临床样本检测
评估PRMT5在脓毒症患者外周血中的表达水平。
收集脓毒症患者和健康对照的外周血,分离血清,通过qRT-PCR检测PRMT5 mRNA表达。
PRMT5 Mediates Sepsis-Associated Lung Injury by Modulating JAK1 Arginine Methylation: A Mechanism Study.
包含临床样本、动物模型(CLP)、体外细胞实验,并进行功能验证(敲低/过表达)和机制验证(Co-IP、甲基化、蛋白稳定性、通路分析)。
脓毒症患者外周血样本 CLP诱导的脓毒症小鼠模型 LPS刺激的人肺微血管内皮细胞(HPMECs) HEK293T细胞(用于外源Co-IP验证)
PRMT5在脓毒症患者外周血中的表达(qRT-PCR) CLP小鼠模型构建及分组(sham、CLP、CLP+sh-PRMT5) LPS诱导HPMECs炎症模型(100 ng/mL,4 h) PRMT5敲低对JAK1甲基化、稳定性及泛素化的影响 PRMT5过表达及JAK1敲低对JAK1/STAT3通路及细胞功能的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估PRMT5在脓毒症患者外周血中的表达水平。
收集脓毒症患者和健康对照的外周血,分离血清,通过qRT-PCR检测PRMT5 mRNA表达。
建立CLP诱导的脓毒症小鼠模型,并验证PRMT5敲低对脓毒症相关肺损伤的影响。
将小鼠分为Sham和CLP组,CLP组再分为CLP+sh-NC和CLP+sh-PRMT5组,尾静脉注射AAV9-shRNA进行敲低。评估存活率、体温、体重、肺组织病理(HE染色)和血清炎症因子。
验证PRMT5敲低对LPS诱导的HPMECs炎症和氧化应激的影响。
在HPMECs中转染sh-NC或sh-PRMT5,并用LPS刺激。检测细胞活力(CCK-8)、炎症因子(ELISA)、氧化应激标志物(MDA、T-AOC、ROS)和凋亡(流式)。
验证PRMT5与JAK1的相互作用,并证明PRMT5通过精氨酸甲基化调节JAK1蛋白稳定性。
利用生物信息学预测相互作用和甲基化位点。用Co-IP和免疫荧光验证内源性和外源性PRMT5-JAK1结合。在HPMECs中敲低PRMT5后检测JAK1甲基化水平、蛋白稳定性(CHX追踪)和泛素化水平。
验证PRMT5通过JAK1/STAT3通路促进LPS诱导的炎症和氧化损伤。
在HPMECs中转染oe-PRMT5和/或sh-JAK1,并用LPS刺激。检测JAK1、p-STAT3蛋白水平(Western blot),以及细胞活力、炎症因子和氧化应激指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 伦理审批 | 中国人民解放军联勤保障部队第903医院医学伦理委员会 | -- | 20240719/03/01/008 |
| 动物伦理 | 浙江珞熙医疗科技有限公司动物实验与福利伦理委员会 | -- | LX4825010601 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 逆转录 | PrimeScript逆转录试剂盒 | Takara | -- |
| 实时定量PCR | SYBR Premix Ex Taq II | Takara | -- |
| ABI 7500 | -- | -- | |
| 动物实验 | AAV9-sh-NC | Vigene Biosciences | -- |
| AAV9-sh-PRMT5 | Vigene Biosciences | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 8.0 | GraphPad | -- |
| 体温测量 | 数字直肠温度计 | Beijing Jianyi Technology Development Co. Ltd. | -- |
| 组织固定 | 10%中性缓冲福尔马林 | Biosharp | -- |
| HE染色 | 伊红 | Beyotime | -- |
| 显微镜 | Carl Zeiss | -- | |
| ELISA | TNF-α、IL-1β和IL-6的ELISA试剂盒 | Elabscience | -- |
| 酶标仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 免疫组织化学 | 0.01 M柠檬酸盐缓冲液 | Coolaber | -- |
| 抗PRMT5抗体 | Abcam | ab109451 | |
| 山羊抗兔IgG H&L (HRP) | Abcam | ab6721 | |
| DAB | Yeasen | -- | |
| 显微镜 | Carl Zeiss | -- | |
| 细胞培养 | 人肺微血管内皮细胞(PRI-H-00006) | Shanghai Zhong Qiao Xin Zhou Biotechnology Co. Ltd. | -- |
