构建人表皮生长因子受体2相关基因风险模型预测乳腺癌预后

本研究旨在构建人表皮生长因子受体2（HER2）相关基因风险模型以预测乳腺癌预后。从癌症基因组图谱数据库提取基因表达和临床随访数据，同时从基因表达综合数据库获取GSE7390数据集。进行预后和临床特征分析。此外，筛选HER2阴性和阳性组之间的差异表达基因，然后进行富集分析。随后，建立预后模型，并使用列线图预测预后。此外，分析风险评分与免疫的关联，并进行单细胞分析。接下来，通过逆转录定量PCR鉴定关键基因。结果显示，HER2与乳腺癌的雌激素受体状态、孕激素受体状态、N分期、美国癌症联合委员会分期、突变计数和肿瘤突变负荷显著相关。AS601245、AP.24534和roscovitine是风险组间敏感性差异最大的前三种化疗药物。共筛选出HER2阴性和阳性组之间的251个差异表达基因，发现它们显著参与京都基因与基因组百科全书的雌激素信号通路、PI3K-AKT信号通路和化学致癌-受体激活通路。构建了八个预后基因模型，发现高风险组患者的生存时间显著短于低风险组。包含风险组和临床病理特征的列线图显示出强大的预测能力和高准确性。RT-qPCR结果表明，电子转移黄素蛋白亚基α、Rap鸟嘌呤核苷酸交换因子样1、角蛋白7、分化簇24、富含脯氨酸15样、花生四烯酸15-脂氧合酶B型、ELOVL脂肪酸延长酶2和C-X-C基序趋化因子配体9的表达与生物信息学分析结果一致。总之，本研究开发的HER2相关风险模型和列线图在预测患者生存方面表现出高准确性。