量率,照射野大小 阅读提示:Materials and methods, 2.2 Animals experiment |
| 药物处理 | Fer-1剂量(体外10 μM,体内2 mg/kg),3-MA剂量(5 mM),化合物9a剂量(10 mg/kg)及给药方式 阅读提示:Materials and methods, 2.1 and 2.2 |
| 铁死亡检测 | GPX4表达,铁含量,MDA水平,GSH/GSSG比值 阅读提示:Results, 3.1, Figure legends 1B-G; Methods 2.7, 2.8 |
| 衰老检测 | SA-β-gal活性,P16/P21表达,SASP因子表达 阅读提示:Results, 3.1, Figure legends 1H-J, Q-S; Methods 2.11 |
| 铁蛋白自噬检测 | FTH降解,LC3和P62水平,NCOA4表达,NCOA4-FTH相互作用 阅读提示:Results, 3.3, 3.4, Figure legends 3A-C, 4A-C; Methods 2.6 |
| 线粒体功能检测 | MMP,MPTP,线粒体ROS,ATP水平,OCR 阅读提示:Results, 3.5, Figure legends 5, 6; Methods 2.13 |