生物信息学预测与蛋白结构评估
评估候选蛋白的理化性质、溶解度、抗原性、免疫原性、致敏性和毒性。
使用ProtParam、Protein-Sol、ANTIGENpro、IEDB等服务器预测蛋白特性;使用AlphaFold2构建3D结构,Ramachandran图和ProSA验证。
The subunit vaccine of Lumpy skin disease virus elicits significant humoral and cell-mediated immune responses in mice.
包括原核表达、纯化、免疫小鼠、ELISA、中和试验、ELISpot、流式细胞术、qPCR等,但缺少攻毒保护实验等体内功能验证,未进行牛体实验。
BALB/c小鼠
小鼠品系:BALB/c,6周龄雌性SPF级 免疫剂量:100μg蛋白/只,皮下注射 免疫方案:第0天和14天共免疫两次 使用完全弗氏佐剂和不完全弗氏佐剂 ELISA检测:不同抗原包被浓度、血清稀释度和二抗稀释度需优化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估候选蛋白的理化性质、溶解度、抗原性、免疫原性、致敏性和毒性。
使用ProtParam、Protein-Sol、ANTIGENpro、IEDB等服务器预测蛋白特性;使用AlphaFold2构建3D结构,Ramachandran图和ProSA验证。
在大肠杆菌中表达并纯化LSDV ORF073、ORF075、ORF090、ORF110蛋白。
基因合成并克隆至pCold-II载体,转化BL21(DE3)菌株,IPTG诱导表达,纯化后SDS-PAGE和Western blot验证。
评估四种蛋白亚单位疫苗在小鼠中诱导的体液免疫应答。
将纯化蛋白与佐剂混合免疫BALB/c小鼠,定期采血,用ELISA检测IgG、IgG1、IgG2a抗体水平,计算IgG2a/IgG1比值,并检测中和抗体。
评估疫苗诱导的T细胞免疫应答。
分离免疫小鼠脾细胞,用ELISpot检测IFN-γ分泌,流式细胞术分析CD4+和CD8+ T细胞比例。
检测脾脏中免疫相关细胞因子(IL-4、IL-6、TNF-α、IL-10)的表达水平。
提取脾脏RNA,qRT-PCR检测细胞因子mRNA表达,以GAPDH为内参,用2^-ΔΔCt法计算相对表达量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白表达 | pCold-II载体 | Tsingke Biotechnology | -- |
| 蛋白诱导表达 | 异丙基硫代半乳糖苷 | -- | -- |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白质定量试剂盒 | Solarbio | -- |
| Western blot | 小鼠抗His标签单克隆抗体 | Proteintech | -- |
| 山羊抗小鼠IgG-HRP二抗 | Proteintech | -- | |
| 免疫佐剂 | 完全弗氏佐剂 | Sigma | -- |
| 不完全弗氏佐剂 | Sigma | -- | |
| ELISA | HRP标记的山羊抗小鼠IgG | Proteintech | -- |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG1 | Proteintech | -- | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG2a | Proteintech | -- | |
| 淋巴细胞分离 | 小鼠脾淋巴细胞分离试剂盒 | TBD | -- |
| ELISpot | 小鼠IFN-γ酶联免疫斑点检测试剂盒 | MABTECH | -- |
| 流式细胞术 | FITC标记的抗小鼠CD4抗体 | BioLegend | -- |
| PE标记的抗小鼠CD8抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗小鼠CD16/32抗体 | Elabscience | -- | |
| 中和试验 | MDBK细胞 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 重组蛋白表达 | 表达条件:0.5 mM IPTG,16°C,20h 阅读提示:详见Materials and methods 2.4 |
| 小鼠免疫 | 小鼠品系、年龄、性别;免疫剂量、途径、时间间隔 阅读提示:详见Materials and methods 2.5 |
| ELISA检测 | 抗原包被浓度、血清稀释度、二抗稀释度需优化 阅读提示:详见Materials and methods 2.6 |
| ELISpot检测 | 脾细胞数、刺激抗原浓度 阅读提示:详见Materials and methods 2.9 |
| 流式细胞术 | 抗体用量、染色时间、洗涤次数 阅读提示:详见Materials and methods 2.10 |