临床标本自噬活性评估
确定自噬活性与膀胱癌分级、分期及患者生存率的关系
对289例膀胱癌患者标本进行IHC染色,检测Atg5和p62表达,并分析57例有生存数据患者的生存率
Autophagy Plays a Suppressive Role in Bladder Tumor Formation in an Orthotopic Mouse Model and Bladder Cancer Patient Specimens.
包含细胞实验(MTT、流式凋亡、Western blot)、原位小鼠模型(IVIS/MUI监测、药物处理)、患者标本IHC和生存分析等至少两个独立证据层级,并有功能验证(Atg5敲低)和机制验证(凋亡通路)。
MB49小鼠膀胱癌细胞系 MB49-Luc原位膀胱肿瘤小鼠模型 膀胱癌患者组织标本
细胞系:MB49、MB49-Luc、MB49LucshAtg5、MB49LucshLacZ 小鼠品系:雌性C57BL/6,5-6周龄 药物处理:胺碘酮1.5 mg/50 μL、MMC 100 μg/50 μL,膀胱内灌注,每隔3天 处理时间:原位模型从第4天开始至第19天,第21天处死;shRNA模型从第7天开始至第33天 对照组:PBS+40% DMSO(vehicle)以及shLacZ对照
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定自噬活性与膀胱癌分级、分期及患者生存率的关系
对289例膀胱癌患者标本进行IHC染色,检测Atg5和p62表达,并分析57例有生存数据患者的生存率
建立稳定表达荧光素酶的MB49细胞系及敲低Atg5的细胞系,用于体外和体内实验
构建MB49-Luc、MB49LucshAtg5、MB49LucshLacZ细胞系,并用胺碘酮处理检测自噬和凋亡
验证胺碘酮和MMC对膀胱肿瘤形成的影响及副作用
将MB49-Luc细胞植入小鼠膀胱,经膀胱内灌注胺碘酮或MMC,通过IVIS和MUI监测肿瘤形成,并测量膀胱重量、体重、血液指标等
确定胺碘酮的抗肿瘤作用是否依赖于自噬及凋亡通路
沉默Atg5后评估肿瘤生长、细胞增殖和凋亡,并检测caspase-3、PARP1等蛋白表达
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | GIBCO | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| G418 | Merck | -- | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Elabscience | -- |
| 细胞毒性检测 | MTT | Sigma | -- |
| 动物实验 | Zoletil 50 | Virbac | -- |
| Rompun | Bayer | -- | |
| 硝酸银 | -- | -- | |
| 药物处理 | 胺碘酮 | Sigma | -- |
| 蛋白质印迹 | 硝酸纤维素膜 | Millipore | -- |
| 抗β-actin抗体 | Sigma | -- | |
| 抗LC3抗体 | MBL International | -- | |
| 抗Atg5抗体 | Cell Signaling | -- | |
| 抗caspase 3抗体 | GeneTex | -- | |
| 抗PARP1抗体 | GeneTex | -- | |
| 抗p62抗体 | MBL | -- | |
| 免疫组织化学 | 抗Ki67抗体 | Spring Bioscience | -- |
| 抗Atg5抗体 | Abcam | -- | |
| 抗p62抗体 | MBL International | -- | |
| 抗LC3抗体 | MBL International | -- | |
| 辣根过氧化物酶标记的二抗 | Dako | -- | |
| AEC底物 | Dako | -- | |
| 体内成像 | D-荧光素 | Perkin Elmer | -- |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | -- | -- |
| Alexa Fluor 568 | Invitrogen | A11004 | |
| Hoechst染料 | Sigma | -- | |
| 高效液相色谱 | Agilent-1200 Infinity系统 | Agilent Technologies | -- |
| Pursuit 5 C18色谱柱 | Agilent Technologies | -- | |
| MetaGuard保护柱 | Agilent Technologies | -- | |
| 动物实验 | BP-2000血压分析系统 | Visitech Systems | -- |
| 微超声成像 | Vevo770高频超声系统 | Visual Sonics | -- |
| 细胞培养 | shRNA慢病毒 | -- | -- |
| 自噬检测 | 氯喹 | -- | -- |
| ptfLC3质粒 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞模型 | 确认MB49细胞株来源和培养条件,包括培养基、血清浓度、抗生素筛选浓度等 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.1 |
| 原位动物模型 | 小鼠品系、性别、年龄、细胞植入数量、麻醉剂组合及剂量、膀胱损伤处理(AgNO3浓度和体积)、细胞在膀胱内保留时间 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.6 |
| 药物处理 | 胺碘酮和MMC的剂量(1.5 mg/50 μL和100 μg/50 μL)、溶剂(PBS+40% DMSO)、给药途径(膀胱内灌注)、给药频率(每3天一次)和持续时间(第4-19天或第7-33天) 阅读提示:Materials and Methods, Section 2.6 和 Results, Section 3.2 |
| 自噬验证 | 自噬标记物(LC3、Atg5、p62)的检测方法(Western blot、IHC)、Atg5敲低效率、自噬流阻断(CQ浓度和时间) 阅读提示:Materials and Methods, Sections 2.7, 2.8, 3.4 |
| 监测和终点分析 | IVIS和MUI的具体参数、肿瘤体积测量方法、处死时间点、样本采集(膀胱重量、体积,血液指标) 阅读提示:Materials and Methods, Sections 2.9, 2.13, Results, Section 3.2 |