代谢组学分析
鉴定水黄皮茎70%乙醇提取物中的化学成分。
采用LC-HRESIMS对提取物进行化学分析,鉴定出46种代谢物,包括黄酮类、酚酸和甾醇类。
Potent Antioxidant and Anti-Inflammatory Metabolites of Pongamia pinnata Stems and Their Role in NF-κB and PI3K/AKT/mTOR Signaling Pathways Regulation in Irradiated Rats.
文献包含体内动物实验(大鼠模型)和体外分子对接研究,但缺少细胞实验等独立验证层级。
Wistar大鼠(γ射线辐照模型) 分子对接(靶蛋白AKT、mTOR、PI3K、NF-κB)
γ射线辐照剂量(7 Gy)及剂量率(0.36 Gy/min) 水黄皮提取物给药剂量(300 mg/kg和1000 mg/kg,口服灌胃)及持续时间(10天) 样本量(每组8只大鼠) 检测终点(氧化应激标志物、炎症标志物、血清尿素和肌酐、精子头部异常)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定水黄皮茎70%乙醇提取物中的化学成分。
采用LC-HRESIMS对提取物进行化学分析,鉴定出46种代谢物,包括黄酮类、酚酸和甾醇类。
评估水黄皮提取物对γ射线辐照大鼠的辐射防护作用。
48只大鼠分为6组,每组8只:正常对照组、辐照组、提取物低剂量组、提取物高剂量组、低剂量+辐照组、高剂量+辐照组。辐照组接受7 Gy全身照射,提取物组每日灌胃300或1000 mg/kg提取物,连续10天。
检测提取物对辐照大鼠睾丸和肾脏氧化应激及炎症标志物的影响。
检测睾丸和肾脏组织中MDA、GSH、NF-κB p105、PI3K、AKT、mTOR的水平。
评估提取物对辐照大鼠肾功能的影响。
检测血清尿素和肌酐水平。
评估提取物对辐照大鼠生殖细胞遗传损伤的影响。
取附睾精子,染色后显微镜下计数异常精子头,计算异常率、突变因子和突变指数。
评估提取物对辐照大鼠肾脏和睾丸组织结构损伤的保护作用。
肾脏和睾丸组织进行H&E染色,进行组织病理学评分。
预测提取物中活性代谢物与炎症通路关键蛋白的结合能力。
使用Autodock Vina将筛选出的化合物与AKT、mTOR、PI3K和NF-κB蛋白进行分子对接,分析结合亲和力和相互作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 代谢组学分析 | Accela高效液相色谱 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Exactive(Orbitrap)质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 动物实验 | Gamma cell-40生物辐照器 | Atomic Energy of Canada Ltd. | -- |
| 生化检测 | 大鼠NF-κB p105 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-R0673 |
| 大鼠PI3K ELISA试剂盒 | MyBiosource | MBS260381 | |
| 大鼠AKT ELISA试剂盒 | MyBiosource | MBS3807575 | |
| 大鼠mTOR ELISA试剂盒 | MyBiosource | MBS744326 | |
| 酶标仪 | BMG Labtech | -- | |
| 血清生化 | 尿素试剂盒 | Bio diagnostic Company | -- |
| 肌酐试剂盒 | Bio diagnostic Company | -- | |
| 精子形态分析 | 伊红Y | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物分组与给药 | 模型(Wistar大鼠)、辐照剂量(7 Gy)、给药剂量(300和1000 mg/kg)、给药方式(口服灌胃)、给药时间(10天) 阅读提示:见Materials and Methods 5.4.4 Experimental Design |
| 氧化应激和炎症标志物测量 | 组织(睾丸和肾脏)、ELISA试剂盒(品牌和货号)、检测指标(NF-κB p105, PI3K, AKT, mTOR) 阅读提示:见Materials and Methods 5.5.2 |
| 精子头部异常评估 | 精子的计数(200个每只)、染色方法(0.05% eosin-Y)、评估标准(Wyrobek等) 阅读提示:见Materials and Methods 5.6 |
| 组织病理学检查 | 组织固定、切片厚度(4-6 μm)、染色(H&E)、肾脏损伤评分标准 阅读提示:见Materials and Methods 5.7 |