建立并验证脓毒症大鼠心肌损伤模型
验证盲肠结扎穿刺术(CLP)是否成功诱导大鼠心肌损伤。
采用CLP建立脓毒症大鼠模型,通过ELISA检测心肌细胞因子(IL-6、IL-10、IL-1β、TNF-α)和心肌损伤标志物(cTnT、NT-proBNP),TUNEL染色评估凋亡,HE染色观察组织病理,流式细胞术检测ROS水平。
Transcription factor EGR1 orchestrates ferroptosis to mitigate sepsis-induced myocardial injury by enhancing ferroportin expression.
包含体内大鼠CLP模型、体外H9c2细胞过表达/敲低、转录组测序、双荧光素酶报告基因、线粒体电镜及功能验证等多个独立证据层级。
Sprague-Dawley大鼠CLP脓毒症模型 H9c2心肌母细胞系 293T细胞(双荧光素酶报告基因实验) 大鼠原代心肌细胞
EGR1过表达或敲低对H9c2细胞铁死亡和氧化应激的影响 EGR1与FPN启动子直接结合的双荧光素酶报告基因验证 EGR1过表达对脓毒症大鼠心肌损伤、铁死亡和存活率的影响 EGR1、FPN、xCT、GPX4在心肌组织和细胞中的表达变化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证盲肠结扎穿刺术(CLP)是否成功诱导大鼠心肌损伤。
采用CLP建立脓毒症大鼠模型,通过ELISA检测心肌细胞因子(IL-6、IL-10、IL-1β、TNF-α)和心肌损伤标志物(cTnT、NT-proBNP),TUNEL染色评估凋亡,HE染色观察组织病理,流式细胞术检测ROS水平。
筛选脓毒症心肌损伤相关的差异表达基因,并分析与铁死亡相关的信号通路。
对脓毒症模型和对照组大鼠心肌组织进行转录组测序,使用DESeq2分析差异表达基因,进行GO和KEGG富集分析,构建转录调控网络。
验证EGR1是否直接结合并激活FPN启动子。
构建包含EGR1结合位点的野生型或突变型FPN启动子的荧光素酶报告基因质粒,与EGR1过表达载体共转染293T细胞,检测双荧光素酶活性。
验证EGR1过表达或敲低对H9c2心肌细胞活力、氧化应激和铁死亡的影响。
在H9c2细胞中转染oe-EGR1或sh-EGR1质粒,检测细胞活力(CCK-8)、MDA、Fe2+、GSH水平、线粒体膜电位(JC-1)、ROS水平,以及EGR1、FPN、xCT、GPX4的表达。
验证EGR1过表达对脓毒症大鼠心肌损伤、铁死亡和存活率的影响。
通过心肌注射腺相关病毒载体过表达EGR1,建立CLP脓毒症模型,评估存活率、血清心肌损伤标志物、心肌组织病理、线粒体超微结构、氧化应激指标以及铁死亡相关基因和蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596026 |
| 测序建库 | NEBNext Ultra RNA文库制备试剂盒 | NEB | E7530L |
| 测序平台 | Illumina NovaSeq 6000 | Illumina | -- |
| ELISA检测 | IL-6 ELISA试剂盒 | COIBO BIO | CB10218-Ra |
| IL-10 ELISA试剂盒 | COIBO BIO | CB10194-Ra | |
| IL-1β ELISA试剂盒 | COIBO BIO | CB10205-Ra | |
| TNF-α ELISA试剂盒 | COIBO BIO | CB11057-Ra | |
| cTnT ELISA试剂盒 | JONLNBIO | JL27509-48T | |
| NT-proBNP ELISA试剂盒 | Fine Biotech | ER0309 | |
| 凋亡检测 | TUNEL检测试剂盒 | KeyGEN | KGA700 |
| DAB显色 | DAB显色试剂盒 | Servicebio | G1507 |
| 细胞培养 | 杜氏磷酸盐缓冲液 | Sigma-Aldrich | D8537 |
| 细胞消化 | 胶原酶 | Sigma-Aldrich | C0130 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Sigma-Aldrich | D6429 |
| DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | 11965092 | |
| 细胞消化 | 胰酶-EDTA | Thermo Fisher Scientific | 25200056 |
| 细胞转染 | 转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | 16447100 |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂 | Beyotime | C0038 |
