建立DSS诱导的IBD小鼠模型
模拟人类IBD的肠道炎症特征,以研究其对卵巢功能的影响。
对C57BL/6J小鼠给予3% DSS饮水7天,对照组给予正常饮水;第8天处死部分小鼠,其余恢复89天。
Inflammatory bowel disease leads to long-term ovarian dysfunction via immune-mediated follicular aging.
研究包含DSS诱导IBD小鼠模型、卵巢组织学、激素检测、转录组学、流式细胞术、TUNEL、SA-β-gal等多种实验,且包括功能验证和机制探究。
DSS诱导的IBD小鼠模型(C57BL/6J小鼠) 老龄小鼠卵巢单细胞转录组数据(GSE232309)
DSS浓度:3%,给药7天 小鼠品系:C57BL/6J,雌性,6-8周龄 观察时间:急性(8天)和恢复(89天) 发情周期监测:阴道涂片,连续12-14天 血清AMH和E2水平:ELISA检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟人类IBD的肠道炎症特征,以研究其对卵巢功能的影响。
对C57BL/6J小鼠给予3% DSS饮水7天,对照组给予正常饮水;第8天处死部分小鼠,其余恢复89天。
检测IBD对卵巢重量、卵泡发育、激素水平和发情周期的影响。
收集卵巢和血清,进行HE染色、卵泡计数、ELISA检测AMH和E2,以及阴道涂片观察发情周期。
揭示IBD诱导的卵巢基因表达变化及衰老相关通路。
提取卵巢RNA进行bulk RNA-seq,比对到GRCm38,鉴定DEGs,并进行GO/GSEA富集分析。
检测卵巢和外周血中的免疫细胞变化,探讨免疫机制。
使用流式细胞术分析卵巢和PBMC中的免疫细胞群(如T细胞、CD8+ T细胞、巨噬细胞等)。
评估IBD是否诱导颗粒细胞凋亡和卵巢衰老。
TUNEL染色检测凋亡,SA-β-gal染色检测衰老,qPCR检测凋亡和衰老相关基因表达。
评估IBD恢复后卵巢功能是否可逆。
在DSS处理后89天,再次评估卵巢重量、卵泡计数、激素水平、发情周期和转录组变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 疾病建模 | 右旋糖酐硫酸钠 | MP Biochemicals, USA | -- |
| 阴道涂片染色 | 瑞氏染色 | Beyotime, China | -- |
| 激素测量 | ELISA试剂盒 | Elabscience, China | -- |
| RNA-seq | NEBNext Ultra RNA文库制备试剂盒(Illumina) | NEB, USA | -- |
| Illumina NovaSeq平台 | Illumina | -- | |
| qPCR | Direct-zol RNA微量提取试剂盒 | ZYMO RESEARCH | -- |
| PrimeScript逆转录试剂盒 | TAKARA | -- | |
| 快速实时PCR预混液 | TIANGEN | -- | |
| 流式细胞术 | Percoll梯度 | -- | -- |
| MHC II抗体 | -- | -- | |
| TUNEL检测 | TUNEL检测试剂盒 | Abcam | -- |
| 免疫荧光 | γ-H2AX抗体 | -- | -- |
| P53抗体 | -- | -- | |
| Alexa Fluor-488和Alexa Fluor-647偶联二抗 | -- | -- | |
| SA-β-gal染色 | 衰老β-半乳糖苷酶染色试剂盒 | Vazyme | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism 9软件 | GraphPad Software Inc., USA | -- |
| 显微镜检查 | 共聚焦显微镜 | Carl Zeiss AG | -- |
| 免疫荧光检查 | 荧光显微镜 | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系、年龄、性别、DSS浓度、给药时间、对照组处理 阅读提示:Materials and Methods: Animals, Establishment of IBD model in mice |
| 卵巢功能评估 | 卵巢重量、卵泡计数标准、发情周期监测方法、血清激素检测 阅读提示:Materials and Methods: Vaginal smears, Histological analysis, Hormone level measurement |
| 转录组分析 | RNA提取、文库构建、测序平台、参考基因组、DEGs筛选阈值 阅读提示:Materials and Methods: Bulk RNA-seq analysis, Pathway enrichment |
| 免疫细胞分析 | 组织处理、抗体组合、流式细胞仪设置、免疫细胞门控策略 阅读提示:Materials and Methods: Flow cytometry |
| 凋亡和衰老检测 | TUNEL试剂盒、SA-β-gal试剂盒、qPCR引物序列、参考基因 阅读提示:Materials and Methods: TUNEL assay, SA-β-gal staining, Real-time quantitative PCR |
| 长期恢复观察 | 恢复期长度、观察时间点、检测项目 阅读提示:Materials and Methods: Establishment of IBD model in mice; Results: Long-term impairment |