体外细胞模型建立与IMP细胞毒性评估
建立LPS诱导的A549细胞损伤模型,评估IMP的细胞毒性
使用LPS(10 μg/mL)诱导A549细胞,并检测IMP(0.4-100 μM)的细胞活力。
ALDH3A1-dependent Nrf2/HO-1/GPX4 pathway supports AHR as a promising therapeutic target for ferroptosis and promotes imperatorin-mediated lung protection.
体外细胞实验(A549)、体内动物模型(BALB/c小鼠)及多层级验证(RNA-seq、Western blot、免疫荧光、分子对接、MST、功能抑制剂)
A549肺上皮细胞 LPS诱导的ALI小鼠模型 HepG2-Lucia AHR报告细胞
IMP浓度:20 μM(体外),50 mg/kg(体内) LPS浓度:10 μg/mL(体外),5 mg/kg(体内) AHR抑制剂CH223191浓度:10 μM(体外),10 mg/kg(体内) ALDH3A1抑制剂ALDH3A1-IN-1浓度:10 μM(体外),10 mg/kg(体内) Tapi给药方式:气管雾化(5 μM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立LPS诱导的A549细胞损伤模型,评估IMP的细胞毒性
使用LPS(10 μg/mL)诱导A549细胞,并检测IMP(0.4-100 μM)的细胞活力。
探索IMP保护作用的潜在机制
对对照组和IMP(20 μM)处理的A549细胞进行RNA-seq,分析差异表达基因及信号通路富集。
验证IMP是否激活AHR并诱导其核转位
通过免疫荧光、Western blot检测AHR和CYP1A1表达,并使用AHR抑制剂CH223191验证AHR依赖性。
评估IMP对AHR的激动活性和直接结合
使用HepG2-Lucia AHR报告细胞进行荧光素酶报告基因实验测定EC50;分子对接和MST测定结合常数Kd。
评估IMP对LPS诱导的铁死亡的影响
通过荧光探针检测ROS、Fe2+和脂质过氧化水平。
验证AHR/ALDH3A1/Nrf2/HO-1/GPX4通路在IMP抗铁死亡和肺保护中的作用
通过Western blot检测相关蛋白表达,并使用AHR抑制剂CH和ALDH3A1抑制剂ALDH-IN进行功能验证。
评估IMP对LPS诱导的ALI小鼠的保护作用
建立ALI小鼠模型,检测肺功能、组织病理、炎症因子、氧化应激等指标。
验证体内AHR/ALDH3A1通路参与IMP的保护作用
使用Western blot检测小鼠肺组织中相关蛋白表达,并通过药理学抑制剂进一步验证。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 欧前胡素 | Herbpurify | -- |
| 他匹诺洛 | MedChemExpress | -- | |
| CH223191 | MedChemExpress | -- | |
| ALDH3A1-IN-1 | MedChemExpress | -- | |
| 细胞培养 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | -- |
| RPMI 1640培养基 | HyClone | -- | |
| DMEM培养基 | HyClone | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | -- | |
| Western blot | AHR抗体 | ABclonal | A22464 |
| CYP1A1抗体 | ABclonal | A22182 | |
| LaminB1抗体 | ABclonal | A11495 | |
| 免疫荧光 | ABfloTM 594偶联AffiniPure山羊抗兔IgG (H+L) | ABclonal | AS074 |
| Western blot | ALDH3A1抗体 | Affinity | DF8502 |
| HO-1抗体 | Affinity | AF5393 | |
| GPX4抗体 | Affinity | DF6701 | |
| E-钙粘蛋白抗体 | Affinity | AF0131 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Affinity | AF7018 | |
| Nrf2抗体 | ImmunoWay | YM4294 | |
| Occludin抗体 | ImmunoWay | YN2865 | |
| NF-κB抗体 | Nature Biosciences | A66433 | |
| 磷酸化NF-κB抗体 | Nature Biosciences | A52820 | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | Zsbio | -- | |
| 细胞培养 | A549细胞 | American Type Culture Collection | -- |
