动物模型建立与分组
建立化疗诱导的病理性卵巢衰老模型和自然衰老模型,并设置对照组,以比较不同衰老类型。
使用8周龄雌性C57BL/6小鼠,腹腔注射30 mg/kg白消安和120 mg/kg环磷酰胺(溶解于DMSO)建立CH组;采用18月龄小鼠作为OLD组;对照组注射DMSO。
Quantitative proteomic analysis of pathological and physiological ovarian aging: model evaluation, molecular mechanisms, and identification of early biomarkers and therapeutic targets.
包含动物模型建立、组织学评估、激素检测、蛋白质组学分析及qPCR验证等多个实验层级,但缺乏功能实验和临床样本验证,整体实验完整度中等。
C57BL/6小鼠化疗诱导卵巢衰老模型(CH组) C57BL/6小鼠自然衰老模型(OLD组) C57BL/6小鼠正常对照(CT组)
CH组使用8周龄雌性C57BL/6小鼠,腹腔注射30 mg/kg白消安和120 mg/kg环磷酰胺(溶解于DMSO)诱导;OLD组使用18月龄小鼠;CT组注射DMSO。 造模21天后取卵巢,进行H&E染色和卵泡计数。 通过ELISA检测血清FSH、E2和AMH水平。 蛋白质组学分析使用LC-MS/MS(timsTOF Pro),LFQ定量,差异蛋白筛选标准为P<0.05且CV<0.1。 qPCR验证7个关键基因(pbk, sdhd, Gsta3, Gstm6, Nlrp5, Nlrp4f, Nlrp14)。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立化疗诱导的病理性卵巢衰老模型和自然衰老模型,并设置对照组,以比较不同衰老类型。
使用8周龄雌性C57BL/6小鼠,腹腔注射30 mg/kg白消安和120 mg/kg环磷酰胺(溶解于DMSO)建立CH组;采用18月龄小鼠作为OLD组;对照组注射DMSO。
评估小鼠整体衰老表型和动情周期变化。
每日观察小鼠毛色、饮食活动等,并收集阴道上皮细胞进行Gram染色,显微镜下评估动情周期。
评估卵巢组织学变化和卵泡数量。
造模21天后处死小鼠,取卵巢,固定、包埋、切片(5 μm),H&E染色,在显微镜下观察形态并计数各级卵泡。
通过ELISA检测血清FSH、E2和AMH水平,评估卵巢内分泌功能。
取血清样本,使用ELISA试剂盒(Elabscience)检测FSH、E2和AMH,在450 nm处读取吸光度。
获得卵巢组织蛋白质表达谱,进行定量蛋白质组学分析。
卵巢组织液氮研磨,裂解、超声、离心提取蛋白,TCA沉淀,胰酶酶解,肽段经NanoElute液相分离,timsTOF Pro质谱仪PASEF模式分析。
鉴定差异表达蛋白,进行功能注释、通路富集和蛋白质相互作用网络分析,以揭示分子机制和潜在靶点。
使用MaxQuant提取LFQ强度,进行归一化;通过PCA、Pearson相关、RSD评估数据质量;筛选差异蛋白(P<0.05,CV<0.1),进行GO/KEGG/WikiPathways富集;构建PPI网络(STRING数据库,置信度>0.4);利用Metascape进行共享差异蛋白富集分析。
验证蛋白质组学鉴定的关键靶基因在mRNA水平的表达变化。
对筛选出的7个关键基因(PBK、SDHD、GSTA3、GSTM6、NLRP5、NLRP4F、NLRP14)设计引物,通过qPCR检测其在各组的表达水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型建立 | 白消安 | Sigma-Aldrich | B2635-10G |
| 环磷酰胺 | Sigma-Aldrich | C0768-1 | |
| 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | DH105-2 | |
| 血清激素检测 | ELISA试剂盒 | Elabscience | -- |
| 蛋白质提取 | 裂解缓冲液 | -- | -- |
| TEAB缓冲液 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶 | -- | -- | |
| 二硫苏糖醇 | -- | -- | |
| LC-MS/MS | 纳升超高效液相色谱系统 | -- | -- |
| timsTOF Pro质谱仪 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | CH组:8周龄雌性C57BL/6小鼠,腹腔注射30 mg/kg白消安和120 mg/kg环磷酰胺(溶解于DMSO);OLD组:18月龄;CT组:注射DMSO。 阅读提示:Materials and methods: Animal model establishment |
| 卵巢形态学评估 | 造模后21天取材,固定于4%多聚甲醛,石蜡切片厚度5 μm,H&E染色,选取最大切面及连续5个切面进行卵泡计数。 阅读提示:Materials and methods: Ovarian morphological assessment and follicle counting; Figure 2 |
| 血清激素检测 | 使用ELISA试剂盒(Elabscience)检测FSH、E2和AMH,波长450 nm。 阅读提示:Materials and methods: Serum hormone detection via ELISA; Figure 2C |
| 蛋白质组学分析 | 蛋白提取、酶解、LC-MS/MS参数(梯度、流速、电压、扫描范围等),差异蛋白筛选标准(P<0.05,CV<0.1)。 阅读提示:Materials and methods: Protein extraction and trypsin digestion, LC-MS/MS analysis, Protein intensity Processing and normalization |
| 生物信息学分析 | PPI网络构建使用STRING数据库v11.5,置信度>0.4;Metascape富集分析参数(P<0.01,富集因子>1.5,至少3个基因)。 阅读提示:Materials and methods: Protein-protein interaction network analysis, Shared differential protein screening |
| qPCR验证 | 引物序列见表2,验证基因包括PBK、SDHD、GSTA3、GSTM6、NLRP5、NLRP4F、NLRP14。 阅读提示:Materials and methods: Results: Biomarker prediction, key target identification, and qPCR validation; Table 2 |