动物模型建立与分组
建立盐敏感性与非盐敏感性大鼠的高盐饮食模型,以比较盐敏感性的影响
雄性Wistar大鼠和Dahl盐敏感性大鼠分别随机分为正常饮食组(0.3% NaCl)和高盐饮食组(8% NaCl),喂养8周。
Salt sensitivity potentiates high-salt diet-induced intestinal barrier disruption and gut microbiome dysbiosis in rats.
包含两种大鼠模型的体内实验、组织病理学检查、宏基因组测序及炎症因子检测,涵盖表型、病理和菌群多维度验证,并进行相关分析。
Wistar大鼠 Dahl盐敏感性大鼠
动物品系:Wistar和Dahl盐敏感性大鼠,雄性 饮食干预:0.3% NaCl正常饲料 vs 8% NaCl高盐饲料,持续8周 炎症因子检测:ELISA测定血浆TNF-α、IL-6、IL-1β、IL-10水平 结肠组织病理:H&E及PAS染色评估结构损伤 宏基因组测序:Illumina NovaSeq 6000平台,150bp双端测序
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立盐敏感性与非盐敏感性大鼠的高盐饮食模型,以比较盐敏感性的影响
雄性Wistar大鼠和Dahl盐敏感性大鼠分别随机分为正常饮食组(0.3% NaCl)和高盐饮食组(8% NaCl),喂养8周。
评估高盐饮食对全身生理状态和炎症反应的影响
在基线及第2、4、6、8周测量体重;在第8周采集血浆,使用ELISA检测TNF-α、IL-6、IL-1β和IL-10水平。
评估高盐饮食对肠道屏障结构的损伤程度
收集结肠组织,固定、包埋、切片,进行H&E和PAS染色,在光学显微镜下观察组织结构和黏蛋白分布。
分析高盐饮食对肠道菌群组成和功能的影响
从粪便样本中提取DNA,构建文库,在Illumina NovaSeq 6000平台测序,经质控、组装、基因预测和功能注释,分析物种组成、多样性和KEGG通路。
探索炎症因子与显著改变的菌群之间的关联
对高盐饮食组中显著改变的菌属丰度与炎症因子水平进行Pearson相关性分析,以评估菌群与炎症的关系。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | Wistar大鼠 | SiPeiFu Biotechnology Co., Ltd. (Beijing, China) | -- |
| Dahl盐敏感性大鼠 | SiPeiFu Biotechnology Co., Ltd. (Beijing, China) | -- | |
| 饮食干预 | 0.3% NaCl饲料 | KeaoXieli Feed Co., Ltd. (Beijing, China) | 1016712327837081600 |
| 8% NaCl饲料 | KeaoXieli Feed Co., Ltd. (Beijing, China) | 1016706714625204224 | |
| 血浆细胞因子检测 | ELISA试剂盒 | Elabscience Biotechnology (Wuhan, China) | -- |
| DNA提取 | QIAamp PowerFecal Pro DNA试剂盒 | Qiagen (Germany) | -- |
| DNA定量 | Qubit荧光计 | -- | -- |
| DNA片段化 | Covaris聚焦超声仪 | Covaris (USA) | -- |
| 文库构建 | AMPure XP磁珠 | Beckman Coulter (USA) | -- |
| 测序 | Illumina NovaSeq 6000测序平台 | Illumina (USA) | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 动物品系、性别、周龄、体重、饲养环境(温度、湿度、光照周期)、饮食配方(0.3% NaCl和8% NaCl饲料的详细成分,见补充表S1) 阅读提示:Methods 2.1 Animals and diet |
| 饮食干预 | 饮食开始时间和持续时间(8周)、分组方法(随机)、饲料批号/货号、饮水是否自由、是否使用纯化水 阅读提示:Methods 2.1 Animals and diet |
| 炎症因子检测 | 采血时间点(第8周)、采血方式(腹主动脉)、离心条件(3000×g, 10 min, 4°C)、ELISA试剂盒的灵敏度和检测范围(补充表S2) 阅读提示:Methods 2.2 Sample collection |
| 结肠组织病理学检查 | 组织固定液(10%中性缓冲福尔马林)、切片厚度(4 μm)、染色方法(H&E和PAS)、图像采集放大倍数(200x和400x) 阅读提示:Methods 2.3 Colon histopathological examination |
| 宏基因组测序 | 粪便样本采集量(2-3粒)、DNA提取试剂盒(QIAamp PowerFecal Pro DNA Kit)、DNA片段化参数、文库构建试剂和条件、测序平台(Illumina NovaSeq 6000)、测序读长(150bp PE)、生物信息学分析流程和参数(如Trimmomatic版本、Bowtie2版本、MEGAHIT版本、QUAST版本、MetaGeneMark版本、CD-HIT参数、DIAMOND版本、KEGG数据库版本) 阅读提示:Methods 2.4 Fecal metagenomic profiling |