| HepG2-Lucia AHR报告细胞 | InvivoGen | -- | |
| 细胞活力检测 | MTT检测试剂盒 | Biosharp | -- |
| 细胞培养 | ReadMax 1500酶标仪 | Flash | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | -- | -- |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Beyotime | -- |
| 牛血清白蛋白 | Beyotime | -- | |
| DAPI | Solarbio | -- | |
| TCS SP8共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| Western blot | 核浆蛋白提取试剂盒 | Beyotime | -- |
| RIPA裂解液 | -- | -- | |
| Bradford蛋白浓度测定试剂盒 | Beyotime | -- | |
| 10% SDS-PAGE凝胶 | -- | -- | |
| PVDF膜 | MerckMillipore | -- | |
| 化学发光检测系统 | Abbkine | -- | |
| qRT-PCR | 细胞总RNA提取试剂盒 | FOREGENE | -- |
| 纳米光度计 | Implen | -- | |
| RT Easy™ II反转录试剂盒 | FOREGENE | -- | |
| THUNDERBIRD SYBR Green染料 | Toyobo | -- | |
| Archimed X4实时荧光定量PCR仪 | ROCGENE | -- | |
| 荧光素酶报告基因实验 | QUANTI-Luc™荧光素酶检测试剂 | InvivoGen | rep-qlc2 |
| LumiStation 1800发光检测仪 | Flash | -- | |
| MST | 重组人AHR蛋白 | MedChemExpress | -- |
| His标签标记试剂盒RED-tris-NTA第二代 | NanoTemper | -- | |
| MST毛细管 | NanoTemper | -- | |
| Monolith NT.115微量热泳动仪 | NanoTemper | -- | |
| ROS检测 | 活性氧检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| DHE荧光探针 | Beyotime | -- | |
| Fe2+检测 | FerroOrange荧光探针 | DOJINDO | -- |
| 脂质过氧化检测 | 脂质过氧化检测试剂盒(含BODIPY 581/591 C11) | Beyotime | -- |
| 动物实验 | 肺雾化给药装置 | TOW-INT | -- |
| Micro-CT成像 | Quantum GX微型CT成像系统 | PerkinElmer | -- |
| 组织学分析 | NanoZoomer S60数字切片扫描仪 | Hamamatsu Photonics | -- |
| DCFH-DA荧光探针 | Servicebio | -- | |
| ELISA | 小鼠特异性ELISA试剂盒 | Elabscience | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外细胞培养 | 细胞系(A549)、培养基(RPMI 1640,含10% FBS和1%青霉素/链霉素)、培养条件(37°C,5% CO2) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and viability assay |
| 药物处理 | IMP浓度(20 μM)、Tapi浓度(1 μM)、CH223191浓度(10 μM)、ALDH3A1-IN-1浓度(10 μM)、处理时间(24 h) 阅读提示:Figure legends 2, 3, 4, 5 |
| 铁死亡检测 | ROS检测(DCFH-DA)、超氧阴离子检测(DHE)、Fe2+检测(FerroOrange)、脂质过氧化检测(BODIPY C11) 阅读提示:Materials and methods: ROS assay, Fe2+ assay, Lipid peroxidation assay |
| 动物实验建模 | 小鼠品系(雄性BALB/c小鼠,18-20 g)、LPS剂量(5 mg/kg)、给药方式(气管雾化)、IMP剂量(50 mg/kg)、CH剂量(10 mg/kg)、ALDH-IN剂量(10 mg/kg)、处理时间(24 h) 阅读提示:Materials and methods: Animal experiments |
| 体内机制验证 | Western blot检测肺组织中AHR、CYP1A1、ALDH3A1、Nrf2、HO-1、GPX4蛋白水平 阅读提示:Figure 7H, I; Figure 8F, G |