细胞模型中TRPV1表达检测
评估TRPV1在前列腺癌细胞系中的表达水平。
通过RT-qPCR、Western blot和免疫细胞化学检测TRPV1在PNT2、LNCaP、PC3等细胞系中的表达。
TRPV1 Downregulation Impairs Prostate Cancer Growth: Functional and Translational Insights from Cellular and In Vivo Models.
包含细胞模型(PNT2、LNCaP、PC3等)的功能实验、蛋白质组学分析、TRAMP小鼠体内实验以及人前列腺样本验证,并有Western blot、RT-qPCR、MTT等验证。
前列腺细胞系(PNT2、LNCaP、PC3、DU-145、LN-CSS、LN-FLU) TRAMP小鼠模型 人前列腺癌组织样本
TRPV1在肿瘤细胞系中表达升高,在耐药细胞系中最高(RT-qPCR、Western blot、免疫细胞化学) shRNA沉默TRPV1导致PCNA、Cyclin B1、AURKA降低,p21升高(Western blot) 辣椒素处理(80 μM,24小时)改变蛋白质组,涉及细胞周期和有丝分裂 TRAMP小鼠高脂饮食增加血浆PSA和前列腺TRPV1表达,辣椒素补充逆转(ELISA、RT-qPCR、Western blot) TRPV1表达与干性标志物Oct4、Nanog、ABCB1A正相关(Pearson相关)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估TRPV1在前列腺癌细胞系中的表达水平。
通过RT-qPCR、Western blot和免疫细胞化学检测TRPV1在PNT2、LNCaP、PC3等细胞系中的表达。
鉴定TRPV1沉默后改变的蛋白质和通路。
PC3细胞感染shTRPV1或空载体,进行蛋白质组学分析,比较差异表达蛋白并进行GO和KEGG富集分析。
验证TRPV1在细胞增殖和干性维持中的功能。
在LNCaP、PC3、DU-145细胞中沉默TRPV1,进行MTT细胞活力检测、Western blot检测增殖相关蛋白、RT-qPCR检测干性标志物。
研究辣椒素对前列腺癌细胞蛋白质组的影响与TRPV1沉默的相似性。
PC3细胞用80 μM辣椒素或DMSO处理24小时,进行蛋白质组学分析和富集分析。
确定辣椒素处理是否影响TRPV1表达。
不同前列腺癌细胞系用80 μM辣椒素处理1、12、24、48小时,通过Western blot检测TRPV1蛋白水平。
评估辣椒素对高脂饮食诱导的前列腺癌进展和TRPV1表达的影响。
TRAMP小鼠随机分为四组,分别喂食标准饮食、标准饮食+辣椒素、高脂饮食、高脂饮食+辣椒素,6个月后检测血浆PSA、前列腺TRPV1、PCNA、Cyclin B1、干性标志物。
验证TRPV1在人前列腺癌中的表达及其与干性标志物的关联。
收集17例前列腺癌患者的肿瘤和邻近非肿瘤组织,通过RT-qPCR检测TRPV1、Oct4、Nanog、ABCB1A表达并进行相关性分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 辣椒素 | Sigma-Aldrich | -- |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Western blot | TRPV1抗体 | Thermo Scientific | PA5-34498 |
| p21抗体 | Cell Signaling Technology | #2947 | |
| AURKA抗体 | Cell Signaling Technology | #14475 | |
| TRPV1抗体(小鼠) | Abcam | ab203103 | |
| Cyclin B1抗体 | Cell Signaling Technology | #4135 | |
| PCNA抗体 | Cell Signaling Technology | #13110 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | A5441 | |
| HRP标记抗小鼠IgG | Sigma-Aldrich | A9044 | |
| HRP标记抗兔IgG | Cell Signaling Technology | #7074S | |
| 免疫细胞化学 | TRPV1抗体 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Alexa Fluor 488偶联二抗 | -- | -- | |
| DAPI | Invitrogen | -- | |
| 溶酶体标记 | LysoTracker | Life Technologies | -- |
| 内质网标记 | CellLight ER-RFP BacMam 2.0试剂 | Invitrogen | -- |
| 慢病毒转导 | psPAX2质粒 | Addgene | 12260 |
| pCMV-VSV-G质粒 | Addgene | 8454 | |
| pLKO.1-TRC克隆载体 | Addgene | 10878 | |
| 聚乙烯亚胺 | Polysciences | -- | |
| 聚凝胺 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 嘌呤霉素 | STEMCELL Technologies | -- | |
| 蛋白质组学样本制备 | 胰蛋白酶Gold | Promega | -- |
| RNA提取 | NZY总RNA提取试剂盒 | NZYtech | -- |
| cDNA合成 | NZY第一链cDNA合成试剂盒 | NZYtech | -- |
| RT-qPCR | NZY Speedy qPCR Green预混液(2x) | NZYtech | -- |
| 7500实时PCR系统 | Applied Biosystems Inc. | -- | |
| 蛋白质印迹成像 | ChemiDoc MP成像系统 | Bio-Rad | -- |
| 蛋白质定量 | Bradford蛋白测定试剂盒 | Bio-Rad | -- |
| MTT实验 | MTT | Sigma-Aldrich | -- |
| 酶标仪iMark | Bio-Rad | -- | |
| 瞬转 | TRPV1过表达质粒 | GenScript | -- |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 蛋白质组学质谱 | timsTOF fleX质谱仪 | Bruker Daltonics | -- |
| 蛋白质组学色谱 | nanoElute 2纳升液相系统 | Bruker Daltonics | -- |
| ELISA | 小鼠PSA ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0961 |
| Western blot | 抗FLAG抗体 | Sigma-Aldrich | F3165 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基(RPMI-1640)、血清类型和浓度、抗生素浓度、培养条件(37°C、5% CO2) 阅读提示:Materials and Methods: Cell cultures |
| TRPV1沉默 | shRNA序列(TRCN0000044190)、慢病毒包装质粒比例、转染试剂和条件、感染和筛选浓度 阅读提示:Materials and Methods: Lentivirus transduction |
| 辣椒素处理 | 辣椒素浓度(80 μM)、处理时间(1-48小时)、溶剂对照(DMSO) 阅读提示:Materials and Methods: Cell cultures, Results: Prolonged CAP exposure |
| 蛋白质组学分析 | 细胞数量和裂解方法、还原烷基化试剂浓度、胰蛋白酶用量和消化时间、质谱采集模式(DIA-PASEF)、数据鉴定和定量参数 阅读提示:Materials and Methods: Proteomic analysis |
| 动物实验 | TRAMP小鼠品系和年龄、饮食配方和干预时间(6个月)、PSA检测方法、样本量(n=6) 阅读提示:Materials and Methods: Animal experiment design, Results: In vivo effect of CAP treatment |
| 人样本分析 | 患者样本数量(17例肿瘤,5例正常)、取材部位、RNA提取和RT-qPCR内参(18S) 阅读提示:Materials and Methods: Human prostate sample collection, Results: TRPV1 expression in human prostate cancer biopsies |