| 内皮细胞培养基ECM(1001-b) | Zhong Qiao Xin Zhou | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 内皮细胞生长添加剂 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 药物处理 | 脂多糖 | Yeasen | -- |
| 细胞转染 | pcDNA3.1(+)-3×Flag-PRMT5 | Addgene | -- |
| pcDNA3.1-HA-JAK1 | Addgene | -- | |
| Opti-MEM | Gibco | -- | |
| Lipofectamine 3000 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂 | Sigma-Aldrich | -- |
| 氧化应激检测 | 比色法MDA检测试剂盒 | Elabscience | -- |
| T-AOC比色试剂盒 | Elabscience | -- | |
| 活性氧检测 | DCFH-DA活性氧检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| 流式细胞术 | 流式细胞仪 | Beckman | -- |
| 蛋白提取 | RIPA裂解缓冲液 | Beyotime | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 免疫印迹 | PVDF膜 | Sigma-Aldrich | -- |
| 牛血清白蛋白 | Yeasen | -- | |
| ECL化学发光试剂 | Beyotime | -- | |
| 兔抗PRMT5抗体 | Abcam | ab109451 | |
| 兔抗HA抗体 | Abcam | ab236632 | |
| 兔抗Flag抗体 | Abcam | ab205606 | |
| 兔抗ADMA抗体 | Cell Signaling Technology | 13522 | |
| 兔抗p-STAT3抗体 | Abcam | ab32143 | |
| 兔抗STAT3抗体 | Abcam | ab68153 | |
| 小鼠抗JAK1抗体 | Proteintech | 66466-1-lg | |
| 兔抗泛素抗体 | Proteintech | 10201-2-AP | |
| 兔抗GAPDH抗体 | Abcam | ab181602 | |
| 山羊抗小鼠IgG H&L (HRP) | Abcam | ab205719 | |
| 山羊抗兔IgG H&L (HRP) | Abcam | ab6721 | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A/G琼脂糖珠 | Santa Cruz Biotechnology | -- |
| Triton X-100 | Beyotime | -- | |
| 抗Flag M2磁珠 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 抗HA磁珠 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 3×Flag肽 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 3×HA肽 | MCE | -- | |
| IgG抗体 | Abcam | ab172730 | |
| 免疫荧光 | 山羊抗兔IgG H&L (FITC) | Abcam | ab6717 |
| 山羊抗小鼠IgG H&L(Alexa Fluor 555) | Abcam | ab150118 | |
| DAPI | Beyotime | -- | |
| 抗荧光淬灭封片剂 | Beyotime | -- | |
| 荧光显微镜 | Carl Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本 | 脓毒症患者和健康对照的纳入标准(Sepsis 3.0定义,年龄≥18,采样时间≤24小时,排除标准等) 阅读提示:Methods 2.2 Clinical Samples |
| 动物模型 | 小鼠品系、性别、年龄、体重;CLP具体操作(盲肠结扎位置、穿刺次数、针头大小);分组及样本量;AAV9-shRNA注射剂量和时间 阅读提示:Methods 2.4、2.5 |
| 细胞模型 | HPMECs来源及培养条件;LPS浓度(100 ng/mL)和处理时间(4小时);转染试剂(Lipofectamine 3000)和转染时间(48小时) 阅读提示:Methods 2.11、2.12 |
| 蛋白稳定性与泛素化 | CHX浓度(100 μg/mL)及时间点(0、3、6、9小时);泛素化检测所用抗体 阅读提示:Methods 2.19;Results 3.3 |
| 通路验证 | oe-PRMT5和sh-JAK1的转染;LPS处理条件;Western blot检测JAK1、p-STAT3、STAT3 阅读提示:Methods 2.12、2.16;Results 3.4 |