| Fe2+检测 | 细胞亚铁离子比色检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K881-M |
| GSH检测 | GSH比色检测试剂盒 | Elabscience | E-BCK030-M |
| MDA检测 | MDA比色检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K028-M |
| ROS检测 | DCFH-DA探针 | Sigma-Aldrich | D6883 |
| 流式细胞术 | CytoFLEX流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
| 电镜染色 | 醋酸铀 | Zhongjingkeyi | GS02624 |
| 柠檬酸铅 | Zhongjingkeyi | GZ02616 | |
| 透射电镜 | 透射电子显微镜(JEM-1400PLUS) | JEOL | -- |
| 线粒体膜电位检测 | 线粒体膜电位检测试剂盒(JC-1) | MULTISCIENCES | 70-MJ101 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013C |
| 蛋白酶抑制剂 | Beyotime | P1045 | |
| SDS上样缓冲液 | DAKEWE | 8015011 | |
| 脱脂牛奶 | Beyotime | P0216 | |
| ECL显影液 | Thermo | 34580 | |
| 凝胶成像仪 | Bio-Rad | -- | |
| RT-qPCR | Goldenstar RT6 cDNA合成试剂盒 | Tsingke | TSK302M |
| 2×T5 Fast qPCR Mix试剂盒 | Tsingke | TSE002 | |
| HE染色 | 伊红 | Servicebio | G1002 |
| HE染色封片 | 中性树脂 | Sinopharm | 10004160 |
| 双荧光素酶报告基因实验 | 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Beyotime | RG027 |
| 抗体 | FPN抗体 | Proteintech | 26601-1-AP |
| EGR1抗体 | ABclonal | A23424 | |
| xCT抗体 | ABclonal | A13685 | |
| GPX4抗体 | ABclonal | A11243 | |
| GAPDH抗体 | ABclonal | A19056 | |
| 二抗 | ABclonal | AS014 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 大鼠品系、性别、年龄、体重、CLP手术细节(缝线型号、穿刺针型号、穿刺次数)、麻醉剂量 阅读提示:Methods部分'Animals and grouping'和'Etablishment of sepsis rat model' |
| 转录组测序 | 样本量、心肌细胞数量、RNA提取方法、建库试剂盒、测序平台、差异基因筛选阈值 阅读提示:Methods部分'Single-cell RNA sequencing' |
| 双荧光素酶报告基因实验 | 293T细胞培养条件、质粒组合、转染试剂、荧光素酶检测试剂盒 阅读提示:Methods部分'Dual luciferase reporter gene assay' |
| 细胞实验 | H9c2细胞来源、培养条件、转染质粒(oe-EGR1、sh-EGR1)、转染试剂、检测试剂盒(CCK-8、Fe2+、GSH、MDA、ROS、JC-1) 阅读提示:Methods部分'Transfection of H9c2 cells'以及各检测方法小节 |
| 体内实验 | AAV-EGR1注射途径、剂量、时间点;CLP模型建立;分组及每组动物数;检测指标(血清标志物、组织病理、线粒体电镜、氧化应激指标) 阅读提示:Methods部分'Animals and grouping'和'Etablishment of sepsis rat model',以及Results部分'Enhancement in antioxidant capacity and suppression of ferroptosis in vivo by EGR1 overexpression' |
| Western blot | 蛋白提取方法、抗体稀释比、内参、曝光条件 阅读提示:Methods部分'Western blotting' |
| RT-qPCR | 引物序列、内参基因、扩增条件 阅读提示:Methods部分'RT-qPCR'及表1 |